David Stopar

1. STOPAR, David, MAHNE, Ivan, MEGUŠAR, France. Decomposition rates of desintegrated wood residues in soil. V: STEINER, W... (ur.), HALTRICH, D... (ur.). Biotechnology in central European initiative countries : (formerly "Hexagonal" Countries) : [The first Conference on Biotechnology in Central European Initiative Countries], Graz, Austria - 13-15 April 1992. The first Conference on Biotechnology in Central European Initiative Countries, Graz, 13-15 April, 1992. Vienna: Federal Ministry for Science and Research, 1992. Str. p19. [COBISS.SI-ID 939128]

2. MAHNE, Ivan, STOPAR, David, MEGUŠAR, France. Microbes and defixation of clay fixed ammonium in a short term experiment. V: Sixth International Symposium on Microbial Ecology : (ISME-6) : Barcelona, 6-11 september 1992 : abstracts. Barcelona: [s. n.], 1992. Str. 290, p2-11-09. [COBISS.SI-ID 1209208]

3. STOPAR, David. Udeleženost mikroorganizmov pri sproščanju težje izmenljivega (fiksiranega) amonijskega dušika : diplomska naloga = Participation of microorganisms in release of heavily exchangeable (fixed) ammonium nitrogen in incubated soil : graduation thesis. Ljubljana: [BF, Oddelek za agronomijo]: [D. Stopar], 1992. VIII, 59 f., graf. prikazi, tabele. [COBISS.SI-ID 2268024]

4. STOPAR, David, HEMMINGA, Marcus A. Interakcije plaščnega proteina z lipidi membrane pri oblačenju DNA faga M13 = Membrane lipid-protein interactions in phage M13 assembly process. V: Knjiga povzetkov s programom = Book of abstracts with the program. 1. slovenski mikrobiološki kongres z mednarodno udeležbo, Bled, 24.-27. oktober 1993. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 1993. Str. p5-18. [COBISS.SI-ID 1237368]

5. UITDEHAAG, Joost C. M. The interaction of M13 coat protein and viral DNA during virus assembly. Wageningen: Agricultural University, Department of Molecular Physics, 1994. 32 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 1978232]

6. STOPAR, David, UITDEHAAG, Joost C. M., SPRUIJT, Ruud B., WOLFS, Cor J. A. M., HEMMINGA, Marcus A. Location of the water membrane interface at the C-terminal part of M13 major coat protein. V: XVI th International Conference on Magnetic Resonance in Biological Sistems (ICMRBS), Veldhoven, The Netherlands, August 14 -19, 1994 : book of abstracts. Utrecht: [s. n.], 1994. Str. e28. [COBISS.SI-ID 1982584]

7. STOPAR, David, UITDEHAAG, Joost C. M., SPRUIJT, Ruud B., WOLFS, Cor J. A. M., HEMMINGA, Marcus A. Structure and dynamics of bacteriophage M13 major coat protein in a membrane bound form. V: Abstracts of papers presented at the 1995 meeting on Molecular genetics of bacteria & phages, august 22-august 27, 1995. Cold Spring Harbor; New York: Cold Spring Harbor Laboratory, 1995. Str. 231. [COBISS.SI-ID 1979768]

8. STOPAR, David, UITDEHAAG, Joost C. M., SPRUIJT, Ruud B., WOLFS, Cor J. A. M., HEMMINGA, Marcus A. Structure and dynamics of bacteriophage M13 major coat protein in a membrane bound form = Struktura in dinamika glavnega plaščnega proteina bakteriofaga M13 v membranskem okolju. V: VEBER, Marjan (ur.). 9. simpozij "Spektroskopija v teoriji in praksi" : [zbornik povzetkov] : Bled, 10.-13. april 1995 = 9th symposium 'Spectroscopy in theory and practice' : [abstracts]. [Ljubljana]: Slovensko kemijsko društvo, Spektroskopska sekcija, 1995. Str. 62, r-34. [COBISS.SI-ID 1977976]

9. STOPAR, David. Struktura in dinamika glavnega plaščnega proteina bakteriofaga M13 : magistrsko delo = Structure and dynamics of bacteriophage M13 major coat protein : master of science thesis. Ljubljana: [D. Stopar], 1995. XI, 38 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Ljubljana, Magistrska dela, 58. [COBISS.SI-ID 12151]

10. STOPAR, David, SPRUIJT, Ruud B., WOLFS, Cor J. A. M., HEMMINGA, Marcus A. ESR studies of spin-labeled major coat protein mutants of bacteriophage M13 in lipids and detergents. V: NOBLE, D... (ur.), BLUNDELL, T... L. (ur.), PAWSON, T... (ur.). 12th International Biophysics Congress abstracts : supplement to Progress in biophysics and molecular biology : 12 International Biophysics Congress, 11-16 august 1996, amsterdam, The Netherlands : IUPAB 1996, Amsterdam. Oxford; Tarrytown: Elsevier Science, 1996. Str. 126, p-c4-37. Progress in biophysics & molecular biology, vol. 65, suppl. 1. ISSN 0079-6107. [COBISS.SI-ID 1979256]

