Urška Kotnik

1. KOTNIK, Urška. Določanje novih kandidatnih genov za bolezni z analizo povezav med interaktomom in fenomom na primeru RASopatij : [raziskovalno delo]. Ljubljana: [U. Pevec], 2014. VIII, 40 f., [47] f. pril., ilustr. [COBISS.SI-ID 3436424]

2. KOTNIK, Urška, KUNEJ, Tanja. Določanje novih kandidatnih genov za bolezni z uporabo analize povezav med interaktomom in fenomom na primeru RASopatij = Identification of new candidate genes for diseases using association analysis between interactome and phenome in the case of rasopathies. V: KUNEJ, Tanja (ur.), ZORC, Minja (ur.). iTIME brainstorming : zbornik prispevkov = proceedings. 3. Simpozij raziskovalne mreže Integratomics TIME Domžale, 12. 9. 2014. Domžale: Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za zootehniko, 2014. Str. 9-12. [COBISS.SI-ID 3438216]

3. ROZMAN, Neva, GORŠEK, Blaž, JEVŠINEK SKOK, Daša, KOTNIK, Urška, KUNEJ, Tanja. RASopatije kot model za študije povezav med interaktomom in fenomom = RASopathies as a model to study associations between interactome and phenome. V: KUNEJ, Tanja (ur.), OBŠTETER, Jana (ur.), JEVŠINEK SKOK, Daša (ur.). iTIME brainstorming : zbornik prispevkov = proceedings. 2. Simpozij raziskovalne mreže Integratomics TIME Domžale, 19. 12. 2013. Domžale: Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za zootehniko, 2014. Str. 15-18, ilustr. [COBISS.SI-ID 3385480]

4. KOTNIK, Urška. RASopatije kot model za študije povezav med interaktomom in fenomom : diplomski seminar = RASopathies as a model to study associations between interactome and phenome : B. Sc. thesis. Ljubljana: [U. Pevec], 2014. VI, 20 f., ilustr. Biotehniška fakulteta, Študij biotehnologije, Diplomski seminar univerzitetni študij - 1. stopnja. [COBISS.SI-ID 7962489]

5. KOŠENINA, Sara, KOTNIK, Urška, TROŠT, Nina, HEVIR-KENE, Neli, LANIŠNIK-RIŽNER, Tea, KOMEL, Radovan, DEBELJAK, Nataša. Characterization of erythropoietin and estrogen receptor proteins in breast cancer cell lines. V: AČIMOVIČ, Jure (ur.), et al. Book of abstracts. 10th CFGBC Symposium with ISBE and CASyM workshops From functional genomics to systems biology and systems medicine & Hands-on tutorial systems biology/medicine, Ljubljana, June 30 - July 3, 2015. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2015. Str. 26. ISBN 978-961-267-092-4. [COBISS.SI-ID 32057049]

6. KOTNIK, Urška, ROZMAN, Neva, GORŠEK, Blaž, KUNEJ, Tanja. RASopathies : genome, interactome, and phenome level = RASopatije : genom, interaktom in fenom. V: TRAVEN, Eva (ur.), ZORC, Minja (ur.), KUNEJ, Tanja (ur.). iTIME brainstorming : zbornik prispevkov = proceedings. 4. Simpozij raziskovalne mreže Integromics TIME Domžale, 10. 7. 2015. Domžale: Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za zootehniko, 2015. Str. 35-39, ilustr. [COBISS.SI-ID 3605896]

7. KOTNIK, Urška, CIGOJ, Mateja, DEBELJAK, Nataša. Hormonski receptorji in njihov vpliv na lastnosti raka dojke. V: BAVEC, Aljoša (ur.), et al. BIOmolekularec.si : Dan biomolekularnih znanosti : zbornik povzetkov : Ljubljana, 22. september 2016. BIOmolekularec.si [tudi] Dan biomolekularnih znanosti, Ljubljana, 22. september 2016. Ljubljana: Slovensko biokemijsko društvo, 2016. Str. 14. ISBN 978-961-93879-2-4. http://biomolekularec.si/zbornik16.pdf. [COBISS.SI-ID 6173356]

