Miha Moškon

1. MOŠKON, Miha. Mehki nagon hranjenja pri simulaciji letenja ptic v jatah. V: ZAJC, Baldomir (ur.), TROST, Andrej (ur.). Zbornik petnajste mednarodne Elektrotehniške in računalniške konference ERK 2006, 25. - 27. september 2006, Portorož, Slovenija. Ljubljana: IEEE Region 8, Slovenska sekcija IEEE, 2006. Zv. b, str. 383-384, ilustr. Zbornik ... Elektrotehniške in računalniške konference ERK ... ISSN 1581-4572. [COBISS.SI-ID 5628244]

2. MOŠKON, Miha. Mehki nagon hranjenja pri simulaciji letenja ptic v jati : delo je prirpravljeno v skladu s Pravilnikom o podeljevanju Prešernovih nagrad študentom, pod mentorstvom prof. dr. Nikolaja Zimica in somentorstvom as. dr. Iztoka Lebarja Bajca. Ljubljana: [M. Moškon], 2006. VIII, 42 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/3715/. [COBISS.SI-ID 5629780]
nagrada: Fakultetna Prešernova nagrada

3. MOŠKON, Miha, HEPPNER, Frank H., MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, LEBAR BAJEC, Iztok. Fuzzy model of bird flock foraging behavior. V: ZUPANČIČ, Borut (ur.), KARBA, Rihard (ur.), BLAŽIČ, Sašo (ur.). EUROSIM 2007 : proceedings of the 6th EUROSIM Congress on Modelling and Simulation, [9-13 September, 2007, Ljubljana, Slovenia]. Vol. 1, Book of abstracts. Vienna: Argesim, cop. 2007. Str. 266, portret. ISBN 978-3-901608-32-2, ISBN 3-901608-32-X. [COBISS.SI-ID 6063700]

4. MOŠKON, Miha, HEPPNER, Frank H., MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, LEBAR BAJEC, Iztok. Fuzzy model of bird flock foraging behavior. V: ZUPANČIČ, Borut (ur.), KARBA, Rihard (ur.), BLAŽIČ, Sašo (ur.). EUROSIM 2007 : proceedings of the 6th EUROSIM Congress on Modelling and Simulation, 9-13 September 2007, Ljubljana, Slovenia. Vol. 2, Full papers. 6th EUROSIM Congress on Modelling and Simulation, Ljubljana, Slovenia, 9-13 September, 2007. Vienna: ARGESIM, cop. 2007. Str. 1-6, ilustr. ISBN 978-3-901608-32-2, ISBN 3-901608-32-X. [COBISS.SI-ID 6063444]

5. MOŠKON, Miha. Modeliranje iskanja izvora hrane v mehkem modelu za računalniško simulacijo letenja ptic v jati : diplomska naloga. Ljubljana: [M. Moškon], 2007. VIII, 45 str., ilustr. http://eprn.fri.uni-lj.si/20/. [COBISS.SI-ID 5825108]

6. ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, JAZBEC, Andrej, PEČAR, Primož, JANEŽ, Miha, MOŠKON, Miha, ČEHOVIN, Vitomir. Zasnova komunikacijskih protokolov za potrebe medicinskih aplikacij : zaključno poročilo o rezultatih raziskovalnega projekta v letu 2006/2007. Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko, Laboratorij za računalniške strukture in sisteme, 2007. 2 zv. [COBISS.SI-ID 6103892]

7. MOŠKON, Miha. Fuzzy logic applied to modelling of bird flock foraging behavior. Kharkiv: Polytechnic Institute, 23. 4. 2008. [COBISS.SI-ID 6459220]

8. ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, JAZBEC, Andrej, PEČAR, Primož, JANEŽ, Miha, MOŠKON, Miha, ČEHOVIN, Vitomir, VIRANT, Jernej. Programska oprema "Ujma" za reševanje logističnih problemov z mehko logiko v slovenski vojski. Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko, 2008. 1 optični disk (CD-ROM). [COBISS.SI-ID 6507348]

9. ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, JAZBEC, Andrej, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha, JANEŽ, Miha, ČEHOVIN, Vitomir. Quick-linkdown funkcionalnost : funkcijska specifikacija. Ljubljana: [Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2008. 13 f., ilustr. [COBISS.SI-ID 7732820]

10. ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha, ČEHOVIN, Vitomir. Sobivanje protokolov v redundančnih omrežjih : analiza delovanja. Ljubljana: [Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2008. 7 f., ilustr. [COBISS.SI-ID 7733332]

11. MRAZ, Miha, MAGDEVSKI, Zlatko, FICZKO, Jelena, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha, JANEŽ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok. Towards multistate nanocomputing : the implementation of a primitive fuzzy controller. V: AVIS, David (ur.), KOLLMITZER, Christian (ur.), OVCHINNIKOV, Victor (ur.). ICQNM 2008. Los Alamitos; Piscataway; Tokyo: IEEE Computer Society, cop. 2008. Str. 45-49, ilustr. ISBN 0-7695-3085-0, ISBN 978-0-7695-3085-7. [COBISS.SI-ID 6328660]

12. VIRANT, Jernej, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, JAZBEC, Andrej, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha, JANEŽ, Miha, ČEHOVIN, Vitomir, MEDEOT, Marino. Uporaba mehke logike na področju obrambe in vojaških veščin : novo znanje za starešine. Ljubljana: [Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2008. VI, 234 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 6500948]

13. ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, JAZBEC, Andrej, PEČAR, Primož, JANEŽ, Miha, MOŠKON, Miha, ČEHOVIN, Vitomir, VIRANT, Jernej. Vpeljava mehke logike v proces upravljanja obrambnega sistema : zaključno poročilo o rezultatih opravljenega raziskovalnega dela na projektu v okviru ciljnega raziskovalnega programa "Znanje za varnost in mir 2006-2010". [Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2008. 8 f. [COBISS.SI-ID 6501716]

14. MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, LEBAR BAJEC, Iztok, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha, ŠOBERL, Domen, JANEŽ, Miha, KOPRIVEC, Miran, VIZEC, Igor, TRATAR, Boštjan. Analiza zanesljivosti elektronskih komponent in tiskanin : analiza. [Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2009. 34 f., tabele. [COBISS.SI-ID 7528276]

15. ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha. EAPS protokol : funkcijska specifikacija. Ljubljana: [Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2009. 19 f., ilustr. [COBISS.SI-ID 7733588]

16. MOŠKON, Miha, AVBELJ, Monika, JERALA, Roman, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha. Model realizacije funkcionalnosti RS-pomnilne celice v biološkem sistemu = A model of the RS memory-cell realization in biological systems. Elektrotehniški vestnik. [Slovenska tiskana izd.]. 2009, letn. 76, št. 4, str. 223-228, ilustr. ISSN 0013-5852. Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 7445332]

17. ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha, ČEHOVIN, Vitomir. Redundančna priključitev EAPS obroča proti centralnemu obroču : design specifikacija. Ljubljana: [Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2009. 5 f. [COBISS.SI-ID 7733076]

18. MOŠKON, Miha, AVBELJ, Monika, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha. Toward in vivo digital synchronous sequential circuits. WSEAS Transactions on Circuits. Mar. 2009, vol. 8, no. 3, str. 301-310, ilustr. ISSN 1109-2734. [COBISS.SI-ID 7111764]

19. MOŠKON, Miha, AVBELJ, Monika, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha. Towards the realization of synchronous sequential biological circuits. V: MASTORAKIS, Nikos E. (ur.). Recent advances in mathematics and computers in biology and chemistry : proceedings of the 10th WSEAS International Conference on Mathematics and Computers in Biology and Chemistry (MCBC'09), Prague, Czech Republic, March 23-25, 2009. [S. l.]: WSEAS Press, cop. 2009. Str. 136-141, ilustr. Recent advances in biology and biomedicine. ISBN 978-960-474-062-8. ISSN 1790-5125. [COBISS.SI-ID 6998356]

20. ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha. Analiza standarda G.8302 Ethernet Ring Protection Switching : funkcijska specifikacija. Ljubljana: [Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2010. 6 f., ilustr. [COBISS.SI-ID 7734356]

21. KRIVIC, Jaka, JOGAN, Matjaž, LEONARDIS, Aleš, MOŠKON, Miha, ŠOBERL, Domen, ZIMIC, Nikolaj. Avtobusna postaja : demonstracija uporabe računalniškega vida v sistemu za mobilno interakcijo z urbanimi objekti. Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko, 1. 12. 2010. [COBISS.SI-ID 8098388]

22. ILC, Tina, LEBAR, Tina, STOŠICKI, Tjaša, TOMŠIČ, Nejc, TURNŠEK, Jernej, ŽNIDARIČ, Matej, BORDON, Jure, ČEŠNOVAR, Rok, PETRONI, Mattia, PUSTOSLEMŠEK, Rok. Competition team members : DNA coding beyond triplets : [grand prize winners at the International Genetically Engineered Machine competition-iGEM project 2010, Cambridge, Massachussets Institute of Technolog, November 2010]. 2010. http://2010.igem.org/Team:Slovenia. [COBISS.SI-ID 4757018]

23. MOŠKON, Miha. Hardware support for mobile vision. Varna: Technical University, 22-26 September 2010. [COBISS.SI-ID 8179284]

24. ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha. Redundantna priključitev perifernih plošč : design specifikacija. Ljubljana: [Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2010. 22 f., ilustr. [COBISS.SI-ID 7734100]

25. ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha. Selective Q-in-Q : design specifikacija. Ljubljana: [Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2010. 7 f., ilustr. [COBISS.SI-ID 7733844]

26. MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. Analyzing the information processing capabilities of gene expression based logic. V: ICCSIT2011 : proceedings. Danvers (MA): Institute of Electrical and Electronics Engineers, cop. 2011. Vol. 3, str. 297-300, ilustr. ISBN 978-1-61284-836-5, ISBN 978-1-61284-834-1. [COBISS.SI-ID 8416852]

27. ZIMIC, Nikolaj, LEBAR BAJEC, Iztok, ŠOBERL, Domen, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha. Arhitektura distribuirane inteligence v dostopovnem omrežju : zagotavljanje visoke razpoložljivosti : izbira redundančnega protokola na različnih nivojih omrežja. [Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2011. 56 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 10388052]

28. ZIMIC, Nikolaj, LEBAR BAJEC, Iztok, ŠOBERL, Domen, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha. Arhitektura distribuirane inteligence v dostopovnem omrežju : zagotavljanje visoke razpoložljivosti : rezultati študije visoko/redundančnih protokolov. [Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2011. 60 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 10388308]

29. MOŠKON, Miha. Finding optimal solutions of vaguely defined assignment problems. V: CHEN, Shaokang (ur.). Recent researches in applied computer and applied computational science. [S. l.]: WSEAS, cop. 2011. Str. 207-210, ilustr. ISBN 978-960-474-281-3. [COBISS.SI-ID 8244052]

30. KOLEV, Nikolay Stefanov, MOŠKON, Miha, SCOPCHANOV, Michael, ZIMIC, Nikolaj. Management system for mobile robots collaboration : report. Ljubljana: Faculty of Computer and Information Science; Varna: Faculty of Computing and Automation, 2011. 112 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 8906836]

31. MOŠKON, Miha. Metrike za vrednotenje primernosti bioloških sistemov kot procesnih gradnikov. V: ZAJC, Baldomir (ur.), TROST, Andrej (ur.). Zbornik dvajsete mednarodne Elektrotehniške in računalniške konference ERK 2011, 19.-21. september 2011, Portorož, Slovenija. Ljubljana: IEEE Region 8, Slovenska sekcija IEEE, 2011. Zv. b, str. 3-6, graf. prikazi. Zbornik ... Elektrotehniške in računalniške konference ERK ... ISSN 1581-4572. [COBISS.SI-ID 8613460]

32. MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. Modeling as the essential step in the construction of biological computer structures. International journal of information and education technology : IJIET. Aug. 2011, vol. 1, no. 3, str. 185-189, graf. prikazi. ISSN 2010-3689. http://www.ijiet.org/papers/30-A148.pdf. [COBISS.SI-ID 8578644]

33. ZIMIC, Nikolaj, LEBAR BAJEC, Iztok, ŠOBERL, Domen, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha. Remote mirroring : funkcijska specifikacija. [Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2011. 20 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 10387284]

34. MOŠKON, Miha. Solving the vaguely defined assignment problems. International journal of mathematical models and methods in applied sciences. 2011, vol. 5, no. 4, str. 773-780, ilustr. ISSN 1998-0140. http://www.naun.org/journals/m3as/20-498.pdf. [COBISS.SI-ID 8476244]

35. MEHMED, Ayhan, MOŠKON, Miha, SCOPCHANOV, Michael, ZIMIC, Nikolaj. Video surveilance with Beagle Board : report. Ljubljana: Faculty of Computer and Information Science; Varna: Faculty of Computing and Automation, 2011. 43 f., ilustr. [COBISS.SI-ID 8907348]

36. ŠOBERL, Domen, ZIMIC, Nikolaj, LEBAR BAJEC, Iztok, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha. Architecture of distributed intelligence in access network : providing high availability : detailed protocol specification on the level of network element. [Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2012. 62 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 10387796]

37. MOŠKON, Miha. Modeli in metrike dinamike preklopa v enostavnih bioloških sistemih za potrebe računalniških struktur prihodnosti : doktorska disertacija. Ljubljana: [M. Moškon], 2012. 1 optični disk (CD-ROM), ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/1804/, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 264646400]

38. MOŠKON, Miha. Modeli in metrike dinamike preklopa v enostavnih bioloških sistemih za potrebe računalniških struktur prihodnosti : doktorska disertacija. Ljubljana: [M. Moškon], 2012. X, 163 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/1804/, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 9388116]

39. BORDON, Jure, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. Modeling gene regulatory networks using Petri Nets. V: ZAJC, Baldomir (ur.), TROST, Andrej (ur.). Zbornik enaindvajsete mednarodne Elektrotehniške in računalniške konference ERK 2012, 17.-19. september 2012, Portorož, Slovenija. Ljubljana: IEEE Region 8, Slovenska sekcija IEEE, 2012. Zv. b, str. 43-46, graf. prikazi. Zbornik ... Elektrotehniške in računalniške konference ERK ... ISSN 1581-4572. [COBISS.SI-ID 9377108]

40. MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha. Modeliranje računalniških omrežij. 1. izd. Ljubljana: Založba FE in FRI, 2012. ISBN 978-961-6209-80-9. https://ucilnica.fri.uni-lj.si/course/view.php?id=209, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 265042944]

41. MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. Modelling and analysing the information processing capabilities of simple biological systems. Mathematical modelling and analysis. Sep. 2012, vol. 17, no. 4, str. 467-484, graf. prikazi. ISSN 1392-6292. http://inga.vgtu.lt/~art/. [COBISS.SI-ID 9330004]

42. PETRONI, Mattia, CANCIANI, Luigi, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha. A qualitative method for parameter estimation in gene regulatory networks using extended Kalman filtering. V: ZAJC, Baldomir (ur.), TROST, Andrej (ur.). Zbornik enaindvajsete mednarodne Elektrotehniške in računalniške konference ERK 2012, 17.-19. september 2012, Portorož, Slovenija. Ljubljana: IEEE Region 8, Slovenska sekcija IEEE, 2012. Zv. b, str. 39-42, ilustr. Zbornik ... Elektrotehniške in računalniške konference ERK ... ISSN 1581-4572. [COBISS.SI-ID 9376596]

43. ŠOBERL, Domen, ZIMIC, Nikolaj, LEBAR BAJEC, Iztok, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha. Remote mirroring : dizajn specifikacija. [Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2012. 28 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 10387028]

44. ŠOBERL, Domen, ZIMIC, Nikolaj, LEBAR BAJEC, Iztok, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha. Remote mirroring : študija izvedljivosti. [Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2012. 20 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 10386516]

45. ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, ŠOBERL, Domen, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha. Uvedba licenc in licenčne politike na segment dostopa : predlog licenčne arhitekture. [Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2012. 61 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 10387540]

46. MOŠKON, Miha. Analysis of fitness landscape investigation efficiency : predavanje na Institute of Systems and Synthetic Biology, University of Évry-Val-d'Essonne, 18. marec 2013. Évry, 2013. [COBISS.SI-ID 9786196]

47. MOŠKON, Miha, ZIMIC, Nikolaj, STRAŽAR, Martin, MRAZ, Miha. Comparison of selected performances of biological and electronic information processing structures. Przeglęad Elektrotechniczny. 2013, no. 2a, str. 165-169, ilustr. ISSN 0033-2097. http://pe.org.pl/abstract_pl.php?nid=7211. [COBISS.SI-ID 9649748]