11. STOPAR, David, SPRUIJT, Ruud B., WOLFS, Cor J. A. M., HEMMINGA, Marcus A. ESR studies of spin-labeled major coat protein mutants of bacteriophage M13 in lipids and detergents. V: SON - Werkgemeenschap voor Eiwitonderzoek = Association of Netherland Researchers, Working group for proteins : programme of the Lunteren Meeting, the Netherlands, December 9-10, 1996. Lunteren: [s.n.], 1996. Str. [1]. [COBISS.SI-ID 1982072]

12. STOPAR, David, SPRUIJT, Ruud B., WOLFS, Cor J. A. M., HEMMINGA, Marcus A. Local dynamics of the M13 major coat protein in different membrane-mimicking systems. Biochemistry. [Print ed.]. 1996, vol. 35, no. 48, str. 15467-15473. ISSN 0006-2960. [COBISS.SI-ID 1879160]

13. STOPAR, David. Lokacija proteinov v biomembrani: plaščni protein bakteriofaga M13, kot modelni sistem : predavanje v okviru seminarja Odseka za fiziko trdne snovi Instituta Jožef Stefan (EPR centra), 20.12.1996. Ljubljana: Institut Jožef Stefan, EPR Center, 1996. [COBISS.SI-ID 2257784]

14. STOPAR, David, SPRUIJT, Ruud B., WOLFS, Cor J. A. M., HEMMINGA, Marcus A. In situ aggregational state of M13 bacteriophage major coat protein in sodium cholate and lipid bilayers. Biochemistry. [Print ed.]. 1997, vol. 36, str. 12268-12275. ISSN 0006-2960. [COBISS.SI-ID 1977464]

15. STOPAR, David, JANSEN, Kitty A. J., PÁLI, Tibor, MARSH, Derek, HEMMINGA, Marcus A. Membrane location of spin-labeled M13 major coat protein mutants determined by paramagnetic relaxation agents. Biochemistry. [Print ed.]. 1997, 36, str. 8261-8268. ISSN 0006-2960. [COBISS.SI-ID 1977208]

16. STOPAR, David, SPRUIJT, Ruud B., WOLFS, Cor J. A. M., HEMMINGA, Marcus A. Pre-assembly states M13 major coat protein. V: Research conference on The molecular basis of biological membrane protein structure and function : Albufeira (Algarve, Portugal) april 19th - 24th 1997 : program, poster, workshop & posterabstracts. Albufeira: European Science Foundation, 1997. Str. [47]. European research conferences. [COBISS.SI-ID 1978744]

17. STOPAR, David. Structure-function relationship of viral coat proteins : a site-directed spectroscopic study of M13 coat protein : [dissertation thesis]. Wageningen: [D. Stopar], 1997. 102 str., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Ljubljana, Doktorske disertacije, 51. ISBN 90-5485-773-0. [COBISS.SI-ID 2013560]

18. STOPAR, David, MAHNE, Ivan, MEGUŠAR, France. Ammonium recovery from clay fixed pool - a stable 15N isotope study. V: European Society for New Methods in Agricultural Research (ESNA) XXVIIIth Annual Meeting and International Union of Radioecology (IUR) Working Group Soil-to-Plant Transfer Annual Meeting, 26th - 29th August 1998, Brno, Czech Republic. Brno: Mendel University of Agricultural and Foresty, 1998. Str. 189. ISBN 80-7157-316-7. [COBISS.SI-ID 2104696]

19. STOPAR, David, SPRUIJT, Ruud B., WOLFS, Cor J. A. M., HEMMINGA, Marcus A. Conformational states of the major coat protein of bacteriophage M13 prior to the assembly. V: American Society for Virology, 17th annual meeting, Univertsity of British Columbia, Vancouver, British Columbia, Canada, july 11-15, 1998 : scientific program and abstracts. Vancouver: University of British Columbia, 1998. Str. 177, p12-1. [COBISS.SI-ID 2105208]

20. STOPAR, David, HEMMINGA, Marcus A. Lokacija in struktura glavnega plaščnega proteina bakteriofaga M13 med razstavljanjem in sestavljanjem virusa. V: BOLE-HRIBOVŠEK, Vojka (ur.), OCEPEK, Matjaž (ur.), KLUN, Nataša (ur.). Zbornik s programom = Proceedings with the program. 2. kongres mikrobiologov Slovenije z mednarodno udeležbo = 2nd Congress of Slovenian Microbiologists with International Participation, Portorož, Slovenija, 27.-30. september 1998. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 1998. Str. 398-400. ISBN 961-90346-1-9. [COBISS.SI-ID 2120312]