8. CIGOJ, Mateja, KOTNIK, Urška, KOŠENINA, Sara, KOMEL, Radovan, DEBELJAK, Nataša. Normalization of erythropietin and estrogen receptors detection in breast cancer cell lines. V: URLEP, Žiga (ur.), JUVAN, Peter (ur.). Book of abstracts. Elixir-si Launch & 11th CFGBC Symposium Data for Life, Ljubljana, September 20 - September 21, 2016. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2016. Str. 34. ISBN 978-961-267-113-6. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/2016data4life/abstracts/Book_of_Abstracts.pdf. [COBISS.SI-ID 32831705]

9. KOTNIK, Urška, ROZMAN, Neva, GORŠEK, Blaž, KUNEJ, Tanja. RASopathies : presentation at the genome, interactome, and phenome levels. Molecular syndromology. 2016, vol. 7, no. 2, str. 72-79, ilustr. ISSN 1661-8769. http://www.karger.com/Article/Abstract/445733, DOI: 10.1159/000445733. [COBISS.SI-ID 3722888]

10. KOTNIK, Urška, CIGOJ, Mateja, KOŠENINA, Sara, KOMEL, Radovan, DEBELJAK, Nataša. Receptor characterization in tamoxifen resistant breast cancer cell line model. V: Abstract book : 1st International Conference Molecular Life of STEM Cells, MLSC 2016, 30.09.2016 - 01.10. 2016 Ljubljana, Slovenia : post transctriptional regulation and (epi)genomic engineering in STEM cells. München: HelmholtzZentrum, 2016. Str. 58-59. https://www.helmholtz-helena.de/news-events/news/news/article/36522/index.html. [COBISS.SI-ID 6173612]

11. CIGOJ, Mateja, PIKŠ, Katja, LEBAR, Blaž, KOTNIK, Urška, FECKOVÁ, Barbora, SOLÁR, Peter, KOMEL, Radovan, DEBELJAK, Nataša. Characterization of erythropoietin and estrogen receptors in breast cancer cell lines by western, far-western and double blotting. V: GORIČAR, Katja (ur.), HUDLER, Petra (ur.). Book of abstracts = Zbornik povzetkov. 12th Meeting of the Slovenian Biochemical Society with International Participation = 12. srečanje Slovenskega biokemijskega društva z mednarodno udeležbo, Bled 20 - 23 september 2017. Ljubljana: Slovenian Biochemical Society, 2017. Str. 124. ISBN 978-961-93879-4-8. [COBISS.SI-ID 33514201]

12. KOTNIK, Urška. Vloga eritropoetinskega receptorja pri rezistenci na tamoksifen : magistrsko delo. Ljubljana: [U. Kotnik], 2017. 61 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 1537490883]

13. KLEMENC-KETIŠ, Zalika, KOTNIK, Urška, SELIČ-ZUPANČIČ, Polona, PETERLIN, Borut. Determining risk for diseases with genetic component using family history. V: 23rd World conference of family doctors : together we own the future : abstract book, 22-27 November 2021 : oral presentation. [S. l.: Wonca, 2021]. Str. [87]. [COBISS.SI-ID 88798723]

14. KOTNIK, Urška, PETERLIN, Borut, LOVREČIĆ, Luca. Identification of women at risk for hereditary breast and ovarian cancer in a sample of 1000 Slovenian women guidelines : a comparison of guidelines. BMC cancer. 2021, vol. 21, str. 1-9. ISSN 1471-2407. https://bmccancer.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12885-021-08400-8, DOI: 10.1186/s12885-021-08400-8. [COBISS.SI-ID 69262339]

15. KOTNIK, Urška. A case report: Pheochromocytoma a part of clinical presentation of CHEK2 : lecture at the 4th Course in Hereditary Cancer Genetics Bertinoro, Italy, 20-23 September 2022. [COBISS.SI-ID 129715459]