48. MOŠKON, Miha. Extending the applicability of Phage-Assisted Continuous Evolution (PACE). Évry: Institute of Systems and Synthetic Biology, University of Évry-Val-d'Essonne, June 21th 2013. [COBISS.SI-ID 9935700]

49. PETRONI, Mattia, LEBAR BAJEC, Iztok, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, PAOLI, Daniela, TRAVERSO, Carlo Enrico. Glaucoma management system : a clinical report on 409 eyes, supported by a mobile software application for interactive assessing and guiding the diagnosis and treatment of Glaucoma. V: Abstract book. 5th World Glaucoma Congress, Vancouver, July 17-20, 2013. [S. l.]: World Glaucoma Association, 2013. Str. 1116-1117. http://www.worldglaucoma.org/WGC/WGC2013/content/pdf/WGC2013_Abstract_Book.pdf. [COBISS.SI-ID 10010452]

50. VUČKO, Dušan, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Hybrid discrete algorithm for the modelling of gene regulatory networks. Biosystems and information technology : BIT journal. Nov. 2013, vol. 2, no. 2, str. 32-36, ilustr. http://bit-journal.eu/publications/2013-11/bit_id_131001_vucko.pdf. [COBISS.SI-ID 10288980]

51. STRAŽAR, Martin. Odkrivanje znanja iz modela genskega regulatornega omrežja : delo je pripravljeno v skladu s Pravilnikom o podeljevanju Prešernovih nagrad študentom, pod mentorstvom prof. dr. Mihe Mraza in somentorstvom dr. Mihe Moškona. Ljubljana: [M. Stražar], 2013. IX, 77 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/3696/. [COBISS.SI-ID 10299476]

52. SOMRAK, Maja, MOŠKON, Miha, VUČKO, Dušan, PIRŠ, Boštjan, MRAZ, Miha, JERALA, Roman. Pharmacokinetic model for the evaluation of a proposed drug delivery system. V: TRDIN, Nejc (ur.), et al. Zbornik = Proceedings. 5. študentska konferenca Mednarodne podiplomske šole Jožefa Stefana = 5th Jožef Stefan International Postgraduate School Students Conference, 23. maj 2013, Ljubljana, Slovenija. Ljubljana: Mednarodna podiplomska šola Jožefa Stefana, 2013. Str. 189-198. ISBN 978-961-92871-5-6. [COBISS.SI-ID 26911783]

53. BORDON, Jure, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. Semi-quantitative modelling of biological systems with extended Fuzzy Petri nets. V: BALBO, Gianfranco (ur.), HEINER, Monika (ur.). Biological Processes & Petri Nets : proceedings. [S. l.]: CEUR-WS, 2013. Str. 22. CEUR workshop proceedings, vol. 988. ISSN 1613-0073. http://ceur-ws.org/Vol-988/bioppn2013-ceur-proceedings.pdf. [COBISS.SI-ID 9937748]

54. MOŠKON, Miha, NOVAK, Štefan, MEDEOT, Marino, LEBAR BAJEC, Iztok, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha. Solving the logistic problems with optimal resource assignment using fuzzy logic methods. Journal of advanced transportation. [Print ed.]. June 2013, vol. 47, no. 4, str. 447-460, ilustr. ISSN 0197-6729. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/atr.173/abstract, DOI: 10.1002/atr.173. [COBISS.SI-ID 8198740]

55. ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, DEMŠAR, Jure, BORDON, Jure, PETRONI, Mattia, MOŠKON, Miha, ŠOBERL, Domen. TMG Cloud : dokumentacija prototipa. Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko, 2013. 44 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 10376788]

56. ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, ŠOBERL, Domen, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha. xSTP : dizajn dokument. [Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2013. 40 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 10385748]

57. ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, ŠOBERL, Domen, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha. xSTP : funkcijska specifikacija. [Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2013. 21 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 10386004]

58. ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, ŠOBERL, Domen, PEČAR, Primož, MOŠKON, Miha. xSTP : testni scenariji. [Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko], 2013. 22 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 10385492]

59. STRAŽAR, Martin, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. An adaptive genetic algorithm for parameter estimation of biological oscillator models to achieve target quantitative system response. Natural computing. Mar. 2014, vol. 13, no. 1, str. 119-127, ilustr. ISSN 1567-7818. [COBISS.SI-ID 9950804]

60. GAZVODA, Silvo. Analiza delovanja računalniških omrežij s programskim orodjem CACTI : diplomsko delo. Ljubljana: [S. Gazvoda], 2014. 47 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/2750/, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 1536066243]

61. GULJA, Matjaž. Analiza računalniškega omrežja na primeru Dijaškega doma Tabor : diplomsko delo. Ljubljana: [M. Gulja], 2014. 54 str., graf. prikazi. http://eprints.fri.uni-lj.si/2761/, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 1536041923]

62. MOŠKON, Miha, BORDON, Jure, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, PETRONI, Mattia. Computational approaches in synthetic and systems biology. V: VALENTE, André Xavier C. N. (ur.). Recent advances in systems biology research. New York: Nova Science Publishers, 2014. Str. 131-156. Systems biology. ISBN 978-1-62948-737-3. https://www.novapublishers.com/catalog/product_info.php?products_id=47098. [COBISS.SI-ID 10489684]

63. JANŠA, Jure. Merjenje zmogljivosti in optimizacija navideznih naprav DataPower : diplomsko delo. Ljubljana: [J. Janša], 2014. 35 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/2762/, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 1536071875]

64. PETRONI, Mattia, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha. Multiscale stochastic simulation algorithm for complex gene regulatory networks. V: KOŠIR, Rok (ur.), JUVAN, Peter (ur.), PROSENC ZMRZLJAK, Uršula (ur.). From arrays and sequencing to understanding diseases : book of abstracts. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2014. Str. 46. ISBN 978-961-267-081-8. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/2014anniv9/AbstractBook_2014.pdf. [COBISS.SI-ID 1536027075]

65. PETRONI, Mattia, MOŠKON, Miha. A nested stochastic simulation algorithm for the gene regulatory network of the Epstein-Barr virus : 14th Workshop on Algorithms in Bioinformatics, September 9, 2014, Wroclaw, Poland. [COBISS.SI-ID 10763604]

66. BORDON, Jure, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. Overcoming unknown kinetic data for quantitative modelling of biological systems using fuzzy logic and Petri nets. V: HEINER, Monika (ur.). BioPPN 2014 : biological processes & Petri nets : proceedings of the 5th International Workshop on Biological Processes & Petri Nets, Tunis, Tunisia, June 23, 2014. [S. l.]: CEUR-WS, 2014. Str. 1-12, ilustr. CEUR workshop proceedings, vol. 1159. ISSN 1613-0073. http://ceur-ws.org/Vol-1159/paper2.pdf. [COBISS.SI-ID 10649940]

67. BORDON, Jure, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. Quantitative modelling of a 3-gene repressilator with uncertain kinetic data using fuzzy logic. V: KOŠIR, Rok (ur.), JUVAN, Peter (ur.), PROSENC ZMRZLJAK, Uršula (ur.). From arrays and sequencing to understanding diseases : book of abstracts. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2014. Str. 36. ISBN 978-961-267-081-8. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/2014anniv9/AbstractBook_2014.pdf. [COBISS.SI-ID 1536026819]

68. MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. Recent approaches for the modelling and computational design of biological information processing structures. V: KOŠIR, Rok (ur.), JUVAN, Peter (ur.), PROSENC ZMRZLJAK, Uršula (ur.). From arrays and sequencing to understanding diseases : book of abstracts. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2014. Str. 29. ISBN 978-961-267-081-8. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/2014anniv9/AbstractBook_2014.pdf. [COBISS.SI-ID 1536029123]

69. MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. Systematic approach to computational design of gene regulatory networks with information processing capabilities. IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics. [Print ed.]. 2014, vol. 11, no. 2, str. 431-440, ilustr. ISSN 1545-5963. http://ieeexplore.ieee.org/stamp/stamp.jsp?tp=&arnumber=6690102, DOI: 10.1109/TCBB.2013.2295792. [COBISS.SI-ID 10323028]

70. MENEGATTI, Ožbolt. Vzorčni primeri programskih rešitev za Raspberry Pi : diplomsko delo. Ljubljana: [O. Menegatti], 2014. 58 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/2751/, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 1536145603]

71. POLJANŠEK, Nejc. Vzpostavitev spletnega vmesnika za prikaz tenziomiografskih meritev : diplomsko delo. Ljubljana: [N. Poljanšek], 2014. 30 str., graf. prikazi. http://eprints.fri.uni-lj.si/2814/, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 1536038595]

72. CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, BELIČ, Aleš, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana. Application of SteatoNet to predict network disorder in cholesterol metabolism : Advanced Lecture Course on Computational Systems Biology, COMPSYSBIO, Aussois, France, April, 6-11 2015. [COBISS.SI-ID 1536283331]

73. BIZJAK, Manca, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Computational approaches for quantitative modeling of gene regulatory networks with multiple transcription factor DNA binding site repeats : Biology meets engineering and computer science, International Synthetic & Systems Biology Summer School, SSBSS'15, Taormina, Sicily, Italy, July 5-9, 2015. [COBISS.SI-ID 1536361411]

74. MOŠKON, Miha. Computational modelling, analysis and design of biological systems : lecture at Machine learning and systems biosciences, International workshop from 22 to 24 June 2015, Ljubljana. [COBISS.SI-ID 1536348099]

75. BIZJAK, Manca, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Explicit modelling of binding site clusters in NF-kB oscillatory response. V: AČIMOVIČ, Jure (ur.), et al. Book of abstracts. 10th CFGBC Symposium with ISBE and CASyM workshops From functional genomics to systems biology and systems medicine & Hands-on tutorial systems biology/medicine, Ljubljana, June 30 - July 3, 2015. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2015. Str. 20. ISBN 978-961-267-092-4. [COBISS.SI-ID 1536352451]

76. BORDON, Jure, MOŠKON, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha. Fuzzy logic as a computational tool for quantitative modelling of biological systems with uncertain kinetic data. IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics. [Print ed.]. 2015, vol. 12, no. 5, str. 1199-1205, ilustr. ISSN 1545-5963. http://ieeexplore.ieee.org/xpl/articleDetails.jsp?arnumber=7089201, DOI: 10.1109/TCBB.2015.2424424. [COBISS.SI-ID 1536282563]

77. ŠOBERL, Domen, ZIMIC, Nikolaj, LEONARDIS, Aleš, KRIVIC, Jaka, MOŠKON, Miha. Hardware implementation of FAST algorithm for mobile applications. Journal of signal processing systems for signal, image, and video technology. [Print ed.]. 2015, vol. 79, no. 3, str. 247-256, ilustr. ISSN 1939-8018. http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11265-013-0843-2, DOI: 10.1007/s11265-013-0843-2. [COBISS.SI-ID 10041428]

78. MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. Novel approaches for computational analysis of biological oscillators. V: AČIMOVIČ, Jure (ur.), et al. Book of abstracts. 10th CFGBC Symposium with ISBE and CASyM workshops From functional genomics to systems biology and systems medicine & Hands-on tutorial systems biology/medicine, Ljubljana, June 30 - July 3, 2015. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2015. Str. 7. ISBN 978-961-267-092-4. [COBISS.SI-ID 1536352195]

79. PETRONI, Mattia, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha. A parallel algorithm for stochastic multiscale simulation of gene regulatory networks with multiple binding sites. V: AČIMOVIČ, Jure (ur.), et al. Book of abstracts. 10th CFGBC Symposium with ISBE and CASyM workshops From functional genomics to systems biology and systems medicine & Hands-on tutorial systems biology/medicine, Ljubljana, June 30 - July 3, 2015. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2015. Str. 30. ISBN 978-961-267-092-4. [COBISS.SI-ID 1536353219]

80. PETRONI, Mattia, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha. Stochastic simulation algorithm for gene regulatory networks with multiple binding sites. Journal of computational biology. [Print ed.]. Mar. 2015, vol. 22, no. 3, str. 218-226, ilustr. ISSN 1066-5277. http://online.liebertpub.com/doi/10.1089/cmb.2014.0064, DOI: 10.1089/cmb.2014.0064. [COBISS.SI-ID 10671956]

81. CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, BELIČ, Aleš, ROZMAN, Damjana. Validation of SteatoNet for prediction the liver network disorders. V: KOS, Janko (ur.), POKLAR ULRIH, Nataša (ur.). Molecules of life : book of abstracts. FEBS3+ Meeting and 11th Meeting of the Slovenian Biochemical Society, September 16-19, 2015, Portorož, Slovenia. Ljubljana: Slovenian Biochemical Society, 2015. Str. 112. ISBN 978-961-93879-0-0. http://www.febs3.sbd.si/upload/docs/FEBS3plus_SBD_2015-Molecules_of_Life-BoA_web.pdf. [COBISS.SI-ID 1536497091]

82. CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, BELIČ, Aleš, ROZMAN, Damjana. Validation of SteatoNet for prediction the network disorder in liver in order of personalized medicine. V: AČIMOVIČ, Jure (ur.), et al. Book of abstracts. 10th CFGBC Symposium with ISBE and CASyM workshops From functional genomics to systems biology and systems medicine & Hands-on tutorial systems biology/medicine, Ljubljana, June 30 - July 3, 2015. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2015. Str. 22. ISBN 978-961-267-092-4. [COBISS.SI-ID 1536353475]

83. PUŠNIK, Žiga, STANOVNIK, Lidija, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Computational framework for global sensitivity analysis of high-dimensional and poorly connected parameter spaces. V: Synthetic biology for manufacturing in the bioeconomy : The IET/SynbiCITE Engineering Biology Conference 2016, 13 - 15 December 2016, IET London. Stevenage: The Institution of Engineering and Technology, cop. 2016. Str. 1-2, ilustr. ISBN 978-1-78561-361-6. [COBISS.SI-ID 1537319363]

84. BIZJAK, Manca, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha. Computational framework for modeling multiple noncooperative transcription factor binding and its application to the analysis of nuclear factor kappa B oscillatory response. Journal of computational biology. [Print ed.]. Dec. 2016, vol. 23, no. 12, str. 923-933, ilustr. ISSN 1066-5277. http://online.liebertpub.com/doi/abs/10.1089/cmb.2016.0065, DOI: 10.1089/cmb.2016.0065. [COBISS.SI-ID 1536999619]

85. ŠTULAR, Tanja, ŽEROVNIK MEKUČ, Manca, MRAZ, Miha, CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Computational framework for the analysis of biological oscillators and its application to p53-Mdm2 interaction. V: CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja (ur.), et al. Everything you always wanted to know about personalised medicine in clinical care. [S. l.: s. n], 2016. Str. 158. https://www.easym.eu/lw_resource/datapool/_items/item_59/easym_2016_programme_brochure_protected.pdf. [COBISS.SI-ID 1537254851]

86. STANOVNIK, Lidija, PUŠNIK, Žiga, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Design of synchronous transcription based biological memory. V: URLEP, Žiga (ur.), JUVAN, Peter (ur.). Book of abstracts. Elixir-si Launch & 11th CFGBC Symposium Data for Life, Ljubljana, September 20 - September 21, 2016. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2016. Str. 35. ISBN 978-961-267-113-6. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/2016data4life/abstracts/Book_of_Abstracts.pdf. [COBISS.SI-ID 1537138627]

87. BORDON, Jure, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. Evaluating the kinetic parameters for quantitative models in systems biology. V: URLEP, Žiga (ur.), JUVAN, Peter (ur.). Book of abstracts. Elixir-si Launch & 11th CFGBC Symposium Data for Life, Ljubljana, September 20 - September 21, 2016. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2016. Str. 21. ISBN 978-961-267-113-6. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/2016data4life/abstracts/Book_of_Abstracts.pdf. [COBISS.SI-ID 1537137347]

88. PUŠNIK, Žiga, STANOVNIK, Lidija, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Global sensitivity analysis of biological models with high-dimensional and poorly connected parameter spaces. V: URLEP, Žiga (ur.), JUVAN, Peter (ur.). Book of abstracts. Elixir-si Launch & 11th CFGBC Symposium Data for Life, Ljubljana, September 20 - September 21, 2016. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2016. Str. 37. ISBN 978-961-267-113-6. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/2016data4life/abstracts/Book_of_Abstracts.pdf. [COBISS.SI-ID 1537136835]

89. LEBEN ZUPET, Katja, KRESE, Rok, PLAPER, Tjaša, FRANKO, Nik, STANOVNIK, Lidija, GRADIŠEK, Miha, MERLJAK, Estera, ROŠKAR, Samo, JERALA, Nina, CEROVIĆ, Kosta, PRAZNIK, Arne, PUŠNIK, Žiga. IGEM 2016 : giant jamboree, October 27-31, Hynes Convention Center, Boston, MA. [COBISS.SI-ID 1537310915]