21. STOPAR, David, SPRUIJT, Ruud B., WOLFS, Cor J. A. M., HEMMINGA, Marcus A. Mimicking initial interactions of bacteriophage M13 coat protein disassembly in model membrane systems. Biochemistry. [Print ed.]. 1998, 37, str. 10181-10187. ISSN 0006-2960. [COBISS.SI-ID 2073464]

22. STOPAR, David. Molecular biophysics on viruses: bacteriophage M13 as a model system : invited lecture on Wageningen University and Research Institute, Wageningen, 9.12.1998. Wageningen: Wageningen University and Research Institute, 1998. [COBISS.SI-ID 2152056]

23. STOPAR, David, HEMMINGA, Marcus A. Structure-function relationship of viral coat proteins : invited lecture on Study Section for Protein Research, Lunteren, 8.12.1998. Lunteren: Study Section for Protein Research, 1998. [COBISS.SI-ID 2152312]

24. STOPAR, David, SPRUIJT, Ruud B., WOLFS, Cor J. A. M., HEMMINGA, Marcus A. Disassembly of bacteriophage M13 studied by ESR spectroscopy. V: Book of abstracts. 11th International Symposium Spectroscopy in Theory and Practice, Bled, 11-15 April 1999. [Ljubljana]: Slovenian Chemical Society, Spectroscopic Section, [1999]. Str. 68. [COBISS.SI-ID 2257016]

25. STOPAR, David, MAHNE, Ivan, MEGUŠAR, France. The effect of nitrification on fixed 15N ammonium release in soil = Vpliv nitrifikacije na sproščanje fiksiranega 15N amonijevega dušika v tleh. Zbornik Biotehniške fakultete Univerze v Ljubljani. Kmetijstvo. Agricultural issue. 1999, 73, str. 9-14. ISSN 1408-340X. [COBISS.SI-ID 2265976]

26. STOPAR, David. EPR round table : chairperson on 11th International symposium Spectroccopy in theory and practice, Bled, 13.4.1999. Bled, 1999. [COBISS.SI-ID 2257272]

27. STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. Mikrobna ekologija voda : (izbrana poglavja) : za študente dodiplomskega študija mikrobiologije. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 1999. 61 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 2361976]

28. STOPAR, David, MAHNE, Ivan. Praktikum iz mikrobiologije. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 1999. 73 str., ilustr. ISBN 961-6333-01-1. [COBISS.SI-ID 2261368]

29. STOPAR, David, MAHNE, Ivan. Praktikum iz mikrobne ekologije : za študente biologije. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 1999. 27 str. ISBN 961-6333-02-X. [COBISS.SI-ID 2261624]

30. STOPAR, David. Študij razstavljanja virusa M13 v membrani z EPR spektroskopijo - 1.del : predavanje v okviru seminarja Odseka za fiziko trdne snovi Instituta Jožef Stefan (EPR centra) in Društva biofizikov Slovenije, 19.02.1999. Ljubljana: Institut Jožef Stefan, EPR Center, 1999. [COBISS.SI-ID 2258552]

31. STOPAR, David. Študij razstavljanja virusa M13 v membrani z EPR spektroskopijo - 2.del : predavanje v okviru seminarja Odseka za fiziko trdne snovi Instituta Jožef Stefan (EPR centra) in Društva biofizikov Slovenije, 2.04.1999. Ljubljana: Institut Jožef Stefan, EPR Center, 1999. [COBISS.SI-ID 2256504]

32. GNEZDA, Kaja. Dinamika indukcije bakteriofagov pri morskih bakterijskih lizogenih izolatih pri različnih fizioloških pogojih : diplomska naloga = Dynamics of bacteriophage induction of marine bacterial lysogenic isolates under different physiological conditions : graduation thesis. Ljubljana: [K. Gnezda]: [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2000. X, 37 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 61, Prešernove nagrade študentom Univerze v Ljubljani, 2001. [COBISS.SI-ID 2435960]

33. ČERNE, Aleša, STOPAR, David. Frequency of lysogeny and polylysogeny in bacteria isolated from northern Adriatic Sea. V: KUTTER, Betty. Millennial Phage Biology Meeting, Montreal, 7-11 june 2000. Montreal: McGill University, Department of Microbiology and Immunology, 2000. Str. [1]. [COBISS.SI-ID 2400376]