16. KOTNIK, Urška (avtor, korespondenčni avtor), MAVER, Aleš, PETERLIN, Borut, LOVREČIĆ, Luca. Assessment of pathogenic variation in gynecologic cancer genes in a national cohort. Scientific reports. 2023, vol. 13, iss. 1, str. 1-9, ilustr. ISSN 2045-2322. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37002323/, DOI: 10.1038/s41598-023-32397-8. [COBISS.SI-ID 150620163]

17. PETERLIN, Borut, KOTNIK, Urška. Clinical genetics in gynecologic cancers. V: AYHAN, Ali (ur.), et al. Textbook of gynaecological oncology. Platinum ed. Ankara: Güneş Publishing, cop. 2023. Str. 77-83, ilustr. ISBN 978-975-277-958-7. [COBISS.SI-ID 180029955]

18. KOTNIK, Urška. Identifikacija žensk s povečano ogroženostjo za dedne oblike ginekoloških rakov : doktorska disertacija = Identification of women at increased risk for hereditary gynecologic cancer : doctoral dissertation. Ljubljana: [U. Kotnik], 2023. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (XII, 102, [22] str.), ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 179580675]

19. KOTNIK, Urška, PETERLIN, Borut, LOVREČIĆ, Luca. Pathogenic BRCA1/2 variation in a large Slovenian non-cancer cohort : a cohort study. V: Abstracts from the 56th European Society of Human Genetics (ESHG) Conference : e-posters : Glasgow, Scotland, United Kingdom June 10-13, 2023. 56th European Society of Human Genetics (ESHG) Conference, Glasgow, Scotland, United Kingdom, June 10-13, 2023. London: Nature Publishing Group, 2024. Suppl. 1, vol. 32, str. 349–795. European journal of human genetics (Online), Vol. 32, suppl. 1. ISSN 1476-5438. https://www.nature.com/articles/s41431-023-01482-x, DOI: 10.1038/s41431-023-01482-x. [COBISS.SI-ID 187344899]

20. KOTNIK, Urška, MAVER, Aleš, PETERLIN, Borut, LOVREČIĆ, Luca. Patogene različice v genih, povezanih z dednimi oblikami ginekoloških rakov v slovenski populaciji. V: BABIĆ BOŽOVIĆ, Ivana (ur.), LOVREČIĆ, Luca (ur.). Novosti na področju redkih bolezni v Sloveniji : 8. simpozij slovenske medicinske genetike : knjiga povzetkov : UKC Ljubljana, 10. november 2023. Ljubljana: Združenje za medicinsko genetiko, Slovensko zdravniško društvo, 2023. Str. 33-34, ilustr. ISBN 978-961-93050-6-5. https://www.szd.si/wp-content/uploads/2023/11/szd-strokovna-podrocja-zdruzenje-za-medicinsko-genetiko-8-simpozij.pdf. [COBISS.SI-ID 186830595]

21. KOVANDA, Anja, KOTNIK, Urška, LONČAR, Maja, HODŽIĆ, Alenka, LOVREČIĆ, Luca, MAVER, Aleš, MILJANOVIĆ, Olivera, PETERLIN, Borut. Value of optical genome mapping for diagnostics of rare diseases. BJMG : Balkan journal of medical genetics. 2023, vol. 26, iss. suppl., str. 65. ISSN 1311-0160. [COBISS.SI-ID 185641219]

22. DOLANC, Maja, KOTNIK, Urška, PETERLIN, Borut, LOVREČIĆ, Luca. Further exploration of cardiac channelopathy and cardiomyopathy genes in stillbirth. Prenatal diagnosis. 2024, letn. 44, št. 9, str. 1062-1072. ISSN 0197-3851. https://obgyn.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/pd.6616, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1002/pd.6616. [COBISS.SI-ID 202250499]