90. VODOPIVEC, Nataša. Prenos meritev pametne zapestnice v enovito podatkovno bazo : diplomsko delo : univerzitetni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [N. Vodopivec], 2016. VIII, 38 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/3635/. [COBISS.SI-ID 1537244355]

91. STIPIČ, Matej. Razvoj modula za upravljanje delovnih obremenitev v sistemu AtlasWMS : diplomsko delo : visokošolski strokovni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [M. Stipič], 2016. 39 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/3238/, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 1536770243]

92. MOŠKON, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha. Realizacija dvojiškega pomnjenja v preprostih bioloških sistemih. Elektrotehniški vestnik. [Slovenska tiskana izd.]. 2016, letn. 83, št. 4, str. 194-200, ilustr. ISSN 0013-5852. http://ev.fe.uni-lj.si/4-2016/Moskon.pdf, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 1537252803]

93. CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, ROZMAN, Damjana. SteatoNet as a computational model for prediction of gender-based liver-related diseases. V: Conference book. EMTRAIN PhD Workshop, April 24-27, 2016, Berlin. [S. l.: s. n.], 2016. Str. [42]. [COBISS.SI-ID 1536901827]

94. CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, URLEP, Žiga, ROZMAN, Damjana. SteatoNet as a predictive and gender-based liver metabolic model. V: SBMC 2016. München: Helmholtz Zentrum, 2016. Str. 40. [COBISS.SI-ID 1536874691]

95. CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, ROZMAN, Damjana. SteatoNet model to investigate the gender component of liver related pathologies. V: CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja (ur.), et al. Everything you always wanted to know about personalised medicine in clinical care. [S. l.: s. n], 2016. Str. 91. https://www.easym.eu/lw_resource/datapool/_items/item_59/easym_2016_programme_brochure_protected.pdf. [COBISS.SI-ID 1537254595]

96. ROZMAN, Damjana, CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, MOŠKON, Miha. Tackling liver disease : an object modelling approach : hands-on tutorial at Modelling and bioinformatics for personalised medicine, 2nd SysBioMed, 1st Conference of the European Association of Systems Medicine, 26th October 2016. [COBISS.SI-ID 1537255363]

97. ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, LEBAR BAJEC, Iztok, DEMŠAR, Jure, BORDON, Jure, PETRONI, Mattia, MOŠKON, Miha, MEDEN, Blaž, PANGERŠIČ, Dominik, PUZIGAČA, Mitja. TMG Cloud : dokumentacija. Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko, 2016. 1 zv. (loč. pag.), ilustr. [COBISS.SI-ID 1536808387]

98. MOŠKON, Miha, CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, MRAZ, Miha. Understanding complex diseases with object oriented modelling : hands-on tutorial at EIT Health Summer School on Big Data for Healthy Living, 27 June - 06 July 2016, Archamps, France. [COBISS.SI-ID 1537019587]

99. CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, ROZMAN, Damjana. Use of steatonet as a predictive tool to disclose the complexity of gender - based liver - related diseases. V: URLEP, Žiga (ur.), JUVAN, Peter (ur.). Book of abstracts. Elixir-si Launch & 11th CFGBC Symposium Data for Life, Ljubljana, September 20 - September 21, 2016. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2016. Str. 29. ISBN 978-961-267-113-6. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/2016data4life/abstracts/Book_of_Abstracts.pdf. [COBISS.SI-ID 32830169]

100. OSOLIN, Timotej. Zasnova translacije bioloških modelov v SBML zapis : diplomsko delo : univerzitetni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [T. Osolin], 2016. VIII, 36 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/3518/. [COBISS.SI-ID 1537197251]

101. ARBAJTER, Simon. Analiza toka in načina hrambe podatkov o obravnavah pacientov v Urgentnem kirurškem bloku UKC Ljubljana : magistrsko delo = Analysis of patient data management process in the Surgical emergency unit of UMC Ljubljana : masterʹs thesis. Ljubljana: [S. Arbajter], 2017. 75 str., [1] f. pril., [2] f. zganj. pril., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 5323371]

102. STANOVNIK, Lidija, MOŠKON, Miha. Application of fuzzy temporal logic to biological systems modelling : lecture at 4th International Synthetic & Systems Biology Summer School - SSBSS 2017, Robinson College, University of Cambridge, UK, 17-21 July 2017. [COBISS.SI-ID 1537477059]

103. STANOVNIK, Lidija, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Automatization of fuzzy inference system describing the dynamics of MAPK cascade. V: Abstracts. Systems Medicine Conference in Slovenia National Awareness Event 8th June 8th 2017 & 12th CFGBC Symposium - June 9th 2017, and "Systems Medicine" Workshop. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2017. Str. [1]. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/2017eracosysmed/abstracts/abstractP_lMagdevska_01.html. [COBISS.SI-ID 1537662403]

104. VASYLCHENKOVA, Anastasiia, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Classical mechanics approach applied to analysis of genetic oscillators. IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics. [Print ed.]. May/Jun. 2017, vol. 14, no. 3, str. 721-727, ilustr. ISSN 1545-5963. http://ieeexplore.ieee.org/xpl/articleDetails.jsp?arnumber=7447719&newsearch=true&queryText=classical%20mechanics%20approach%20applied%20to%20analysis%20of%20genetic%20oscillators, DOI: 10.1109/TCBB.2016.2550456. [COBISS.SI-ID 1536851139]

105. STANOVNIK, Lidija, PUŠNIK, Žiga, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Computational design of synchronous sequential structures in biological systems. Journal of computational science. Jan. 2017, vol. 18, str. 24-31, ilustr. ISSN 1877-7503. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1877750316303866, DOI: 10.1016/j.jocs.2016.11.010. [COBISS.SI-ID 1537294275]

106. REJC, Živa, STANOVNIK, Lidija, TRŠELIČ, Tilen, OSOLIN, Timotej, VODOPIVEC, Rok, MRAZ, Jakob, PAVLIHA, Eva, ZIMIC, Nikolaj, CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, ROZMAN, Damjana, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. Computational modelling of genome-scale metabolic networks and its application to CHO cell cultures. Computers in Biology and Medicine. [Print ed.]. Sep. 2017, vol. 88, str. 150-160, ilustr. ISSN 0010-4825. http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0010482517302299, DOI: 10.1016/j.compbiomed.2017.07.005. [COBISS.SI-ID 1537463235]

107. FABJAN, Jure, TONI, Luka, NADIŽAR, Nejc, MOŠKON, Miha, GREGORIČ KRAMBERGER, Milica, PROSENC ZMRZLJAK, Uršula, ROZMAN, Damjana, PIRTOŠEK, Zvezdan. Computational support for diagnosis of Alzheimer's disease. V: GORIČAR, Katja (ur.), HUDLER, Petra (ur.). Book of abstracts = Zbornik povzetkov. 12th Meeting of the Slovenian Biochemical Society with International Participation = 12. srečanje Slovenskega biokemijskega društva z mednarodno udeležbo, Bled 20 - 23 september 2017. Ljubljana: Slovenian Biochemical Society, 2017. Str. 133. ISBN 978-961-93879-4-8. [COBISS.SI-ID 1537558467]

108. HORVAT, Marjeta, PINTAR, Žiga, MOŠKON, Miha, PROSENC ZMRZLJAK, Uršula, ROZMAN, Damjana, KOUTER, Katarina, VIDETIČ PASKA, Alja. Computational support for management and analysis of human samples obtained from suicide victims. V: GORIČAR, Katja (ur.), HUDLER, Petra (ur.). Book of abstracts = Zbornik povzetkov. 12th Meeting of the Slovenian Biochemical Society with International Participation = 12. srečanje Slovenskega biokemijskega društva z mednarodno udeležbo, Bled 20 - 23 september 2017. Ljubljana: Slovenian Biochemical Society, 2017. Str. 145. ISBN 978-961-93879-4-8. [COBISS.SI-ID 1537558979]

109. HVALA, Staš, PUŠNIK, Žiga, REJC, Živa, PROSENC ZMRZLJAK, Uršula, BLAGOTINŠEK COKAN, Kaja, URLEP, Žiga, NADIŽAR, Nejc, MOŠKON, Stane, ROZMAN, Damjana, MOŠKON, Miha. Computational support for management of animal samples. V: Abstracts. Systems Medicine Conference in Slovenia National Awareness Event 8th June 8th 2017 & 12th CFGBC Symposium - June 9th 2017, and "Systems Medicine" Workshop. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2017. Str. [1]. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/2017eracosysmed/abstracts/abstractP_zRejc_01.html. [COBISS.SI-ID 1537663427]

110. HVALA, Staš, PUŠNIK, Žiga, REJC, Živa, PROSENC ZMRZLJAK, Uršula, BLAGOTINŠEK COKAN, Kaja, URLEP, Žiga, NADIŽAR, Nejc, MOŠKON, Stane, ROZMAN, Damjana, MOŠKON, Miha. Computational support for management of animal samples in research laboratories. V: GORIČAR, Katja (ur.), HUDLER, Petra (ur.). Book of abstracts = Zbornik povzetkov. 12th Meeting of the Slovenian Biochemical Society with International Participation = 12. srečanje Slovenskega biokemijskega društva z mednarodno udeležbo, Bled 20 - 23 september 2017. Ljubljana: Slovenian Biochemical Society, 2017. Str. 108. ISBN 978-961-93879-4-8. [COBISS.SI-ID 1537557955]

111. HVALA, Staš, PUŠNIK, Žiga, REJC, Živa, PROSENC ZMRZLJAK, Uršula, BLAGOTINŠEK COKAN, Kaja, URLEP, Žiga, NADIŽAR, Nejc, MOŠKON, Stane, ROZMAN, Damjana, MOŠKON, Miha. Computational support for management, tracking and analysis of animal samples. V: KRANJC BREZAR, Simona (ur.), MAJDIČ, Gregor (ur.). Proceedings. 3rd Congress of the SLAS and 1st joint SLAS - CroLASA meeting, Ljubljana, 15-16 June 2017. 1st ed. Ljubljana: Veterinarska fakulteta, 2017. Str. 55. Slovenian veterinary research, Vol. 54, suppl. 18, 2017. ISSN 1580-4003. [COBISS.SI-ID 1537446083]

112. HORVAT, Marjeta, PINTAR, Žiga, MOŠKON, Miha, PROSENC ZMRZLJAK, Uršula, ROZMAN, Damjana, KOUTER, Katarina, VIDETIČ PASKA, Alja. Computational support for management, tracking and analysis of human samples obtained from suicide victims. V: Abstracts. Systems Medicine Conference in Slovenia National Awareness Event 8th June 8th 2017 & 12th CFGBC Symposium - June 9th 2017, and "Systems Medicine" Workshop. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2017. Str. [1]. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/2017eracosysmed/abstracts/abstractP_mHorvat_01.html. [COBISS.SI-ID 1537662659]

113. REJC, Živa, TRŠELIČ, Tilen, MRAZ, Jakob, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha. In silico analysis of CHO metabolism in dependence on the medium composition. V: Abstracts. Systems Medicine Conference in Slovenia National Awareness Event 8th June 8th 2017 & 12th CFGBC Symposium - June 9th 2017, and "Systems Medicine" Workshop. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2017. Str. [1]. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/2017eracosysmed/abstracts/abstractP_mMoskon_01.html. [COBISS.SI-ID 1537664195]

114. HVALA, Staš, PUŠNIK, Žiga, REJC, Živa, PROSENC ZMRZLJAK, Uršula, BLAGOTINŠEK COKAN, Kaja, URLEP, Žiga, NADIŽAR, Nejc, ROZMAN, Damjana, MOŠKON, Miha. InfoGen : informacijski sistem za sledenje, analizo in vodenje vzorcev na področju funkcijske genomike. V: ŽEMVA, Andrej (ur.), TROST, Andrej (ur.). Zbornik šestindvajsete mednarodne Elektrotehniške in računalniške konference ERK 2017 = Proceedings of the Twenty-sixth International Electrotechnical and Computer Science Conference ERK 2017. ERK 2017, Portorož, Slovenija, 25. - 26. september 2017. Ljubljana: IEEE, Slovenska sekcija IEEE, 2017. Str. 524-527, ilustr. Zbornik ... Elektrotehniške in računalniške konference ERK ..., 26. ISSN 2591-0442. http://erk.fe.uni-lj.si/2017/papers/hvala(infogen__informacijski).pdf. [COBISS.SI-ID 1537556163]

115. FABJAN, Jure, TONI, Luka, NADIŽAR, Nejc, MOŠKON, Miha, GREGORIČ KRAMBERGER, Milica, PROSENC ZMRZLJAK, Uršula, ROZMAN, Damjana, PIRTOŠEK, Zvezdan. Information system for support in the diagnosis of Alzheimer's disease. V: Abstracts of the 15th Meeting of the Austrian Neuroscience Association (ANA), 24th - 26th September 2017, IST Austria. [S. l.: s. n.], 2017. Str. 25. [COBISS.SI-ID 1537568707]

116. FABJAN, Jure, TONI, Luka, NADIŽAR, Nejc, MOŠKON, Miha, GREGORIČ KRAMBERGER, Milica, PROSENC ZMRZLJAK, Uršula, ROZMAN, Damjana, PIRTOŠEK, Zvezdan. Information system to aid the diagnosis of Alzheimer's disease. V: Abstracts. Systems Medicine Conference in Slovenia National Awareness Event 8th June 8th 2017 & 12th CFGBC Symposium - June 9th 2017, and "Systems Medicine" Workshop. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2017. Str. [1]. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/2017eracosysmed/abstracts/abstractP_jFabjan_01.html. [COBISS.SI-ID 1537666755]

117. CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, REICHERT, Matthias C., MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, LAMMERT, Frank, ROZMAN, Damjana. Large-scale computational models of liver metabolism : how far from the clinics?. Hepatology. 2017, vol. 66, no. 4, str. 1323-1334, ilustr. ISSN 0270-9139. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/hep.29268/full, DOI: 10.1002/hep.29268. [COBISS.SI-ID 1537425347]
nagrada: V okviru tedna Univerze v Ljubljani je delo izbrano med najodličnejše raziskovalne dosežke Univerze v Ljubljani v letu 2017

118. CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, URLEP, Žiga, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, ROZMAN, Damjana. LiverSex : first computational model to investigate an interplay between sex hormones and liver. V: GORIČAR, Katja (ur.), HUDLER, Petra (ur.). Book of abstracts = Zbornik povzetkov. 12th Meeting of the Slovenian Biochemical Society with International Participation = 12. srečanje Slovenskega biokemijskega društva z mednarodno udeležbo, Bled 20 - 23 september 2017. Ljubljana: Slovenian Biochemical Society, 2017. Str. 72. ISBN 978-961-93879-4-8. [COBISS.SI-ID 1537557443]

119. CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, URLEP, Žiga, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, ROZMAN, Damjana. LiverSex : in silico study of sexual aspects in liver metabolism. V: Abstracts. Systems Medicine Conference in Slovenia National Awareness Event 8th June 8th 2017 & 12th CFGBC Symposium - June 9th 2017, and "Systems Medicine" Workshop. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2017. Str. [1]. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/2017eracosysmed/abstracts/abstractP_tCvitanovic_01.html. [COBISS.SI-ID 1537661891]

120. GAZVODA, Silvo. Pregled orodij za agentno modeliranje bioloških sistemov in njihova uporaba na modelu večceličnega biološkega oscilatorja : magistrsko delo : študijski program druge stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [S. Gazvoda], 2017. VIII, 85 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/3983/. [COBISS.SI-ID 1537592771]

121. MOŠKON, Miha. Priprave na vaje za predmet Osnove digitalnih vezij. 1. izd. Ljubljana: Založba UL FRI, 2017. ilustr. ISBN 978-961-6209-94-6. http://zalozba.fri.uni-lj.si/moskon2017.pdf, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 292687616]

122. LEBEN, Urban. Programska rešitev avtomatizacije procesa sestave turističnega itinerarja : diplomsko delo : univerzitetni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [U. Leben], 2017. 40 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/3868/. [COBISS.SI-ID 1537466307]

123. MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana, CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja. Tackling liver disease : an object oriented modelling approach : hands-on tutorial at CASyM Winter School, 3rd SySBioMED, March 29th - April 1st 2017, Ljubljana, Slovenia. [COBISS.SI-ID 1537399235]