34. STOPAR, David, HEMMINGA, Marcus A. Membrane protein location determination by site-specific spin-labeling using EPR spectroscopy. V: Seventh International Summer School on Biophysics, Supramolecular Structure and Function, September 14-26, 2000, Rovinj, Croatia : book of abstracts. [S.l.]: [s.n.], 2000. Str. 128, p36. ISBN 953-97885-1-X. [COBISS.SI-ID 2439032]

35. SEVER, Mateja. Primernost podtalnice za aktivnost in rast nitrifikatorjev : diplomska naloga = Suitability of ground water for activity and growth of nitrifiers : graduation thesis. Ljubljana: [M. Sever]: [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2000. IX, 41 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 55. [COBISS.SI-ID 2422136]

36. STOPAR, David. Protein - lipid interactions : lecture, Brussels, Technical Commission of COST Chemistry, COST D22, 17.11.2000. Brussels: Technical Commission of COST Chemistry, COST D22, 2000. [COBISS.SI-ID 2471544]

37. ŽIGMAN, Mihaela, ČERNE, Aleša, TURK, Valentina, STOPAR, David. Virus abundance in Northern Adriatic sea. V: First joint meeting of the Slovenian Society for Microbiology and the Hungarian Society for Microbiology, Keszthely, Hungary, august 24-26, 2000. Keszthely: Slovenian Society for Microbiology: Hungarian Society for Microbiology, 2000. Str. v-20. [COBISS.SI-ID 2418040]

38. ŽIGMAN, Mihaela. Vpliv izpusta komunalnih odpadnih vod iz Pirana na gostoto virusov v priobalnem morju : diplomska naloga = Effect of wastewaters from Piran on viral density in marine coastal waters : graduation thesis. Ljubljana: [M. Žigman], 2000. X, 46 f., ilustr. [COBISS.SI-ID 629071]

39. STOPAR, David. Bacteriophage ecology : lecture on Wageningen University, Wageningen, 22.05.2001. Wageningen: Wageningen University, 2001. [COBISS.SI-ID 2525816]

40. ABEDON, Stephen T., STOPAR, David. Bacteriophage latent-period evolution. V: Interactions in the microbial world, 26-31 August, Amsterdam, The Netherlands : ISME-9 : final programme and abstracts. 9th International Symposium on Microbial Ecology, 26-31 august 2001, Amsterdam, The Netherland. Amsterdam: [s. n.], 2001. Str. 216, p.06.001. [COBISS.SI-ID 2573688]

41. ABEDON, Stephen T., HERSCHLER, Troy D., STOPAR, David. Bacteriophage latent-period evolution as a response to resource availability. Applied and environmental microbiology. 2001, vol. 67, no. 9, str. 4233-4241. ISSN 0099-2240. [COBISS.SI-ID 2524792]

42. STOPAR, David. Bakteriofagi : za študente medoddelčnega študija mikrobiologije : (študijsko gradivo). Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2001. 38, [10] f., ilustr. ISBN 961-6333-17-8. [COBISS.SI-ID 116494336]

43. GNEZDA, Kaja, STOPAR, David, DIJKEMA, Cor. Difference in cell energetics between control and induced lysogenic bacterial culture. V: 5th user meeting of the European large-scale facilities for NMR : [abstracts] : November 8-11, 2001, J.W.Goethe-Universität, Frankfurt. Str. 74, p39. [COBISS.SI-ID 2750072]

44. STOPAR, David, TRČEK, Tatjana, ŠTRANCAR, Janez. Electron paramagnetic resonance characterization of the exopolysaccharide layer produced by bacteria. V: ŠTRANCAR, Janez (ur.). Book of abstract[!] with programme. International Conference on Life Sciences 2001, Gozd Martuljek, Slovenia, September 22-26, 2001. Ljubljana: Slovenian Biophysical Society, 2001. Str. 54, s4-p6. ISBN 961-90942-0-4. [COBISS.SI-ID 16182823]

45. STOPAR, David. Membrane domains: a general overview. V: VEBER, Marjan (ur.). Book of abstracts. 12th International Symposium Spectroscopy in Theory and Practice with Thinkshop In search of the Metrological Basis of Spectroscopic Measurements, Bled, Slovenia, 9.-12. April 2001. [S. l.: s. n., 2001]. Str. 116, rb-1. [COBISS.SI-ID 2508152]

46. STOPAR, David. Microbial loop and nutrient cycling : lecture on Bioremediation and Phytoremediation of Organic Pollutants and Nutrients, International short-course series, october 22, 2001, Nova Gorica Polytechnic, Nova Gorica, Slovenia. Nova Gorica: Nova Gorica Polytechnic, 2001. [COBISS.SI-ID 2574712]

47. GORŠIČ, Maša. Morfološki in genetski opis bakteriofagov, ki gostujejo na bakterijski kulturi Amycolatopsis orientalis : diplomska naloga : univerzitetni študij = Morphological and genetical characterisation of Amycolatopsis orientalis bacteriophages : graduation thesis : University studies. Ljubljana: [M. Goršič], 2001. IX, 38 f., ilustr., graf. prikazi. [COBISS.SI-ID 876623]