124. FERFILA, Nevenka (avtor, vodja projekta), BOH PODGORNIK, Bojana, GRAMC, Kristina, GRIESSLER BULC, Tjaša, HAREJ, Jan, KAMBIČ, Nejc, MOŠKON, Miha, PRELEC POLJANŠEK, Pia, ROPRET, Maruša, RUTAR POLANEC, Valentina, SANKOVIČ, Nina, ŠKRAJNAR, Žana, VIDIC, Tamara. Temne skrivnosti hitre mode : končno poročilo o rezultatih raziskovalnega projekta : javni razpis "Projektno delo z gospodarstvom in negospodarstvom v lokalnem in regionalnem okolju Po kreativni poti do znanja 2016 - 2017" v okviru dejavnosti operativnega programa za izvajanje Evropske kohezijske politike v obdobju 2014 - 2020. Ljubljana: Zdravstvena fakulteta, 2017. 1 zv. (loč.pag.), ilustr. [COBISS.SI-ID 5445483]

125. STANOVNIK, Lidija. Uporaba mehke logike za modeliranje bioloških sistemov na primeru signalne poti MAPK : delo je pripravljeno v skladu s Pravilnikom o podeljevanju Prešernovih nagrad študentom, pod mentorstvom doc. dr. Mihe Moškona. Ljubljana: [L. Magdevska], 2017. IX, 63 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/4023/. [COBISS.SI-ID 1537656259]
nagrada: Fakultetna Prešernova nagrada

126. STANOVNIK, Lidija. Uporaba mehke logike za modeliranje bioloških sistemov na primeru signalne poti MAPK : diplomsko delo : univerzitetni študijski program prve stopnje Računalništvo in matematika. Ljubljana: [L. Magdevska], 2017. IX, 61 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/3906/. [COBISS.SI-ID 1537530563]

127. PUŠNIK, Žiga, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Viable parameter space analysis of dynamic biological models. V: Abstracts. Systems Medicine Conference in Slovenia National Awareness Event 8th June 8th 2017 & 12th CFGBC Symposium - June 9th 2017, and "Systems Medicine" Workshop. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2017. Str. [1]. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/2017eracosysmed/abstracts/abstractP_zPusnik_01.html. [COBISS.SI-ID 1537663939]

128. PUŠNIK, Žiga. Analiza prostora dopustnih rešitev v visokodimenzionalnih dinamičnih modelih bioloških sistemov : delo je pripravljeno v skladu s Pravilnikom o podeljevanju Prešernovih nagrad študentom, pod mentorstvom doc. dr. Mihe Moškona. Ljubljana: [Ž. Pušnik], 2018. VIII, 83 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/4328/. [COBISS.SI-ID 1538062019]
nagrada: Fakultetna Prešernova nagrada

129. PUŠNIK, Žiga. Analiza prostora dopustnih rešitev v visokodimenzionalnih dinamičnih modelih bioloških sistemov : magistrsko delo : magistrski program druge stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [Ž. Pušnik], 2018. VIII, 83 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/4220/. [COBISS.SI-ID 1537907395]

130. CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja. Analiza sistemskih motenj v metabolizmu jeter z modelom SteatoNet : doktorska disertacija = Analysis of system disorders in liver metabolism with the SteatoNet model : doctoral dissertation. Ljubljana: [T. Cvitanović Tomaš], 2018. XVII, 89 str., ilustr. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=105555&lang=slv, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 298128128]

131. PETRONI, Mattia. Computational methodology for enhanced sensitivity analysis of gene regulatory networks. Ljubljana: [M. Petroni], 2018. XVI, 225 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/4129/, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 1537786307]

132. CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, ROZMAN, Damjana. Computational modelling of liver metabolism and its applications in research and the clinics. Acta chimica slovenica. [Spletna izd.]. June 2018, vol. 65, no. 2, str. 253-265, ilustr. ISSN 1580-3155. https://journals.matheo.si/index.php/ACSi/issue/view/8, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si, DOI: 10.17344/acsi.2018.4461. [COBISS.SI-ID 33810905]

133. GLUHIĆ, Zala, FABJANČIČ, Matevž, MOŠKON, Miha, REŽEN, Tadeja. Computational support for management and analysis of clinical samples - hepatocellular carcinoma biomarker study. V: Taste of genomics : abstracts. 13th CFGBC Symposium, Ljubljana, 20-21 June 2018. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2018. Str. 1. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/events/seminars/2018cfgbcsym13/abstracts/posterAbstract_ZGluhic_01.html. [COBISS.SI-ID 1537823683]

134. BOLČIČ TAVČAR, Marko. Detekcija in preprečevanje napadov DDOS v okolju manjšega ponudnika internetnih storitev : diplomsko delo : univerzitetni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [M. Bolčič Tavčar], 2018. VIII, 35 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/4049/. [COBISS.SI-ID 1537702851]

135. MOŠKON, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha. Grohar : automated visualization of genome-scale metabolic models and their pathways. Journal of computational biology. [Print ed.]. May 2018, vol. 25, no. 5, str. 505-508. ISSN 1066-5277. http://online.liebertpub.com/doi/10.1089/cmb.2017.0209, DOI: 10.1089/cmb.2017.0209. [COBISS.SI-ID 1537720515]

136. DRNOVŠEK, Eva, POVŠE, Andraž, KOMAC, Roman, KRSTANOVIĆ, Fran, MOŠKON, Miha, DEBELJAK, Nataša. Information system for managing samples, analyses and patients with familial erythrocytosis. V: Taste of genomics : abstracts. 13th CFGBC Symposium, Ljubljana, 20-21 June 2018. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2018. Str. 1. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/events/seminars/2018cfgbcsym13/abstracts/posterAbstract_EDrnovsek_01.html. [COBISS.SI-ID 1537822915]

137. STANOVNIK, Lidija, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Initial state perturbations as a validation method for data-driven fuzzy models of cellular networks. BMC bioinformatics. Sep. 2018, vol. 19, str. 1-7, graf. prikazi. ISSN 1471-2105. https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-018-2366-0, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1186/s12859-018-2366-0. [COBISS.SI-ID 1537917379]

138. CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, URLEP, Žiga, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, ROZMAN, Damjana. LiverSex computational model : sexual aspects in hepatic metabolism and abnormalities. Frontiers in physiology. Apr. 2018, vol. 9, str. 1-12. ISSN 1664-042X. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5907313/pdf/fphys-09-00360.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.3389/fphys.2018.00360. [COBISS.SI-ID 33711833]
projekt: no. 305033; financer: FP7 CASyM (Coordinating Action Systems Medicine Europe)
projekt: P1-0390, P2-0359; financer: Slovenian Research Agency

139. JUKAN, Nermin. Razvoj spletne platforme za vizualizacijo in deljenje medicinskih algoritmov : diplomsko delo : visokošolski strokovni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [N. Jukan], 2018. 42 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/4181/. [COBISS.SI-ID 1537926339]

140. BORDON, Jure, MOŠKON, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha. Semi-quantitative modelling of gene regulatory processes with unknown parameter values using fuzzy logic and Petri nets. Fundamenta informaticae. 2018, vol. 160, no. 1/2, str. 81-100, ilustr. ISSN 0169-2968. https://content.iospress.com/download/fundamenta-informaticae/fi1675?id=fundamenta-informaticae%2Ffi1675, DOI: 10.3233/FI-2018-1675. [COBISS.SI-ID 1537781699]

141. ROZMAN, Damjana, BLAGOTINŠEK COKAN, Kaja, CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, URLEP, Žiga, JUVAN, Peter, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. Sexual aspects in hepatic metabolism and its abnormalities : a systems approach. V: SZÜTS, Dávis (ur.), BUDAY, László (ur.). FEBS3+ Conference : [from molecules to living systems] : final programme & book of abstracts : 2-5 September 2018, Siófok, Hungary. Veszprém: OOK-Press, 2018. Str. 98. ISBN 978-615-5270-47-5. [COBISS.SI-ID 33947609]

142. CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, ROZMAN, Damjana. Systems approaches for the analysis of sex and alcohol related influences on liver metabolism. V: Taste of genomics : abstracts. 13th CFGBC Symposium, Ljubljana, 20-21 June 2018. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2018. Str. 1. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/events/seminars/2018cfgbcsym13/abstracts/posterAbstract_TCTomas_01.html. [COBISS.SI-ID 1537824963]

143. STANOVNIK, Lidija, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Towards a sex-dependet mathematical model of mammalian circadian clock. V: Taste of genomics : abstracts. 13th CFGBC Symposium, Ljubljana, 20-21 June 2018. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2018. Str. 1. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/events/seminars/2018cfgbcsym13/abstracts/posterAbstract_LMagdevska_01.html. [COBISS.SI-ID 1537824451]

144. JUKAN, Nermin, ZAGORŠEK, David, PRELOŽNIK ZUPAN, Irena, DEBELJAK, Nataša, MOŠKON, Miha. ViDis : web-based tool for the visualisation of diagnostic algorithms. V: Taste of genomics : abstracts. 13th CFGBC Symposium, Ljubljana, 20-21 June 2018. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2018. Str. 1. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/events/seminars/2018cfgbcsym13/abstracts/posterAbstract_NJukan_01.html. [COBISS.SI-ID 1537823427]

145. MOŠKON, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha. Visualisation and analysis of metabolic networks with Grohar. V: Taste of genomics : abstracts. 13th CFGBC Symposium, Ljubljana, 20-21 June 2018. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2018. Str. 1. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/events/seminars/2018cfgbcsym13/abstracts/lectureAbstract_MMoskon_01.html. [COBISS.SI-ID 1537823939]

146. NADIŽAR, Nejc. Vzpostavitev informacijskega okolja za vodenje evidence bioloških vzorcev : diplomsko delo : univerzitetni študijski program prve stopnje Računalništvo in matematika. Ljubljana: [N. Nadižar], 2018. VIII, 41 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/4099/. [COBISS.SI-ID 1537763523]

147. DRAKULIĆ, Živa, SKUBIC, Cene, MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana. Altered cholesterol synthesis pathway influences the circadian rhythm of mouse embryonic fibroblasts. V: REŽEN, Tadeja (ur.). Book of abstracts. 1st electronic ed. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Medicine, 2019. Str. 29. ISBN 978-961-267-161-7. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/events/seminars/2019eracosysmed/docs/bookOfAbstracts_2019eracosysmed.pdf. [COBISS.SI-ID 1538252739]

148. CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, ROZMAN, Damjana. Analysis of sex and alcohol related influences on liver metabolism with systems approaches. V: EASyM Europe 2018 : abstracts. New Rochelle (NY): Mary Ann Liebert, 2019. Str. a5. Systems medicine, #vol. #2, 1. ISSN 2573-3370. https://www.liebertpub.com/doi/pdf/10.1089/sysm.2018.29003.abstracts. [COBISS.SI-ID 1538105027]

149. NADIŽAR, Nejc, REŽEN, Tadeja, DEBELJAK, Nataša, VIDETIČ PASKA, Alja, ROZMAN, Damjana, MOŠKON, Miha. BiOpenBank : open source solution for management of biological samples and sample associated data in small biobanks. V: KISOVEC, Matic (ur.). Book of abstracts = Knjiga povzetkov. 13th Meeting of the Slovenian Biochemical Society with International Participation = 13. srečanje Slovenskega biokemijskega društva z mednarodno udeležbo, Dobrna, 24 - 27 September 2019. Ljubljana: Slovenian Biochemical Society, 2019. Str. 36. ISBN 978-961-93879-8-6. [COBISS.SI-ID 34507993]

150. MOŠKON, Miha, REŽEN, Tadeja, DEBELJAK, Nataša, VIDETIČ PASKA, Alja. BiOpenBank information systems and its integration into the analysis of genetic predispositions in psychiatric disorders. V: STRLE, Toma (ur.), KOLENIK, Tine (ur.), MARKIČ, Olga (ur.). Kognitivna znanost : zbornik 22. Mednarodne multikonference Informacijska družba - IS 2019, 10. oktober 2019 : zvezek B = Cognitive Science : proceedings of the 22nd International Multiconference Information Society - IS 2019, 10 October, 2019, Ljubljana, Slovenia : volume B. Ljubljana: Institut "Jožef Stefan", 2019. Str. 36-38. Informacijska družba. ISBN 978-961-264-157-3, ISBN 978-961-264-158-0. ISSN 2630-371X. http://library.ijs.si/Stacks/Proceedings/InformationSociety/2019/IS2019_Volume_B%20-%20Kognitivna%20znanost.pdf. [COBISS.SI-ID 1538420675]

151. SMERKOL, Maj, ŠTEBLAJ, Jurij, KLANEČEK, Žan, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Computational analysis of parametric variability influence on the dynamics of synchronized cellular populations. V: REŽEN, Tadeja (ur.). Book of abstracts. 1st electronic ed. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Medicine, 2019. Str. 42. ISBN 978-961-267-161-7. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/events/seminars/2019eracosysmed/docs/bookOfAbstracts_2019eracosysmed.pdf. [COBISS.SI-ID 1538250691]

152. PUŠNIK, Žiga, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Computational analysis of viable parameter regions in models of synthetic biological systems. Journal of biological engineering. Sep. 2019, vol. 13, str. 1-21, graf. prikazi. ISSN 1754-1611. https://jbioleng.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13036-019-0205-0, DOI: 10.1186/s13036-019-0205-0. [COBISS.SI-ID 1538345411]

153. KOMAC, Roman, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Computational design of synchronised bacterial counters. V: Abstracts. 14th CFGBC Symposium, June 11th 2019, Faculty of Medicine, University of Ljubljana, Ljubljana. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2019. Str. 1. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/events/seminars/2019cfgbcsym14/abstracts/posterAbstract_RKomac.html. [COBISS.SI-ID 1538256323]

154. PUŠNIK, Žiga, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Constraint-based inference of gene regulatory networks. V: REŽEN, Tadeja (ur.). Book of abstracts. 1st electronic ed. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Medicine, 2019. Str. 40. ISBN 978-961-267-161-7. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/events/seminars/2019eracosysmed/docs/bookOfAbstracts_2019eracosysmed.pdf. [COBISS.SI-ID 1538250179]

155. BOHINC, Laura, POŽEK, Kity, BURJEK, Tilen, DRNOVŠEK, Eva, FABJANČIČ, Matevž, GORJAN, Andrej, GRČAR, Filip, JUKAN, Nermin, KOMAC, Roman, KOTNIK, Nejka, LAZAREVIČ, Julija, ROTVEJN PAJIČ, Vid, POVŠE, Andraž, PUCIHAR, Natalija, TEKAVEC, Sara, TUREL, Tina, VRHOVNIK, Gašper, ZAGORŠEK, David, BON, Jurij, MOŠKON, Stane, DEBELJAK, Nataša, REŽEN, Tadeja, VIDETIČ PASKA, Alja, MOŠKON, Miha. Development of an open information system for sample management in biomedical research studies and in a biobank repository. V: KISOVEC, Matic (ur.). Book of abstracts = Knjiga povzetkov. 13th Meeting of the Slovenian Biochemical Society with International Participation = 13. srečanje Slovenskega biokemijskega društva z mednarodno udeležbo, Dobrna, 24 - 27 September 2019. Ljubljana: Slovenian Biochemical Society, 2019. Str. 102. ISBN 978-961-93879-8-6. [COBISS.SI-ID 1538368195]

156. KRISTAN, Aleša, GAŠPERŠIČ, Jernej, PAJIČ, Tadej, REŽEN, Tadeja, KUNEJ, Tanja, KOLIČ, Rok, MARČAC-GRAHEK, Tatjana, MOŠKON, Miha, PRELOŽNIK ZUPAN, Irena, DEBELJAK, Nataša. Diagnosis of familial erythrocytosis in clinical practice. V: KISOVEC, Matic (ur.). Book of abstracts = Knjiga povzetkov. 13th Meeting of the Slovenian Biochemical Society with International Participation = 13. srečanje Slovenskega biokemijskega društva z mednarodno udeležbo, Dobrna, 24 - 27 September 2019. Ljubljana: Slovenian Biochemical Society, 2019. Str. 126. ISBN 978-961-93879-8-6. http://dobrna2019.sbd.si/upload/docs/SBD2019_Knjiga_Povzetkov_web.pdf. [COBISS.SI-ID 4075028]

157. KRISTAN, Aleša, GAŠPERŠIČ, Jernej, HUDLER, Petra, GERM, Dubravka, LAZAREVIČ, Julija, REŽEN, Tadeja, ROZMAN, Damjana, PAJIČ, Tadej, FINK, Martina, ANŽEJ DOMA, Saša, ŽULA, Špela, KUNEJ, Tanja, KOLIČ, Rok, MARČAC GRAHEK, Tatjana, MOŠKON, Miha, PRELOŽNIK ZUPAN, Irena, DEBELJAK, Nataša. Familial erythrocytosis : diagnostic strategy and clinical practice in Slovenia. V: Pathogenesis, diagnosis and therapy of myeloproliferative neoplasms. [Belgrade: s. n., 2019]. Str. 35-36. [COBISS.SI-ID 34393305]

158. JUKAN, Nermin, MOŠKON, Stane, DEBELJAK, Nataša, REŽEN, Tadeja, VIDETIČ PASKA, Alja, MOŠKON, Miha. GDPR and biobanking : ensuring compliance with the law. V: REŽEN, Tadeja (ur.). Book of abstracts. 1st electronic ed. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Medicine, 2019. Str. 34. ISBN 978-961-267-161-7. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/events/seminars/2019eracosysmed/docs/bookOfAbstracts_2019eracosysmed.pdf. [COBISS.SI-ID 1538251203]

159. MOŠKON, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha. Grohar - computational tool for the analysis, visualisation and alignment of metabolic networks. V: EASyM Europe 2018 : abstracts. New Rochelle (NY): Mary Ann Liebert, 2019. Str. a3. Systems medicine, #vol. #2, 1. ISSN 2573-3370. https://www.liebertpub.com/doi/pdf/10.1089/sysm.2018.29003.abstracts. [COBISS.SI-ID 1538104515]

160. MOŠKON, Miha, CVITANOVIĆ TOMAŠ, Tanja, MRAZ, Miha, ROZMAN, Damjana. Hands-on tutorial on object-oriented modelling of large-scale metabolic models. V: EASyM Europe 2018 : abstracts. New Rochelle (NY): Mary Ann Liebert, 2019. Str. a2. Systems medicine, #vol. #2, 1. ISSN 2573-3370. https://www.liebertpub.com/doi/pdf/10.1089/sysm.2018.29003.abstracts. [COBISS.SI-ID 1538104259]

161. KRISTAN, Aleša, GAŠPERŠIČ, Jernej, HUDLER, Petra, GERM, Dubravka, REŽEN, Tadeja, ROZMAN, Damjana, KUNEJ, Tanja, PAJIČ, Tadej, FINK, Martina, ANŽEJ DOMA, Saša, ŽULA, Špela, PRELOŽNIK ZUPAN, Irena, KOLIČ, Rok, MARČAC-GRAHEK, Tatjana, MOŠKON, Miha, DEBELJAK, Nataša. Implementation of a new diagnostic strategy for familial erythrocytosis in Slovenia. V: ESHG 2019. Gothenburg: European Society of Human Genetics, 2019. https://www.abstractsonline.com/pp8/#!/7874/presentation/1685. [COBISS.SI-ID 34427865]
projekt: L3-9279; financer: Slovenian Research Agency

162. JERMAN, Lara, MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana, MRAZ, Miha. Integration of circadian clock effects into a cholesterol biosynthesis model. V: REŽEN, Tadeja (ur.). Book of abstracts. 1st electronic ed. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Medicine, 2019. Str. 33. ISBN 978-961-267-161-7. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/events/seminars/2019eracosysmed/docs/bookOfAbstracts_2019eracosysmed.pdf. [COBISS.SI-ID 1538251459]

163. VODOPIVEC, Nataša. Integration of standards and guidelines into the open source information management systems for biobanks : master of science in Informatics at Grenoble : specialization Artificial Intelligence and the Web. [S. l.: N. Vodopivec], 2019. IV, 54 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 1538281923]

164. NADIŽAR, Nejc, MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana. iSymbiol : information system for storage and management of biological samples. V: EASyM Europe 2018 : abstracts. New Rochelle (NY): Mary Ann Liebert, 2019. Str. a17. Systems medicine, #vol. #2, 1. ISSN 2573-3370. https://www.liebertpub.com/doi/pdf/10.1089/sysm.2018.29003.abstracts. [COBISS.SI-ID 1538105283]

165. KOVAČ, Urša, MALOVRH, Katja, MOŠKON, Miha, REŽEN, Tadeja, ROZMAN, Damjana. Lipids around the clock : findings from different human cell lines. V: REŽEN, Tadeja (ur.). Book of abstracts. 1st electronic ed. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Medicine, 2019. Str. 36. ISBN 978-961-267-161-7. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/events/seminars/2019eracosysmed/docs/bookOfAbstracts_2019eracosysmed.pdf. [COBISS.SI-ID 1538253251]

166. STANOVNIK, Lidija. Matematični model vpliva cirkadiane ure na biosintezo holesterola : magistrsko delo. Ljubljana: [L. Magdevska], 2019. VII, 87 str., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 18717785]

167. ŽNIDARŠIČ, Luka. Mobilna aplikacija za določanje lokacij z optimalnim vremenom : diplomsko delo : visokošolski strokovni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [L. Žnidaršič], 2019. VIII, 29 str., ilustr. http://eprints.fri.uni-lj.si/4380/. [COBISS.SI-ID 1538154691]

168. DEBELJAK, Nataša, LAZAREVIČ, Julija, MISKIČ, Dejan, VERMIGLIO, Lucija, KOPITAR, Anja, SOLAROVIČ, Anja, SEVER, Matjaž, FINK, Martina, PAJIČ, Tadej, ANŽEJ DOMA, Saša, MOŠKON, Miha, PRELOŽNIK ZUPAN, Irena. Opredelitev eritrocitoz in predlog diagnostičnega algoritma v Sloveniji = Characterization of erythrocytosis and a proposed diagnostic algorithm in Slovenia. Zdravniški vestnik : glasilo Slovenskega zdravniškega društva. [Tiskana izd.]. maj-jun. 2019, letn. 88, št. 5/6, str. 263-275, ilustr. ISSN 1318-0347. https://vestnik.szd.si/index.php/ZdravVest/article/view/2880/2424, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 34416601]

169. TKALEC, Matic, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. Primer uporabe FRAM metode za varnostno analizo funkcij predvzletnih operacij športnega letala. V: 1. CAA konferenca o letalski varnosti : Kranjska Gora, 9. maj 2019. [Ljubljana: Javna agencija za civilno letalstvo Republike Slovenije], 2019. 19 prosojnic, ilustr. [COBISS.SI-ID 1538223555]

170. KOVAČ, Urša, MOŠKON, Miha, POHAR, Katka, ŽUŽEK, Zala, STARČIČ ERJAVEC, Marjanca, IHAN, Alojz, ROZMAN, Damjana. Response of immune system to selected Escherichia coli strains impacts the circadian clock. V: Abstracts book. XVI Congress of the European Biological Rhythms, Lyon, 25 - 29 August 2019. [S. l.: s. n., 2019]. Str. 36. https://www.ebrs2019.com/wp-content/uploads/2019/08/Abstracts-book.pdf. [COBISS.SI-ID 34470105]

171. ŽUŽEK, Zala, KOVAČ, Urša, POHAR, Katka, MOŠKON, Miha, IHAN, Alojz, ROZMAN, Damjana, STARČIČ ERJAVEC, Marjanca. Selection of Escherichia coli strains and pre-assays needed to study the effect of bacteria on human hepatoma cell lines. V: REŽEN, Tadeja (ur.). Book of abstracts. 1st electronic ed. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Medicine, 2019. Str. 47. ISBN 978-961-267-161-7. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/events/seminars/2019eracosysmed/docs/bookOfAbstracts_2019eracosysmed.pdf. [COBISS.SI-ID 1538252995]

172. POŽEK, Kity, TUREL, Tina, BURJEK, Tilen, DRNOVŠEK, Eva, GORJAN, Andrej, KOMAC, Roman, KOTNIK, Nejka, ROTVEJN PAJIČ, Vid, TEKAVEC, Sara, ZAGORŠEK, David, BON, Jurij, DEBELJAK, Nataša, MOŠKON, Miha, VIDETIČ PASKA, Alja, REŽEN, Tadeja. StandBiobank : standardization of information systems for management of samples and data for research laboratories. V: REŽEN, Tadeja (ur.). Book of abstracts. 1st electronic ed. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Medicine, 2019. Str. 44. ISBN 978-961-267-161-7. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/2019eracosysmed/. [COBISS.SI-ID 34367449]

173. SKUBIC, Cene, NASSIB, Petra, MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana. Sterol-clock network : a link between cholesterol synthesis and the circadian clock. V: Abstracts book. XVI Congress of the European Biological Rhythms, Lyon, 25 - 29 August 2019. [S. l.: s. n., 2019]. Str. 115. https://www.ebrs2019.com/wp-content/uploads/2019/08/Abstracts-book.pdf. [COBISS.SI-ID 34506457]

174. MOŠKON, Miha, TKALEC, Matic, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha. Towards the declaration of inter-functional protocol for FRAM. V: R&M in the second machine age - the challenge of cyber physical systems : proceedings : Annual Reliability and Maintainability Symposium, RAMS 2019 : January 28-31, 2019, Orlando, Florida, USA. Piscataway (NJ): IEEE, cop. 2019. Str. 1-6, ilustr. Proceedings. Annual Reliability and Maintainability Symposium. ISBN 978-1-5386-6554-1. ISSN 0149-144X. [COBISS.SI-ID 1538112195]

175. MOŠKON, Miha, DEBELJAK, Nataša, VIDETIČ PASKA, Alja, REŽEN, Tadeja. Towards the development of a comprehensive open source information solution for small biobanks. V: Abstracts. 14th CFGBC Symposium, June 11th 2019, Faculty of Medicine, University of Ljubljana, Ljubljana. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2019. Str. 1. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/events/seminars/2019cfgbcsym14/abstracts/lectureAbstract_MMoskon.html. [COBISS.SI-ID 1538256835]

176. JUKAN, Nermin, ZAGORŠEK, David, PRELOŽNIK ZUPAN, Irena, DEBELJAK, Nataša, MOŠKON, Miha. ViDis : web-based platform for constructing and sharing visualizations of diagnostic algorithms. V: EASyM Europe 2018 : abstracts. New Rochelle (NY): Mary Ann Liebert, 2019. Str. a3. Systems medicine, #vol. #2, 1. ISSN 2573-3370. https://www.liebertpub.com/doi/pdf/10.1089/sysm.2018.29003.abstracts. [COBISS.SI-ID 1538104771]

177. NASTRAN, Jurij, PUŠNIK, Žiga, MOŠKON, Miha. Analiza robustnosti sintetičnega gensko regulatornega omrežja pri načrtovanju biološkega procesorja. V: BAVEC, Aljoša (ur.), et al. BIOmolekularec.si : Dan biomolekularnih znanosti : zbornik povzetkov : Ljubljana, 24. september 2020 : [spletna izvedba dogodka]. Ljubljana: Slovensko biokemijsko društvo, 2020. Str. 42. ISBN 978-961-93879-9-3. http://biomolekularec.splet.arnes.si/files/2020/09/BIOmolekularec_2020-zbornik.pdf. [COBISS.SI-ID 47761923]

178. NASTRAN, Jurij. Analiza uporabe hiperelipsoidov pri ocenjevanju robustnosti biološkega procesorja : diplomsko delo : univerzitetni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [J. Nastran], 2020. 47 str., ilustr. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=120063&lang=slv, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 31471363]

179. MOŠKON, Miha. CosinorPy : a Python package for cosinor-based rhythmometry. BMC bioinformatics. Oct. 2020, vol. 21, str. 1-12, graf. prikazi. ISSN 1471-2105. https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12859-020-03830-w, DOI: 10.1186/s12859-020-03830-w. [COBISS.SI-ID 34886403]

180. WALAKIRA, Andrew, OCIRA, Junior, DUROUX, Diane, FOULADI, Ramouna, MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana, VAN STEEN, Kristel. Detecting gene-gene interactions from GWAS using diffusion kernel principal components. V: TranSYS Online Training School, 22nd - 27th, November 2020 : abstracts. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Medicine, Institute of Biochemistry, 2020. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/wp-content/uploads/abstracts_2020transysschool_uncat.pdf. [COBISS.SI-ID 42195203]

181. REŽEN, Tadeja, MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana. From experimental to computational models. V: TranSYS Online Training School : 22nd - 27th, November 2020 : [abstracts]. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2020. https://h2020transys.eu/transys-training-school-23rd-november-15-45tr/. [COBISS.SI-ID 47483139]

182. ŽUŽEK, Zala, KOVAČ, Urša, POHAR, Katka, MOŠKON, Miha, IHAN, Alojz, ROZMAN, Damjana, STARČIČ ERJAVEC, Marjanca. Odziv imunskega sistema na izbrane seve bakterije Escherichia coli in vpliv na cirkadiano uro. V: JAMNIKAR CIGLENEČKI, Urška (ur.), KUŠAR, Darja (ur.). 8. kongres Slovenskega mikrobiološkega društva : knjiga povzetkov : 23.-25. september 2020 : kongres SMD, 23.-25. 9. 2020 : virtualni kongres. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 2020. Str. 77-78, ilustr. ISBN 978-961-90346-8-2. [COBISS.SI-ID 41750275]

183. MOŠKON, Miha. Osnove programiranja v jeziku Python za neračunalničarje. Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko, 2020. 206 str., ilustr. ISBN 978-961-7059-04-5. http://zalozba.fri.uni-lj.si/moskon2020.pdf. [COBISS.SI-ID 32096259]

184. MOŠKON, Miha. Osnove programiranja v jeziku Python za neračunalničarje. Ljubljana: Fakulteta za računalništvo in informatiko, 2020. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (VII, 206 str.)), ilustr. ISBN 978-961-7059-02-1. http://zalozba.fri.uni-lj.si/moskon2020.pdf, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 31230723]

185. MIŠKIĆ, David. Pregled in primerjava računskih pristopov za analizo ritmičnega izražanja genov : diplomsko delo : univerzitetni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [D. Miškić], 2020. 137 str., graf. prikazi. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=114119&lang=slv, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 1538535619]

186. KOMAC, Roman. Računalniško načrtovanje večceličnih sinhronskih procesnih struktur : magistrsko delo : magistrski študijski program druge stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [R. Komac], 2020. 82 str., ilustr. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=122384&lang=slv, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 42006787]

187. AJSTER, Matej. Spletna aplikacija za analizo in vizualizacijo cirkadianih podatkov s knjižnico CosinorPy : diplomsko delo : univerzitetni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [M. Ajster], 2020. 44 str., ilustr. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=120065&lang=slv, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 31681027]

188. PLOHL, Jaša. Spremljanje porabe preko spletnih orodij za vizualizacijo meritev : diplomsko delo : visokošolski strokovni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [J. Plohl], 2020. 35 str., ilustr. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=119303&lang=slv, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 28020995]

189. BLAGOTINŠEK COKAN, Kaja, JUVAN, Peter, MOŠKON, Miha, URLEP, Žiga, MRAZ, Miha, KONG, X.Y., ESKILD, W., ROZMAN, Damjana, REŽEN, Tadeja. Transcriptional and metabolic rearrangements in liver fibrosis. V: Abstracts : virtual symposium. 15th CFGBC Symposium, 15th June 2020, Ljubljana. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2020. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/events-2020cfgbcsym15/events-2020cfgbcsym15-lectureabstracts/. [COBISS.SI-ID 19697923]

190. JUKAN, Nermin, ZAGORŠEK, David, LAZAREVIČ, Julija, PRELOŽNIK ZUPAN, Irena, DEBELJAK, Nataša, MOŠKON, Miha. ViDis : a platform for constructing and sharing of medical algorithms. Journal of computational biology. [Print ed.]. Jun. 2020, vol. 27, no. 6, str. 941-947, ilustr. ISSN 1066-5277. https://www.liebertpub.com/doi/pdf/10.1089/cmb.2019.0238, DOI: 10.1089/cmb.2019.0238. [COBISS.SI-ID 1538376387]

191. VELIKAJNE, Nina, MOŠKON, Miha. Analiza ritmičnosti števnih podatkov z uporabo modela cosinor. V: FISTER, Iztok (ur.), et al. Proceedings of the 2021 7th Student Computer Science Research Conference (StuCoSReC). 1st ed. Maribor [etc.]: University Press [etc.], 2021. Str. 61-64, graf. prikazi. ISBN 978-961-286-516-0. https://press.um.si/index.php/ump/catalog/book/611. [COBISS.SI-ID 76334851]

192. VEROVŠEK, Špela, ZUPANČIČ, Tadeja, JUVANČIČ, Matevž, PETROVČIČ, Simon, SVETINA, Matija, JANEŽ, Miha, PUŠNIK, Žiga, LEBAR BAJEC, Iztok, MOŠKON, Miha. The aspect of mobility and connectivity while assessing the neighbourhood sustainability. Academic journal of interdisciplinary studies. May 2021, vol. 10, no. 3, str. 37-48, ilustr. ISSN 2281-3993. https://www.richtmann.org/journal/index.php/ajis/article/view/12448, DOI: 10.36941/ajis. [COBISS.SI-ID 62625795]

193. BLAGOTINŠEK COKAN, Kaja, URLEP, Žiga, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, KONG, Xiang Y., ESKILD, Winnie, ROZMAN, Damjana, JUVAN, Peter, REŽEN, Tadeja. Common transcriptional program of liver fibrosis in mouse genetic models and humans. International journal of molecular sciences. 2021, vol. 22, iss. 2, str. 1-21, ilustr. ISSN 1422-0067. https://www.mdpi.com/1422-0067/22/2/832, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.3390/ijms22020832. [COBISS.SI-ID 47324419]
projekt: J1-9176; financer: Slovenian Research Agency
projekt: financer: Norwegian Research Council