48. ČERNE, Aleša. Pojavljanje lizogenije in polilizogenije pri bakterijskih izolatih iz morskih okolij v Tržaškem zalivu : diplomsko delo, univerzitetni študij = Occurence of lysogeny and polylysogeny among bacterial isolates isolated from marine environments in gulf of Trieste : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [A. Černe]; [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2001. IX, 38 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 89. [COBISS.SI-ID 2563704]

49. STOPAR, David, GNEZDA, Kaja, ČERNE, Aleša, MAHNE, Ivan. Prophage induction and development depends on the physiology of its host. V: Interactions in the microbial world, 26-31 August, Amsterdam, The Netherlands : ISME-9 : final programme and abstracts. 9th International Symposium on Microbial Ecology, 26-31 august 2001, Amsterdam, The Netherland. Amsterdam: [s. n.], 2001. Str. 285-286, p.16.023. [COBISS.SI-ID 2573432]

50. STOPAR, David. Spectroscopy in theory and practice : 12th International symposium : with thinkshop "In search of the meteorological basis of spectroscopic measurements" : book of abstracts, Bled, Slovenia, 9-12 april, 2001. Ljubljana: Spectroscopic Section of the Slovenian Chemical Society: DAC/FECS, 2001. [COBISS.SI-ID 2509432]

51. STOPAR, David. Structure-function relationship of viral membrane proteins. Szeged: Biological Research Centre, 2001. 11 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 2601848]

52. STOPAR, David. Structure-function relationship of viral membrane proteins : lecture on Advanced Biophysics School on Lipid-Protein Interactions and the Organization of Membranes, 23rd june 2001, Szeged, Hungary. Szeged: Biological Research Center, 2001. [COBISS.SI-ID 2601592]

53. BOBEN, Jana. Uporaba tehnik tkivne kulture za študij virusa, ki povzroča razbrazdanje lesa na vinski trti : diplomsko delo, univerzitetni študij = The use of tissue culture techniques for the study of Rupestris stem pitting associated virus : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [J. Boben]; [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2001. XIII, 63 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 78. [COBISS.SI-ID 2535288]

54. GNEZDA, Kaja, DIJKEMA, Cor, STOPAR, David. Bacterial energy metabolism during bacteriophage replication: a 31P NMR study. V: [Book of abstracts]. 6th European NMR large scale facilities user meeting 2002, October 17-20, 2002, Montecatini (Florence), Italy. [S.l.: s.n.], 2002. Str. l16. [COBISS.SI-ID 2711672]

55. STOPAR, David, SCHARA, Milan. Comments to the II. International EPR Round Table. Farmacevtski vestnik : strokovno glasilo slovenske farmacije. [Tiskana izd.]. let. 53, št. 2, str. 129-129. ISSN 0014-8229. [COBISS.SI-ID 2666104]

56. TRČEK, Tatjana. Določanje lastnosti zunajceličnega polisaharidnega sloja pri bakteriji Vibrio sp. z metodo elektronske paramagnetne resonance : diplomsko delo, univerzitetni študij = The electron paramagnetic resonance characterization of the extracellular polysaccharide layer produced by a Vibrio sp. bacterium : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [T. Trček]: [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2002. X, 44 f., ilustr., graf. prikazi. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 108. [COBISS.SI-ID 2659704]

57. STOPAR, David, TRČEK, Tatjana, ŠTRANCAR, Janez. Electron paramagnetic resonance characterization of the exopolysaccharide layer produced by bacteria. V: The International Conference on Life Sciences - 2001 : 22-26 September 2001, Gozd Martuljek, Slovenia : [proceedings]. Wroclaw [Poland]: Polish Society for Cell Biology and University of Wroclaw, 2002. Vol. 7, no. 1, str. 167-169. Cellular & molecular biology letters, vol. 7, no. 1. ISSN 1425-8153. [COBISS.SI-ID 2646648]

58. STOPAR, David. EPR and membrane protein structural determination. Farmacevtski vestnik : strokovno glasilo slovenske farmacije. [Tiskana izd.]. let. 53, št. 2, str. 130-130. ISSN 0014-8229. [COBISS.SI-ID 2665848]

59. BENE, Jerneja. Kontrola populacije bakterije Escherichia coli z bakteriovornim migetalkarjem Tetrahymena thermophila : diplomsko delo, univerzitetni študij = Control of population of bacteria Escherichia coli with bacterivorous ciliate Tetrahymena thermophila : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [J. Bene]: [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2002. IX, 47 f., ilustr., graf. prikazi. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 122. [COBISS.SI-ID 2676088]

60. GNEZDA, Kaja, MAHNE, Ivan, STOPAR, David. Phage morphotype biodiversity upon polylysogenic bacterial host induction with mitomycin-C. V: MRŠA, Vladimir (ur.), HAJSIG, Danko (ur.). Power of microbes in industry and environment : Croatian, Hungarian and Slovenian Symposium on Industrial Microbiology and Microbial Ecology, 7-9 June, 2002, Opatija, Croatia : book of abstracts. Zagreb: Faculty of Food Technology and Biotechnology, University of Zagreb, 2002. Str. 60. p30. [COBISS.SI-ID 2672248]

61. VUČAK, Cilka. Salicilna in gentiska kislina v listih krompirja (Solanum tuberosum L.) sorte 'Igor' po okužbi s krompirjevim virusom Y NTN : diplomsko delo, univerzitetni študij = Salicylic and gentisic acid in leaves of potato (Solanum tuberosum L.) cultivar 'Igor' after infection with potato virus Y NTN : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [C. Vučak]: [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2002. XVII, 79 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 103. [COBISS.SI-ID 2654072]

62. TRČEK, Tomaž, ŠTRANCAR, Janez, STOPAR, David. Structural characterisation of bacterial exopolysaccharide layer. V: SIBPA 2002 : [program [and]abstracts [and] participant list]. XVI National Congress of the Italian Society for Pure and Applied Biophysics and 1st Italian-Slovenian Workshop on Biophysics, 11-14 September 2002, Trento, Italy. [S.l.: s.n.], 2002. Str. 43. [COBISS.SI-ID 15176409]

63. STOPAR, David, SPRUIJT, Ruud B., WOLFS, Cor J. A. M., HEMMINGA, Marcus A. Structural characterization of bacteriophage M13 solubilization by amphiphiles. Biochimica et biophysica acta. Protein structure and molecular enzymology. [Print ed.]. 2002, vol. 1594, str. 54-63. ISSN 0167-4838. [COBISS.SI-ID 2622584]

64. ODIĆ, Duško. Vpliv indukcije profaga na sproščanje in prevezavo hranil v mikrobni zanki : diplomsko delo, univerzitetni študij = The effect of prophage induction on the relase and transfer of nutrients in the microbial loop : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [D. Odič]: [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2002. XIII, 52 f., ilustr., graf. prikazi. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 112. [COBISS.SI-ID 2660728]

65. ŽAGAR, Andrej. Vpliv okoljskih faktorjev na dinamiko rasti in propada mikrobne biomase : diplomsko delo : univerzitetni študij = Effect of environmental parameters on microbial biomass growth and decay : Graduation thesis : University studies. Ljubljana: [A. Žagar]: [BF, Oddelek za agronomijo], 2002. IX, 33 f., graf. prikazi. Biotehniška fakulteta, Oddelek za agronomijo, Ljubljana, Diplomske naloge, 1914. [COBISS.SI-ID 3520121]

66. ODIĆ, Duško, MAHNE, Ivan, STOPAR, David. Bacterial lysate quality determines growth yields of heterotrophic bacterial population. V: AVŠIČ-ŽUPANC, Tatjana (ur.). Abstract book. 1st FEMS Congress of European Microbiologists, Slovenia, Ljubljana, June 29 - July 3, 2003. Delft, The Netherlands: FEMS, 2003. Str. 421-422, p11-154. [COBISS.SI-ID 2787704]

67. DANEVČIČ, Tjaša, RILFORS, Leif, STOPAR, David, LINDBLOM, Göran. The effect of salinity on lipid composition and phase behaviour of Vibrio sp. DSM14379 lipids. V: Book of abstracts. 13th International Symposium Spectroscopy in Theory and Practice, Nova Gorica, 27-30 August, 2003. Nova Gorica: Politehnika, 2003. Str. 57, o 36. ISBN 961-6311-16-6. [COBISS.SI-ID 2800760]

68. STOPAR, David. Extraordinary journey of the major coat protein during bacteriophage M13 replication cycle. V: International Symposium [on] Interactions in Macromolecular Assemblies : abstract book : september 6-9, 2003, Druskininkai, Lithuania. Druskininkai: Lithuanian State Science & Study Foundation, European Commission, Program of Centers of Excellence, Project CEBIOLA, 2003. Str. 9. [COBISS.SI-ID 2802296]

69. DANEVČIČ, Tjaša, SEPE, Ana, LAHAJNAR, Gojmir, STOPAR, David. In vivo 1H-NMR spectroscopy measurements of diffusional water permeability in bacterial cells. V: AVŠIČ-ŽUPANC, Tatjana (ur.). Abstract book. 1st FEMS Congress of European Microbiologists, Slovenia, Ljubljana, June 29 - July 3, 2003. Delft, The Netherlands: FEMS, 2003. Str. 317, p9-34. [COBISS.SI-ID 2790264]