194. MOŠKON, Miha, KOMAC, Roman, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha. Distributed biological computation : from oscillators, logic gates and switches to a multicellular processor and neural computing applications. Neural computing & applications. Aug. 2021, vol. 33, no. 15, str. 8923-8938, ilustr. ISSN 0941-0643. https://link.springer.com/article/10.1007/s00521-021-05711-6, DOI: 10.1007/s00521-021-05711-6. [COBISS.SI-ID 48415747]

195. RASPOR DALL'OLIO, Lucija, KOVAČ, Urša, ŽUŽEK, Zala, POHAR, Katka, IHAN, Alojz, MOŠKON, Miha, STARČIČ ERJAVEC, Marjanca, ROZMAN, Damjana. Escherichia coli affects expression of circadian clock genes in human hepatoma cells. V: Abstracts : virtual symposium. 16th CFGBC Symposium, 17th June 2021, Ljubljana. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2021. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/wp-content/uploads/2021cfgbcsym16_abstracts.pdf. [COBISS.SI-ID 67411203]

196. KOVAČ, Urša, ŽUŽEK, Zala, RASPOR DALL'OLIO, Lucija, POHAR, Katka, IHAN, Alojz, MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana, STARČIČ ERJAVEC, Marjanca. Escherichia coli affects expression of circadian clock genes in human hepatoma cells. Microorganisms. 2021, vol. 9, iss. 4, str. 1-14. ISSN 2076-2607. https://www.mdpi.com/2076-2607/9/4/869, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.3390/microorganisms9040869. [COBISS.SI-ID 61091843]

197. ŽUŽEK, Zala, KOVAČ, Urša, RASPOR DALL'OLIO, Lucija, POHAR, Katka, IHAN, Alojz, MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana, STARČIČ ERJAVEC, Marjanca. Escherichia coli affects expression of circadian clock genes in human hepatoma cells. V: Molecules of life : towards new horizons : FEBS 2021 : the 45th FEBS Congress : 3-8 July 2021, Ljubljana, Slovenia : virtual : abstracts. [S. l.]: Federation of European Biochemical Societies. 2021, [1] str. https://2021.febscongress.org/abstract_preview.aspx?idAbstractEnc=4424170095093094095096424170. [COBISS.SI-ID 69788163]

198. MOŠKON, Miha, PUŠNIK, Žiga, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha. Field-programmable biological circuits and configurable (bio)logic blocks for distributed biological computing. Computers in Biology and Medicine. [Print ed.]. Jan. 2021, vol. 128, str. 1-9, ilustr. ISSN 0010-4825. https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0010482520304406, DOI: 10.1016/j.compbiomed.2020.104109. [COBISS.SI-ID 37003267]

199. WALAKIRA, Andrew, ROZMAN, Damjana, REŽEN, Tadeja, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha. Guided extraction of genome-scale metabolic models for the integration and analysis of omics data. Computational and Structural Biotechnology Journal. 2021, vol. 19, str. 3521-3530, graf. prikazi. ISSN 2001-0370. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037021002476, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.csbj.2021.06.009. [COBISS.SI-ID 66227971]

200. MOŠKON, Miha (intervjuvanec). In Silico talks : an interview with prof. Miha Moškon professor at the Faculty of Computer and Information Science, University of Ljubljana. YouTube. 21. 7. 2021, 1 spletni vir (1 videodatoteka (7 min, 17 sek)). https://www.youtube.com/watch?v=3-46Mx9emmU. [COBISS.SI-ID 72203523]

201. PUŠNIK, Žiga, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Incorporation of motif information in the gene regulatory network inference. V: Lecture abstracts : [16th CFGBC Scientific Symposium : virtual symposium : Slovenia, June 17th, 2021. [Ljubljana: Faculty of Medicine, 2021]. Str. [24]. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/wp-content/uploads/2021cfgbcsym16_abstracts.pdf. [COBISS.SI-ID 70694403]

202. PUŠNIK, Žiga, MOŠKON, Miha. Integracija strukturnih omejitev pri izpeljavi gensko regulatornih omrežij. Uporabna informatika. [Tiskana izd.]. 2021, letn. 29, št. 1, str. 25-29, ilustr. ISSN 1318-1882. https://uporabna-informatika.si/index.php/ui/article/view/110, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 55284483]

203. ŠIRCELJ, Beno. Modeling of production processes with mathematical logic : master's thesis : the 2nd cycle master's study programme Computer and Information Science. Ljubljana: [B. Šircelj], 2021. XII, 39 str., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 69237507]

204. BLAGOTINŠEK COKAN, Kaja, PERŠE, Martina, JERUC, Jera, LORBEK, Gregor, URLEP, Žiga, SKUBIC, Cene, JUVAN, Peter, REŽEN, Tadeja, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, ESKILD, W., MATZ-SOJA, Madlen, SPINDELBÖCK, W., ROZMAN, Damjana. The molecular crosstalk between diminished cholesterol synthesis and chronic liver disease in mice and humans. FEBS open bio. 2021, vol. 11, suppl. 1, str. 502-503. ISSN 2211-5463. https://febs.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1002/2211-5463.13205. [COBISS.SI-ID 70069763]

205. RAVNIK, Šimen, ŽABKAR, Ines, PROSENC ZMRZLJAK, Uršula, JOVCHEVSKA, Ivana, ŠAMEC, Neja, MOŠKON, Miha, VIDETIČ PASKA, Alja. OligoPrime : an information system for oligonucleotide management. Biomedical engineering and computational biology. Sep. 2021, vol. 12, str. 1-9, ilustr. ISSN 1179-5972. https://journals.sagepub.com/doi/full/10.1177/11795972211041983, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1177/11795972211041983. [COBISS.SI-ID 75739139]

206. VELIKAJNE, Nina. Pregled in uporaba računskih metod za analizo ritmične pojavnosti dogodkov : diplomsko delo : univerzitetni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [N. Velikajne], 2021. 45 str., ilustr. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=124591&lang=slv, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 50587907]

207. VRANKAR, Matej. Razvoj aplikacije za izmenjavo sporočil na platformi Android : diplomsko delo : visokošolski strokovni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [M. Vrankar], 2021. VIII, 38 str., ilustr. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=124517&lang=slv, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 49218563]

208. MERHAR, Aleksander. Razvoj spletne aplikacije za analizo PCR podatkov : diplomsko delo : univerzitetni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [A. Merhar], 2021. 54 str., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 78909699]

209. MUNDA, Sergej. Spletna aplikacija za samodejno izdelavo sedežnih redov : diplomsko delo : univerzitetni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [S. Munda], 2021. 53 str., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 78211587]

210. SKUBIC, Cene, NASSIB, Petra, WALAKIRA, Andrew, VIČIČ, Žiga, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, ROZMAN, Damjana. Transcriptome landscape of HepG2 cells with deleted late genes of cholesterol synthesis : focus on RORC and the circadian clock. V: Molecules of life : towards new horizons : FEBS 2021 : the 45th FEBS Congress : 3-8 July 2021, Ljubljana, Slovenia : virtual : abstracts. [S. l.]: Federation of European Biochemical Societies. 2021, str. [1]. https://2021.febscongress.org/abstract_preview.aspx?idAbstractEnc=4424170094100096095093424170. [COBISS.SI-ID 75606787]

211. WALAKIRA, Andrew, SKUBIC, Cene, NADIŽAR, Nejc, ROZMAN, Damjana, REŽEN, Tadeja, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha. Cholesterol and vitamin E are important in hepatocellular carcinoma. V: NADIŽAR, Nejc (ur.). 17th CFGBC Symposium : book of abstracts : Hybrid Symposium Slovenia, 6th June 2022. Electronic version. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2022. Str. 51. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/wp-content/uploads/bookofabstracts_2022cfgbcsym17.pdf. [COBISS.SI-ID 117681155]

212. KOČAR, Eva, PUŠNIK, Žiga, SKUBIC, Cene, BOGOVIČ, Petra, TUREL, Gabriele, RESNIK, Nataša, STRLE, Franc, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana. Cholesterol-related sterols as early predictors of COVID-19 disease severity and their role in the SARS-COV-2 spike interaction. V: NADIŽAR, Nejc (ur.). 17th CFGBC Symposium : book of abstracts : Hybrid Symposium Slovenia, 6th June 2022. Electronic version. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2022. Str. 29. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/wp-content/uploads/bookofabstracts_2022cfgbcsym17.pdf. [COBISS.SI-ID 117653763]

213. JANEŽ, Miha, VEROVŠEK, Špela, ZUPANČIČ, Tadeja, MOŠKON, Miha. Citizen science for traffic monitoring : investigating the potentials for complementing traffic counters with crowdsourced data. Sustainability. Jan. 2022, vol. 14, iss. 2, str. 1-18, graf. prikazi. ISSN 2071-1050. https://www.mdpi.com/2071-1050/14/2/622, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.3390/su14020622. [COBISS.SI-ID 92616963]

214. VESTU, Arthur, ROLDAO, Lily-Jade, MOŠKON, Miha. Computational analysis of rhythmic data using RDA. V: ŽEMVA, Andrej (ur.), TROST, Andrej (ur.). Zbornik enaintridesete mednarodne Elektrotehniške in računalniške konference ERK 2022 = Proceedings of the 31st International Electrotechnical and Computer Science Conference ERK 2022 : Portorož, Slovenija, 19. - 20. september 2022. Ljubljana: Slovenska sekcija IEEE: Fakulteta za elektrotehniko, 2022. Str. 359-362, graf. prikazi. Zbornik ... Elektrotehniške in računalniške konference (Online), 31. ISSN 2591-0442. https://erk.fe.uni-lj.si/2022/erk22.pdf, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 122134019]

215. MOŠKON, Miha, PUŠNIK, Žiga, STANOVNIK, Lidija, ZIMIC, Nikolaj, MRAZ, Miha. A computational design of a programmable biological processor. Biosystems. [Print ed.]. Nov. 2022, vol. 221, str. 1-12, ilustr. ISSN 0303-2647. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0303264722001599?via%3Dihub, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.biosystems.2022.104778. [COBISS.SI-ID 120944131]

216. WALAKIRA, Andrew, OCIRA, Junior, DUROUX, Diane, FOULADI, Ramouna, MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana, VAN STEEN, Kristel. Detecting gene–gene interactions from GWAS using diffusion kernel principal components. BMC bioinformatics. 2022, vol. 23, str. 1-18, ilustr. ISSN 1471-2105. https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s12859-022-04580-7.pdf, DOI: 10.1186/s12859-022-04580-7. [COBISS.SI-ID 96240899]
projekt: financer: European Union’s FP7 PEOPLE; European Union’s Horizon 2020

217. ČELOFIGA, Andreja, KORES-PLESNIČAR, Blanka, KOPRIVŠEK, Jure, MOŠKON, Miha, BENKOVIČ, Dominik, GREGORIČ KUMPERŠČAK, Hojka. Effectiveness of de-escalation in reducing aggression and coercion in acute psychiatric units : a cluster randomized study. Frontiers in psychiatry. Apr. 2022, vol. 13, str. 1-14, ilustr. ISSN 1664-0640. https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fpsyt.2022.856153/full#fun1, https://doi.org/10.3389/fpsyt.2022.856153, Digitalna knjižnica Univerze v Mariboru – DKUM, DOI: 10.3389/fpsyt.2022.856153, DOI: 20.500.12556/DKUM-85257. [COBISS.SI-ID 104051971]
projekt: Raziskava je bila izvedena v okviru raziskovalnega projekta UKC Maribor (IRP 2018/1-09)

218. RASPOR DALL'OLIO, Lucija, ŽUŽEK, Zala, KOVAČ, Urša, MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana, STARČIČ ERJAVEC, Marjanca. Escherichia coli from gut microbiota affect human circadian clock. V: STOPNIŠEK, Nejc (ur.), JANEŽIČ, Sandra (ur.). 1st Slovenian Microbiome Network Symposium : November 24, 2022 Bled, Slovenia. Maribor: Nacionalni laboratorij za zdravje, okolje in hrano, 2022. Str. 48. ISBN 978-961-6148-19-1. https://slovenianmicrobiome.net/assets/abstractBook_final.pdf. [COBISS.SI-ID 132118275]

219. PUŠNIK, Žiga, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Evaluation of Boolean network inference approaches. V: NADIŽAR, Nejc (ur.). 17th CFGBC Symposium : book of abstracts : Hybrid Symposium Slovenia, 6th June 2022. Electronic version. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2022. Str. 39. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/wp-content/uploads/bookofabstracts_2022cfgbcsym17.pdf. [COBISS.SI-ID 111930627]

220. MOŠKON, Miha. GEMs and MEMs : interpreting transcriptomics data with genome-scale metabolic modelling in combination with model extraction methods. V: NADIŽAR, Nejc (ur.). 17th CFGBC Symposium : book of abstracts : Hybrid Symposium Slovenia, 6th June 2022. Electronic version. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2022. Str. 16. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/wp-content/uploads/bookofabstracts_2022cfgbcsym17.pdf. [COBISS.SI-ID 111926275]

221. REŽEN, Tadeja, MARTINS, Alexandre, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, ROZMAN, Damjana, MOŠKON, Miha. Integration of omics data to generate and analyse COVID-19 specific genome-scale metabolic models. Computers in Biology and Medicine. [Print ed.]. Jun. 2022, vol. 145, str. 1-10, ilustr. ISSN 0010-4825. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0010482522002207?via%3Dihub, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.compbiomed.2022.105428. [COBISS.SI-ID 102526467]

222. VEROVŠEK, Špela, JUVANČIČ, Matevž, PETROVČIČ, Simon, ZUPANČIČ, Tadeja, SVETINA, Matija, JANEŽ, Miha, PUŠNIK, Žiga, VELIKAJNE, Nina, MOŠKON, Miha. An integrative approach to neighbourhood sustainability assessments using publicly available traffic data. Computers, Environment and Urban Systems. [Print ed.]. Jul. 2022, vol. 95, str. 1-14, graf. prikazi. ISSN 0198-9715. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0198971522000497?via%3Dihub, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.compenvurbsys.2022.101805. [COBISS.SI-ID 105168387]

223. WALAKIRA, Andrew, SKUBIC, Cene, NADIŽAR, Nejc, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha, REŽEN, Tadeja, ROZMAN, Damjana. A meta-analysis to identify novel candidate genes in the development of hepatocellular carcinoma. V: ANGELI, Paolo (ur.). The International Liver Congress : savour science together again : ILC2022 : abstract book : 22-26 June 2022, London. Amsterdam: Elsevier, cop. 2022. Vol. 77, suppl. 1, str. s766-s767. Journal of hepatology (Online), Journal of hepatology. Supplement. ISSN 1600-0641, ISSN 0169-5185. https://www.journal-of-hepatology.eu/article/S0168-8278(22)01849-9/fulltext, DOI: 10.1016/S0168-8278(22)01849-9. [COBISS.SI-ID 117784323]

224. VEROVŠEK, Špela, JUVANČIČ, Matevž, PETROVČIČ, Simon, ZUPANČIČ, Tadeja, SVETINA, Matija, JANEŽ, Miha, PUŠNIK, Žiga, VELIKAJNE, Nina, MOŠKON, Miha. NSAPub : neighbourhood sustainability assessment using publicly available data. [S. l.: s. n.], 2022. 1 spletni vir. https://github.com/SusTra/NSAPub. [COBISS.SI-ID 94301699]

225. GRDADOLNIK, Aljaž. Pregled in primerjava metahevrističnih pristopov pri določanju dopustnih vrednosti parametrov dinamičnega sistema : diplomsko delo : univerzitetni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [A. Grdadolnik], 2022. 55 str., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 123601155]

226. MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. Programmable evolution of computing circuits in cellular populations. Neural computing & applications. Nov. 2022, vol. 34, iss. 21, str. 19239-19251, ilustr. ISSN 0941-0643. https://link.springer.com/article/10.1007/s00521-022-07532-7, DOI: 10.1007/s00521-022-07532-7. [COBISS.SI-ID 113756675]

227. PUŠNIK, Žiga, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. Review and assessment of Boolean approaches for inference of gene regulatory networks. Heliyon. Aug. 2022, vol. 8, iss. 8, str. 1-15, ilustr. ISSN 2405-8440. https://doi.org/10.1016/j.heliyon.2022.e10222, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.heliyon.2022.e10222. [COBISS.SI-ID 117893635]

228. VELIKAJNE, Nina, MOŠKON, Miha. RhythmCount : a Python package to analyse the rhythmicity in count data. Journal of computational science. Sep. 2022, vol. 63, str. 1-9, graf. prikazi. ISSN 1877-7503. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1877750322001429?via%3Dihub, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.jocs.2022.101758. [COBISS.SI-ID 114159363]

229. SMYK, Wiktor, KRUK, Beata, REŽEN, Tadeja, MOŠKON, Miha, WUNSCH, Ewa, LÜTJOHANN, Dieter, LAMMERT, Frank, MILKIEWICZ, Piotr, KRAWCZYK, Marcin. Serum sterols indicate modified cholesterol homeostasis in cirrhotic patients with PBC and correlate with response to treatment with ursodeoxycholic acid. V: ANGELI, Paolo (ur.). The International Liver Congress : savour science together again : ILC2022 : abstract book : 22-26 June 2022, London. Amsterdam: Elsevier, cop. 2022. Vol. 77, suppl. 1, str. s607-s608. Journal of hepatology (Online), Journal of hepatology. Supplement. ISSN 1600-0641, ISSN 0169-5185. https://www.journal-of-hepatology.eu/article/S0168-8278(22)01531-8/fulltext#relatedArticles, DOI: 10.1016/S0168-8278(22)01531-8. [COBISS.SI-ID 117775619]

230. ROZMAN, Damjana (intervjuvanec), REŽEN, Tadeja (intervjuvanec), ŽUPANIČ, Anže (intervjuvanec), GRUDEN, Kristina (intervjuvanec), DŽEROSKI, Sašo (intervjuvanec), MOŠKON, Miha (intervjuvanec). Sistemska biologija z matematičnimi orodji. Tromba : agencija za promocijo znanosti, kreativnosti in inovativnosti. 13. 10. 2022. ISSN 2350-5869. http://www.tromba.si/sistemska-biologija-z-matematicnimi-orodji/. [COBISS.SI-ID 125662467]

231. JANEŽ, Miha, VEROVŠEK, Špela, ZUPANČIČ, Tadeja, MOŠKON, Miha. TRACO : complementing traditional TRAffic COunter sources with emergent solutions. [S. l.: s. n.], 2022. 1 spletni vir. https://github.com/SusTra/TraCo. [COBISS.SI-ID 94304515]

232. KLINEC, Mimi. Agentno modeliranje dinamike tropov volkov v okolju NetLogo : diplomsko delo : univerzitetni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [M. Klinec], 2023. VIII, 67 str., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 164049155]

233. SEVČNIKAR, Lan, NASTRAN, Jurij, DROFENIK, Vito, TROBEC, Ana, VAJNGERL, Urška, KIFLE, Hana, PIVAŠ, Anja, KOVAČ, Luka, POPOVSKI, Damjan, JAN, Miha, HALUŽAN VASLE, Ana, REŽEN, Tadeja, STARČIČ ERJAVEC, Marjanca, MOŠKON, Stane, JUVANČIČ, Matevž, VEROVŠEK, Špela, MOŠKON, Miha. Analiza možnosti uporabe odprtih podatkov pri določanju okoljskih vplivov na razvoj bolezni. V: ŽEMVA, Andrej (ur.), TROST, Andrej (ur.). Zbornik dvaintridesete mednarodne Elektrotehniške in računalniške konference ERK 2023 = Proceedings of the 32nd International Electrotechnical and Computer Science Conference ERK 2023 : Portorož, Slovenija, 28. - 29. september 2023. Ljubljana: Slovenska sekcija IEEE: Fakulteta za elektrotehniko, 2023. Str. 297-300, ilustr. Zbornik ... Elektrotehniške in računalniške konference (Online), 32. ISSN 2591-0442. https://erk.fe.uni-lj.si/2023/papers/sevcnikar(analiza_moznosti).pdf. [COBISS.SI-ID 166169347]

234. TROBEC, Ana, VAJNGERL, Urška, KIFLE, Hana, PIVAŠ, Anja, NASTRAN, Jurij, SEVČNIKAR, Lan, KOVAČ, Luka, DROFENIK, Vito, POPOVSKI, Damjan, JAN, Miha, HALUŽAN VASLE, Ana, REŽEN, Tadeja, STARČIČ ERJAVEC, Marjanca, JUVANČIČ, Matevž, VEROVŠEK, Špela, MOŠKON, Miha. Assessing the application of open-source data in determining environmental health risks. V: HORVAT ZAGOREC, Monika (ur.), DLOUHY, Matjaž (ur.). Cutting Edge 2023 : Careers in science : [scientifc conference for young scientists] : 21. 09. 23 : book of abstracts. Ljubljana: Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo, 2023. Str. 31, graf. prikazi. ISBN 978-961-7078-40-4. http://www.cutting-edge.si/wp-content/uploads/2023/09/BoA-2023.pdf. [COBISS.SI-ID 165512195]

235. KOČAR, Eva, KATZ, Sonja, PUŠNIK, Žiga, BOGOVIČ, Petra, TUREL, Gabriele, SKUBIC, Cene, REŽEN, Tadeja, STRLE, Franc, MARTINS DOS SANTOS, Vitor A. P., MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana, et al. Assessing the potential of cholesterol-related sterols in predicting the progression of COVID-19 disease. V: SEPČIĆ, Kristina (ur.), PAVŠIČ, Miha (ur.). 15th Meeting of the Slovenian Biochemical Society with International Participation = 15. srečanje Slovenskega biokemijskega društva z mednarodno udeležbo : book of abstracts = zbornik povzetkov : Portorož, 20-23 September 2023 = [20.–23. september 2023, Portorož, Slovenija]. Ljubljana: Slovenian Biochemical Society: = Slovensko biokemijsko društvo, 2023. Str. 84. ISBN 978-961-95941-1-7. https://portoroz2023.sbd.si/upload/docs/SBD2023_Portoroz-Book_of_Abstracts.pdf. [COBISS.SI-ID 169015811]

236. MOŠKON, Miha, REŽEN, Tadeja. Context-specific genome-scale metabolic modelling and its application to the analysis of COVID-19 metabolic signatures. Metabolites. Jan. 2023, vol. 13, iss. 1, str. 1-28, ilustr. ISSN 2218-1989. https://www.mdpi.com/2218-1989/13/1/126, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.3390/metabo13010126. [COBISS.SI-ID 137763843]

237. KOČAR, Eva, KATZ, Sonja, PUŠNIK, Žiga, BOGOVIČ, Petra, TUREL, Gabriele, SKUBIC, Cene, REŽEN, Tadeja, STRLE, Franc, MARTINS DOS SANTOS, Vitor A. P., MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha (avtor, korespondenčni avtor), ROZMAN, Damjana (avtor, korespondenčni avtor), et al. COVID-19 and cholesterol biosynthesis : towards innovative decision support systems. iScience. [Online ed.]. 2023, vol. 26, iss. 10, [article no.] 107799, str. 1-16, ilustr. ISSN 2589-0042. https://www.cell.com/action/showPdf?pii=S2589-0042%2823%2901876-X, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.isci.2023.107799. [COBISS.SI-ID 165467907]

238. JERŠE, Maruša, KOČAR, Eva, SKUBIC, Cene, MOŠKON, Miha, ŠMON, Julija, DOLENC-GROŠELJ, Leja, ROZMAN, Damjana. Evaluating circadian rhythm disturbances in obstructive sleep apnea : molecular insights into circadian gene and hormone patterns. V: NADIŽAR, Nejc (ur.). 18th CFGBC Symposium : book of abstracts : Slovenia, 1st June 2023. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Medicine, 2023. Str. 33. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/wp-content/uploads/bookofabstracts_2023cfgbcsym18.pdf. [COBISS.SI-ID 160155395]

239. JERŠE, Maruša (avtor, korespondenčni avtor), KOČAR, Eva, SKUBIC, Cene, MOŠKON, Miha, ŠMON, Julija, DOLENC-GROŠELJ, Leja, ROZMAN, Damjana. Exploring circadian rhythm disturbances in obstructive sleep apnea : identification of molecular biomarkers from buffy coat and plasma using RNA expression analysis and LC-MS. V: GORIČAR, Katja (ur.), et al. Biochemistry and molecular genetics in medicine : Scientific Symposium with International Participation on the Occasion of the 50th Anniversary of the Institute of Biochemistry and Molecular Genetics (1972-2022) and the 30th Anniversary of the Medical Centre for Molecular Biology (1992-2022) at the Faculty of Medicine, University of Ljubljana : 6.-7. 7. 2023, Large lecture hall, Faculty of Medicine, Korytkova 2, Ljubljana. Electronic version. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2023. Str. 55-56. ISBN 978-961-267-243-0. https://www.mf.uni-lj.si/application/files/6516/8858/1409/Biochemistry_and_Molecular_Genetics_in_Medicine_proceedings.pdf. [COBISS.SI-ID 159963651]

240. TROBEC, Ana, VAJNGERL, Urška, KIFLE, Hana, PIVAŠ, Anja, NASTRAN, Jurij, SEVČNIKAR, Lan, KOVAČ, Luka, DROFENIK, Vito, POPOVSKI, Damjan, JAN, Miha, HALUŽAN VASLE, Ana, REŽEN, Tadeja, STARČIČ ERJAVEC, Marjanca, JUVANČIČ, Matevž, VEROVŠEK, Špela, MOŠKON, Miha. Health, environmental and urban databases for integrative data analysis of health risk assessment. V: NADIŽAR, Nejc (ur.). 18th CFGBC Symposium : book of abstracts : Slovenia, 1st June 2023. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Medicine, 2023. Str. 51. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/wp-content/uploads/bookofabstracts_2023cfgbcsym18.pdf. [COBISS.SI-ID 159463683]

241. HALUŽAN VASLE, Ana, MOŠKON, Miha. The hitchhiker's guide to synthetic biological neural networks. V: NADIŽAR, Nejc (ur.). 18th CFGBC Symposium : book of abstracts : Slovenia, 1st June 2023. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Medicine, 2023. Str. 32. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/wp-content/uploads/bookofabstracts_2023cfgbcsym18.pdf. [COBISS.SI-ID 157409283]

242. MOŠKON, Miha, REŽEN, Tadeja, JUVANČIČ, Matevž, VEROVŠEK, Špela. Integrative analysis of rhythmicity : from biology to urban environments and sustainability. International journal of environmental research and public health. [Online ed.]. Jan. 2023, vol. 20, iss. 1, str. 1-13, ilustr. ISSN 1660-4601. https://www.mdpi.com/1660-4601/20/1/764, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.3390/ijerph20010764. [COBISS.SI-ID 135829507]

243. WALAKIRA, Andrew (avtor, korespondenčni avtor), SKUBIC, Cene, NADIŽAR, Nejc, ROZMAN, Damjana, BREZNIK, Barbara, REŽEN, Tadeja, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha. Integrative computational modeling to identify genes relevent in hepatocellular carcinoma. V: GORIČAR, Katja (ur.), et al. Biochemistry and molecular genetics in medicine : Scientific Symposium with International Participation on the Occasion of the 50th Anniversary of the Institute of Biochemistry and Molecular Genetics (1972-2022) and the 30th Anniversary of the Medical Centre for Molecular Biology (1992-2022) at the Faculty of Medicine, University of Ljubljana : 6.-7. 7. 2023, Large lecture hall, Faculty of Medicine, Korytkova 2, Ljubljana. Electronic version. Ljubljana: Faculty of Medicine, 2023. Str. 82-83. ISBN 978-961-267-243-0. https://www.mf.uni-lj.si/application/files/6516/8858/1409/Biochemistry_and_Molecular_Genetics_in_Medicine_proceedings.pdf. [COBISS.SI-ID 169009923]

244. WALAKIRA, Andrew, SKUBIC, Cene, NADIŽAR, Nejc, ROZMAN, Damjana, REŽEN, Tadeja, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha. Integrative computational modeling to unravel novel potential biomarkers in hepatocellular carcinoma. Computers in biology and medicine. Jun. 2023, vol. 159, str. [1]-12, ilustr. ISSN 1879-0534. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0010482523004225?via%3Dihub, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.compbiomed.2023.106957. [COBISS.SI-ID 152497155]

245. KOČAR, Eva, KATZ, Sonja, PUŠNIK, Žiga, BOGOVIČ, Petra, TUREL, Gabriele, SKUBIC, Cene, REŽEN, Tadeja, STRLE, Franc, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana, et al. Intracellular cholesterol synthesis in COVID-19. V: NADIŽAR, Nejc (ur.). 18th CFGBC Symposium : book of abstracts : Slovenia, 1st June 2023. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Medicine, 2023. Str. 24. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/wp-content/uploads/bookofabstracts_2023cfgbcsym18.pdf. [COBISS.SI-ID 160152067]

246. Metabolites. MOŠKON, Miha (gostujoči urednik 2022-2023). Basel: MDPI AG, 2011-. ISSN 2218-1989. http://www.mdpi.com/journal/metabolites, http://www.e-helvetica.nb.admin.ch/directAccess?callnumber=bel-217885. [COBISS.SI-ID 523274009]

247. MOŠKON, Miha. A modeler’s perspective on the design and analysis of biological systems : from synthetic biology to systems medicine applications. V: SEPČIĆ, Kristina (ur.), PAVŠIČ, Miha (ur.). 15th Meeting of the Slovenian Biochemical Society with International Participation = 15. srečanje Slovenskega biokemijskega društva z mednarodno udeležbo : book of abstracts = zbornik povzetkov : Portorož, 20-23 September 2023 = [20.–23. september 2023, Portorož, Slovenija]. Ljubljana: Slovenian Biochemical Society: = Slovensko biokemijsko društvo, 2023. Str. 10. ISBN 978-961-95941-1-7. https://portoroz2023.sbd.si/upload/docs/SBD2023_Portoroz-Book_of_Abstracts.pdf. [COBISS.SI-ID 165732099]

248. POLYCHRONOPOULOS, Dimitris (intervjuvanec), MOŠKON, Miha (intervjuvanec), MENG, Jia (intervjuvanec), ROHWER, Johann (intervjuvanec), SHAW, Timothy (intervjuvanec), IBRAHIM, Bashar (intervjuvanec), KESARWANI, Anil (intervjuvanec), SUBRAMANIAN, Sri Krishna (intervjuvanec). Peer review week 2023 : views on the future of code peer review. BMC Series blog. 27. sep. 2023, fotogr. https://blogs.biomedcentral.com/bmcseriesblog/2023/09/27/peer-review-week-2023-views-on-the-future-of-code-peer-review/. [COBISS.SI-ID 167103235]

249. WALAKIRA, Andrew. Personalized molecular signatures for modulating metabolic associated fatty liver disease and hepatocellular carcinoma : doctoral dissertation = Personalizirani molekulski označevalci za modulacijo s presnovo povezane bolezni zamaščenih jeter in hepatocelularnega karcinonoma [!] : doktorska disertacija. Ljubljana: [A. Walakira], 2023. VII, 88 f., ilustr. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=153384&lang=slv. [COBISS.SI-ID 182093827]

250. VEROVŠEK, Špela, ZUPANČIČ, Tadeja, JUVANČIČ, Matevž, AŽMAN MOMIRSKI, Lučka, JANEŽ, Miha, MOŠKON, Miha. Repurposing open traffic data for estimating the mobility performance. V: NATHANAIL, Eftihia G. (ur.). Smart energy for smart transport : proceedings of the 6th Conference on Sustainable Urban Mobility, CSUM2022, August 31–September 2, 2022, Skiathos Island, Greece. Cham: Springer, cop. 2023. Str. 542-555, ilustr. Lecture notes in intelligent transportation and infrastructure (Online). ISBN 978-3-031-23721-8. ISSN 2523-3459. https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-031-23721-8_45, DOI: 10.1007/978-3-031-23721-8_45. [COBISS.SI-ID 144897283]

251. HALUŽAN VASLE, Ana, MOŠKON, Miha. Sinteznobiološke nevronske mreže. V: HOSTNIK, Maja (ur.), et al. Četrti Doktorski dan Bi(o)znanosti? : zbornik povzetkov : [7. junij 2023, Biotehniška fakulteta]. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, 2023. Str. 1-2. ISBN 978-961-6379-78-6. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=146447. [COBISS.SI-ID 157408515]

252. ROZMAN, Damjana, WALAKIRA, Andrew, SKUBIC, Cene, NADIŽAR, Nejc, REŽEN, Tadeja, BLAGOTINŠEK COKAN, Kaja, KOČAR, Eva, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha. Unraveling potential biomarkers of metabolism associated liver disease and hepatocellular carcinoma : oral presentation at 2023 Joint Meeting of the 23rd International Conference on Cytochrome P450 and the 38th Annual Meeting of the Japanese Society for the Study of Xenobiotics in Shizuoka, September 25th - 29th, 2023, Shizuoka, Japan. [COBISS.SI-ID 203610115]