70. BOŠTJANČIČ, Emanuela. Karakterizacija fagnega lizata bakterije Vibrio sp. : diplomsko delo, univerzitetni študij = Characterization of Vibrio sp. phage lysate : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [E. Boštjančič]: [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2003. IX, 56 f., ilustr., graf. prikazi. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 154. [COBISS.SI-ID 2825848]

71. ŠEŠERKO, Melita, MAHNE, Ivan, STOPAR, David. Microbial conversions of soil nitrogen along with the increased content of heavy metal elements in soil. V: JERAN, Zvonka (ur.). BioMAP : book of abstracts. 3rd International Workshop on Biomonitoring of Atmospheric Pollution (with emphasis on trace elements), Bled, Slovenia, September 21-25, 2003. Ljubljana: J. Stefan Institute, 2003. Str. 28. [COBISS.SI-ID 496086]

72. STOPAR, David, SPRUIJT, Ruud B., WOLFS, Cor J. A. M., HEMMINGA, Marcus A. Molecular details of bacteriophage M13 major coat protein journey through the replication cycle. V: Book of abstracts. 13th International Symposium Spectroscopy in Theory and Practice, Nova Gorica, 27-30 August, 2003. Nova Gorica: Politehnika, 2003. Str. 56, o 35. ISBN 961-6311-16-6. [COBISS.SI-ID 2801016]

73. STOPAR, David, SPRUIJT, Ruud B., WOLFS, Cor J. A. M., HEMMINGA, Marcus A. Protein-lipid interactions of bacteriophage M13 major coat protein : review. Biochimica et biophysica acta. Biomembranes. [Print ed.]. 2003, vol. 1611, str. 5-15. ISSN 0005-2736. [COBISS.SI-ID 2735736]

74. STOPAR, David, HEMMINGA, Marcus A. Protein-lipid interactions of bacteriophage M13 replication cycle. V: Abstracts of the 14th International Congress of the Hungarian Society for Microbiology : including an ESCMID Symposium on "Resurgence of streptococcal infections" : and Special symposia on "Emerging infections and eradication programmes" and "Molecular physiology of industrial fungi" : Balatonfüred, Hungary, october 9-11, 2003. Budapest: [s.n.], 2003. Str. [1]. [COBISS.SI-ID 2814584]

75. STOPAR, David. Protein-lipid interactions of membrane proteins : lecturer on Wageningen University, Laboratory of Biophysics, Wageningen, The Netherlands, March 1st to May 31st 2003. Wageningen: Wageningen University, Laboratory of Biophysics, 2003. [COBISS.SI-ID 2804088]

76. DANEVČIČ, Tjaša. Spreminjanje prepustnosti bakterijske membrane v odvisnosti od okoljskih pogojev preučevano z jedrsko magnetno resonanco (NMR) : diplomsko delo, univerzitetni študij = Influence of environmental conditions on bacterial membrane permeability studied by nuclear magnetic resonance (NMR) : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [T. Danevčič]: [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2003. XV, 52 f., ilustr., graf. prikazi. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 152. [COBISS.SI-ID 2808696]

77. DOGŠA, Iztok, LAGGNER, Peter, KRIECHBAUM, M., MAHNE, Ivan, STOPAR, David. Structural stability of bacterial extracellular polysaccharides measured by small angles X-ray scattering (SAXS). V: AVŠIČ-ŽUPANC, Tatjana (ur.). Abstract book. 1st FEMS Congress of European Microbiologists, Slovenia, Ljubljana, June 29 - July 3, 2003. Delft, The Netherlands: FEMS, 2003. Str. 316, p9-33. [COBISS.SI-ID 2782584]

78. DOGŠA, Iztok. Ugotavljanje strukturne stabilnosti bakterijskih zunajceličnih polisaharidov s sipanjem X-žarkov pri majhnih kotih (SAXS) : diplomsko delo, univerzitetni študij = Structural stability of bacterial extracellular polysaccharides studied by small angle X-ray scattering (SAXS) : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [I. Dogša]; [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2003. IX, 46 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 142. [COBISS.SI-ID 2795384]

79. STOPAR, David, ČERNE, Andreja, ŽIGMAN, Mihaela, POLJŠAK-PRIJATELJ, Mateja, TURK, Valentina. Viral abundance and a high proportion of lysogens suggest that viruses are important members of the microbial community in the Gulf of Trieste. Microbial ecology. 2003, vol. 46, no. 2, str. 249-256. ISSN 0095-3628. [COBISS.SI-ID 1252943]