253. ROZMAN, Damjana, WALAKIRA, Andrew, SKUBIC, Cene, NADIŽAR, Nejc, REŽEN, Tadeja, BLAGOTINŠEK COKAN, Kaja, KOČAR, Eva, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha. Unraveling potential biomarkers of metabolism associated liver disease and hepatocellular carcinoma. V: Discovering new knowledge and technology in life sciences and drug discovery : learning from the past, knowing the future : program & abstracts. Shizuoka: Laboratory of Molecular Toxicology, School of Pharmaceutical Sciences, University of Shizuoka, 2023. Str. 422. https://www.2023iccp450-jssx.org/abstract/2023_ICCP450_JSSX_abstract.pdf. [COBISS.SI-ID 187493635]

254. MAROLT, Nika. Analiza prometnih omrežij z uporabo računskih pristopov za analizo presnovnih omrežij : diplomsko delo : univerzitetni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [N. Marolt], 2024. 57 str., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 184557827]

255. KOCMUT, Urban. Avtomatizirano določanje optimalnega števila komponent pri analizi ritmičnih podatkov z modelom cosinor : magistrsko delo : magistrski študijski program druge stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [U. Kocmut], 2024. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (72 str.)), ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 217047043]

256. MOŠKON, Miha, KOVAČ, Urša, RASPOR DALL'OLIO, Lucija, GERŠAK, Ksenija, KAVŠEK, Gorazd, BOJC, Eva, TROJNER-BREGAR, Andreja (avtor, korespondenčni avtor), ROZMAN, Damjana (avtor, korespondenčni avtor). Circadian characteristics of term and preterm labors. Scientific reports. 2024, vol. 14, iss. 1, [article no.] 4033, str. 1-12, ilustr. ISSN 2045-2322. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10850119/pdf/41598_2024_Article_53754.pdf, https://www.nature.com/articles/s41598-024-54490-2, DOI: 10.1038/s41598-024-54490-2. [COBISS.SI-ID 187262467]
projekt: P3-0124, P1-0390, P2-0359; financer: Slovenian Research Agency
projekt: J1-50024, J1-9176; financer: Slovenian Research Agency
projekt: I0-0022; financer: MRIC-UL-ELIXIR

257. REŽEN, Tadeja, MARTINS, Alexandre, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, ROZMAN, Damjana, MOŠKON, Miha (avtor, korespondenčni avtor). Corrigendum to "Integration of omics data to generate and analyse COVID-19 specific genome-scale metabolic models" [Comput. Biol. Med. 145 (2022) 105428]. Computers in biology and medicine. Avg. 2024, vol. 178, [article no.] 108713, str. 1-3, ilustr. ISSN 1879-0534. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0010482524007984?via%3Dihub, DOI: 10.1016/j.compbiomed.2024.108713. [COBISS.SI-ID 206737155]

258. VEROVŠEK, Špela, HALUŽAN VASLE, Ana, MOŠKON, Miha. Data-driven classification of urban environments for customized assessments and decision-making. V: GOSPODINI, Aspa (ur.). Book of abstracts of the International conference on changing cities VI, Rhodes Island, Greece, June 24-28, 2024 : spatial, design, landscape, heritage & socio-economic dimensions. Volos: Laboratory of Urban Morphology & Design, Department of Planning and Regional Development, University of Thessaly, cop. 2024. Str. 125. Proceedings of the international conference on changing cities. ISBN 978-618-5765-03-3. ISSN 2654-0460. https://uthnoc-my.sharepoint.com/personal/umlab_o365_uth_gr/_layouts/15/onedrive.aspx?ga=1&id=%2Fpersonal%2Fumlab%5Fo365%5Futh%5Fgr%2FDocuments%2FCCVI%5F2024%2FCCVI%5F2024%5FE%2Dbooks%2FCCVI%5F2024%5FBOOK%20of%20ABSTRACTS%5FNEW%2Epdf&parent=%2Fpersonal%2Fumlab%5Fo365%5Futh%5Fgr%2FDocuments%2FCCVI%5F2024%2FCCVI%5F2024%5FE%2Dbooks. [COBISS.SI-ID 214997507]

259. VEROVŠEK, Špela, HALUŽAN VASLE, Ana, MOŠKON, Miha. Data-driven classification of urban environments for customized assessments and decision-making. V: GOSPODINI, Aspa (ur.). Proceedings of the International Conference on Changing Cities VI, Rhodes, 24-28 June, 2024 : spatial, design, landscape, heritage & socio-economic dimensions. Volos: University of Thessaly, Department of Planning and Regional Development, Research Unit of Urban Morphology and Design, cop. 2024. Str. 638-648, ilustr. Proceedings of the international conference on changing cities. ISBN 978-618-5765-02-6. ISSN 2654-0460. https://changingcities.prd.uth.gr/cc/. [COBISS.SI-ID 215165443]

260. NAHTIGAL, Katarina, SKUBIC, Cene, KREFT, Tinkara, HALUŽAN VASLE, Ana, MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha, DOLENC-GROŠELJ, Leja, ROZMAN, Damjana, 27th Congress of the European Sleep Research Society, 24-27 September 2024, Seville, Spain. Determination of reference genes for circadian studies from human thrombocyte-leukocyte layer in patients with obstructive sleep apnea. Journal of sleep research. Sep. 2024, vol. 33, iss. s1, [article no.] e14293, str. 41. ISSN 0962-1105. https://onlinelibrary.wiley.com/toc/13652869/2024/33/S1. [COBISS.SI-ID 211971843]

261. KOČAR, Eva, KATZ, Sonja, PUŠNIK, Žiga, BOGOVIČ, Petra, TUREL, Gabriele, SKUBIC, Cene, REŽEN, Tadeja, STRLE, Franc, MARTINS DOS SANTOS, Vitor A. P., MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana, et al. Examining the predictive value of cholesterol-related sterols in COVID-19 disease progression. V: SBMC 2024 : translating systems medicine into the clinics : abstractbook. Leipzig: HITS gGmbH, 2024. Str. 105. [COBISS.SI-ID 198384899]

262. STANOVNIK, Lidija, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. In search of maximum non-overlapping codes. Designs, codes and cryptography. May 2024, vol. 92, iss. 5, str. 1299-1326, tabela. ISSN 0925-1022. https://link.springer.com/article/10.1007/s10623-023-01344-z, DOI: 10.1007/s10623-023-01344-z. [COBISS.SI-ID 180170755]

263. MOŠKON, Miha (avtor, korespondenčni avtor), REŽEN, Tadeja. Integration and analysis of Omics data using genome-scale metabolic models. Metabolites. 2024, vol. 14, no. 11, [article no.] 595, str. 1-3. ISSN 2218-1989. https://www.mdpi.com/2218-1989/14/11/595, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.3390/metabo14110595. [COBISS.SI-ID 216641795]
projekt: P2-0359, P1-0390, J1-50024; financer: Slovenian Research Agency

264. NASTRAN, Jurij. Integration and analysis of scRNAseq data using genome-scale metabolic models : master's thesis : the 2nd cycle master's study programme Computer and Information Science. Ljubljana: [J. Nastran], 2024. VI, 67 str., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 195566595]

265. KOČAR, Eva, KATZ, Sonja, PUŠNIK, Žiga, SKUBIC, Cene, REŽEN, Tadeja, MARTINS DOS SANTOS, Vitor A. P., MRAZ, Miha, MOŠKON, Miha (avtor, korespondenčni avtor), ROZMAN, Damjana (avtor, korespondenčni avtor). Integrative protocol for quantifying cholesterol-related sterols in human serum samples and building decision support systems. STAR protocols. Jul. 2024, vol. 5, iss. 3, [article no.]103213, str. 1-23, ilustr. ISSN 2666-1667. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2666166724003782?via%3Dihub, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.xpro.2024.103213. [COBISS.SI-ID 206706435]

266. MOŠKON, Miha, WALAKIRA, Andrew, SKUBIC, Cene, NADIŽAR, Nejc, REŽEN, Tadeja, MRAZ, Miha, ROZMAN, Damjana. Molecular signatures of liver metabolism : an integrative analysis. V: NADIŽAR, Nejc (ur.). 19th CFGBC Symposium : book of abstracts : Slovenia, 6th June 2024. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Medicine, 2024. Str. 19. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/wp-content/uploads/bookofabstracts_2024cfgbcsym19.pdf. [COBISS.SI-ID 205050371]

267. DORN, Jakob. Napadi DMA na operacijske sisteme Windows : diplomsko delo : visokošolski strokovni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [J. Dorn], 2024. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (68 str.)), ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 208252419]

268. KNIFIC, Jernej. Ocenjevanje kakovosti bivanja na izbrani lokaciji glede na uporabnikove preference : diplomsko delo : univerzitetni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [J. Knific], 2024. 37 str., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 189195267]

269. VELIKAJNE, Nina. Pregled in uporaba metod za populacijsko analizo ritmičnosti : magistrsko delo : magistrski študijski program druge stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [N. Velikajne], 2024. 61 str., graf. prikazi. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 191044611]

270. BERNARD, Jaka. Pregled, implementacija in ovrednotenje metod za predprocesiranje ritmičnih podatkov : magistrsko delo : magistrski študijski program druge stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [J. Bernard], 2024. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (102 str.)), graf. prikazi. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 215098371]

271. JERŠE, Maruša, KOČAR, Eva, SKUBIC, Cene, MOŠKON, Miha, ŠMON, Julija, DOLENC-GROŠELJ, Leja, ROZMAN, Damjana. Primerjava biokemijskih in kliničnih označevalcev za opredelitev motenj cirkadianega ritma pri bolnikih z obstruktivno apnejo v spanju = Comparison of biochemical and clinical markers to identify circadian rhythm disturbances in patients with obstructive sleep apnoea. V: BREGAR, Manca (ur.). Študentski medicinski raziskovalni kongres 2024 : [zbornik predavanj]. Ljubljana: Medicinski razgledi, 2024. Str. 63-64. Medicinski razgledi, Supplement, letn. 63, supl. 1. ISSN 0353-3484. https://medrazgl.si/arhiv/SMRK-2024.pdf. [COBISS.SI-ID 204087811]

272. RATEJ, Luka. Primerjava prometnih trendov na podlagi računskih analiz štetja prometa : diplomsko delo : visokošolski strokovni študijski program Računalništvo in informatika. Ljubljana: [L. Ratej], 2024. 49 str., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 189018115]

273. ŠKOF, Živa. Pristopi za avtomatizirano analizo metabolnih modelov na nivoju genoma : magistrsko delo : magistrski študijski program druge stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [Ž. Škof], 2024. 42 str., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 200780547]

274. HALUŽAN VASLE, Ana, MOŠKON, Miha. Računsko ogrodje za računanje z biološkimi rezervoarji. V: BRAJNIK KOVAČIČ, Zala (ur.), et al. Peti Doktorski dan Bi(o)znanosti? : zbornik povzetkov : [5. junij 2024, Biotehniška fakulteta]. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, 2024. Str. 3-5. ISBN 978-961-6379-87-8. https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?id=185855&lang=slv. [COBISS.SI-ID 197934083]

275. PUŠNIK, Žiga, MRAZ, Miha, ZIMIC, Nikolaj, MOŠKON, Miha. SAILoR : structure-aware inference of logic rules. PloS one. Jun. 2024, vol. 19, iss. 6, [article no. e0304102], str. 1-29, ilustr. ISSN 1932-6203. https://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0304102, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1371/journal.pone.0304102. [COBISS.SI-ID 198615043]

276. NAHTIGAL, Katarina, MATIJAŠIĆ, Lucija, KREFT, Tinkara, SKUBIC, Cene, HALUŽAN VASLE, Ana, MOŠKON, Miha, DOLENC-GROŠELJ, Leja, ROZMAN, Damjana. Selection of reference genes for circadian studies of obstructive sleep apnea. V: NADIŽAR, Nejc (ur.). 19th CFGBC Symposium : book of abstracts : Slovenia, 6th June 2024. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Medicine, 2024. Str. 40. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/wp-content/uploads/bookofabstracts_2024cfgbcsym19.pdf. [COBISS.SI-ID 205833731]
projekt: P1-0390, J1-50024; financer: Slovenian Research Agency (ARRS)

277. HALUŽAN VASLE, Ana, MOŠKON, Miha. Synthetic biological neural networks : from current implementations to future perspectives. Biosystems. [Print ed.]. Mar. 2024, vol. 237, [article no.] 105164, str. 1-11, ilustr. ISSN 0303-2647. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0303264724000492?via%3Dihub, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.biosystems.2024.105164. [COBISS.SI-ID 187310083]

278. ROZMAN, Damjana, KOČAR, Eva, WALAKIRA, Andrew, SKUBIC, Cene, REŽEN, Tadeja, PUŠNIK, Žiga, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha, KATZ, Sonja, MARTINS DOS SANTOS, Vitor A. P., BOGOVIČ, Petra, TUREL, Gabriele, STRLE, Franc, et al. Targeted omics for innovative decision suport system examples of COVID-19 and liver cancer. V: Microsomes and drug oxidations : from structures to regulations and modeling : program and book of abstracts. The 25th International Symposium on Microsomes and Drug Oxidations (MDO2024), July 7 - 10, 2024, Prague. Prague: MDO, 2024. Str. 1. [COBISS.SI-ID 203606531]
projekt: P1-0390, P2-0359, P3-0296, IP-0022 (CFGBC); financer: Slovenian Research and Innovation Agency
projekt: #860895; financer: H2020 Tran SYS

279. REŽEN, Tadeja, WALAKIRA, Andrew, MRAZ, Miha, ROZMAN, Damjana, MOŠKON, Miha. Towards a protocol for a reconstruction of context-specific genome-scale metabolic models of mammalian cells. V: SBMC 2024 : translating systems medicine into the clinics : abstractbook. Leipzig: HITS gGmbH, 2024. Str. 75-76. [COBISS.SI-ID 198384643]

280. KOČAR, Eva, REŽEN, Tadeja, GIRAUDI, Pablo J., PALMISANO, Silvia, TIRIBELLI, Claudio, ROSSO, Natalia, MOŠKON, Miha, ROZMAN, Damjana. Transcriptomic insights into non-alcoholic fatty liver disease : strategies for therapeutic interventions. V: NADIŽAR, Nejc (ur.). 19th CFGBC Symposium : book of abstracts : Slovenia, 6th June 2024. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Medicine, 2024. Str. 34. http://cfgbc.mf.uni-lj.si/wp-content/uploads/bookofabstracts_2024cfgbcsym19.pdf. [COBISS.SI-ID 206009603]
projekt: P1-0390 and Ph. D. grant for young researchers; financer: Slovenian Research and Innovation Agency (ARIS)

281. POPOVIĆ, Maks. Uporabniški vmesnik za upravljanje z datotekami in izvajanje analiz na visoko zmogljivih sistemih : diplomsko delo : visokošolski strokovni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [M. Popović], 2024. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (50 str.)), ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 212688899]

282. BMC bioinformatics. MOŠKON, Miha (področni urednik 2022-). London: BioMed Central, 2000-. ISSN 1471-2105. http://www.biomedcentral.com/1471-2105. [COBISS.SI-ID 2433556]

283. Neural computing & applications. MOŠKON, Miha (član uredniškega odbora 2020-). Berlin: Springer.; New York: Springer.; Godalming: Springer. ISSN 1433-3058. http://link.springer.de/link/service/journals/00521/index.htm, http://link.springer-ny.com/link/service/journals/00521/index.htm. [COBISS.SI-ID 512029977]

284. FERLAN KOVIČ, Maj. Odkrivanje vzorcev na podlagi tekstovnih in finančnih podatkov letnih poročil podjetij : diplomsko delo : visokošolski strokovni študijski program prve stopnje Računalništvo in informatika. Ljubljana: [M. Ferlan Kovič], 2025. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (33 str.)), ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 228999939]

285. STANOVNIK, Lidija, MOŠKON, Miha, MRAZ, Miha. On maximal almost balanced non-overlapping codes and non-overlapping codes with restricted run-lengths. Computational & Applied Mathematics. Feb. 2025, vol. 44, iss. 1, article no. 109, str. 1-19. ISSN 2238-3603. https://link.springer.com/article/10.1007/s40314-024-03055-0, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1007/s40314-024-03055-0. [COBISS.SI-ID 225011203]

286. Scientific reports. MOŠKON, Miha (član uredniškega odbora 2025-). London: Nature Publishing Group, 2011-. ISSN 2045-2322. http://www.nature.com/srep/index.html. [COBISS.SI-ID 18727432]

Miha Moškon

Osebna bibliografija za obdobje 2006-2025

2006

2007

2008

2009

2010

2011

2012

2013

2014

2015

2016

2017

2018

2019

2020

2021

2022

2023

2024

2025