80. ZUPANČIČ, Marko. Vpliv virusov na heterotrofno produkcijo biomase : diplomsko delo : univerzitetni študij = The effect of viruses on heterotrophic biomass production : Graduation thesis : University studies. Ljubljana: [M. Zupančič]: [BF, Oddelek za agronomijo], 2003. IX, 25 f., ilustr., graf. prikazi. Biotehniška fakulteta, Oddelek za agronomijo, Ljubljana, Diplomske naloge. [COBISS.SI-ID 3802489]

81. HACIN, Janez, MANDIĆ-MULEC, Ines, STRES, Blaž, KRAIGHER, Barbara, STOPAR, David, MAHNE, Ivan. Environmental gradients and microbial activity in fens of Ljubljana marsh. V: Microbial planet : sub-surface to space : ISME 10 : Mexico 2004 : 10th International Symposium on Microbial Ecology ISME-10, Cancun, Mexico, August 22-27, 2004 : book of abstracts. Concun: Asociación Mexicana de Microbiología; Geneva: International Society for Microbial Ecology - ISME, 2004. Str. 40. [COBISS.SI-ID 3145336]

82. JERMAN, Vesna. Karakterizacija in čiščenje protimikrobne učinkovine morske bakterije Vibrio sp. : diplomsko delo, univerzitetni študij = Characterization and purification of antimicrobial agent produced by marine bacterium Vibrio sp. : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [V. Jerman]: [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2004. XI, 44 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 176, Prešernove nagrade študentom Biotehniške fakultete v Ljubljani, 2004. [COBISS.SI-ID 2944120]

83. ŠTRANCAR, Janez, KOKLIČ, Tilen, ARSOV, Zoran, FILIPIČ, Bogdan, STOPAR, David, HEMMINGA, Marcus A. Karakterizacija kompleksnosti biosistemov z EPR in spinskim označevanjem. V: CONRADI, Marjetka (ur.), MUŠEVIČ, Igor (ur.), ŠKARABOT, Miha (ur.). Zbornik povzetkov. 4. Konferenca fizikov v osnovnih raziskavah, Cerkno, 12. november 2004. Ljubljana: DMFA založništvo, 2004. Str. 77. Publikacija DMFA, št. 1585. ISBN 961-212-156-7. [COBISS.SI-ID 18653991]

84. DOGŠA, Iztok, LAGGNER, Peter, ŠTRANCAR, Janez, STOPAR, David. Meritve ozkokotnega sipanja rentgenskih žarkov (SAXS) in strukturno modeliranje bakterijskih zunajceličnih polisaharidov (EPS). V: CONRADI, Marjetka (ur.), MUŠEVIČ, Igor (ur.), ŠKARABOT, Miha (ur.). Zbornik povzetkov. 4. Konferenca fizikov v osnovnih raziskavah, Cerkno, 12. november 2004. Ljubljana: DMFA založništvo, 2004. Str. 41. Publikacija DMFA, št. 1585. ISBN 961-212-156-7. [COBISS.SI-ID 18615847]

85. RAČNIK, Teja. Primerjava metabolizma halofilne glive Hortaea werneckii in halotolerantne glive Aureobasidium pullulans pri različnih slanostih : diplomska naloga : univerzitetni študij = Comparison of metabolism in halophilic fungus Hortaea werneckii and halotolerant fungus Aureobasidium pullulans at different salinities : graduation thesis : university studies. Ljubljana: [T. Račnik], 2004. XV, 98 f., ilustr., graf. prikazi, pril. [COBISS.SI-ID 1400655]

86. VODNIK, Dominik, MAČEK, Irena, PFANZ, Hardy, KASTELEC, Damijana, STOPAR, David. Small-scale variability of soil CO2 and soil respiration at the mofette Stavenšinci (NE Slovenia). V: Partitioning soil CO2 efflux : joint workshop : Capri, Italy Oct 2nd - 4th 2004 : Carboeurope/COST Action 627. [S. l.: s. n., 2004]. Str. 32. [COBISS.SI-ID 4733561]

87. ŠTEFANIČ, Polonca. Spremembe morfologije, kultivabilnosti in živosti celic Campylobacter jejuni v razmerah toplotnega in oksidativnega stresa : diplomsko delo, univerzitetni študij = Morphology, cultivability and viability changes of Campylobacter jejuni due to thermal and oxidative stress : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [BF, Oddelek za živilstvo]: [P. Štefanič], 2004. XI, 75 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Ljubljana, Diplomske naloge, 1119, Prešernove nagrade študentom Biotehniške fakultete v Ljubljani, 2004. [COBISS.SI-ID 2945400]

88. STOPAR, David, ČERNE, Andreja, ŽIGMAN, Mihaela, POLJŠAK-PRIJATELJ, Mateja, TURK, Valentina. Viral abundance and a high proportion of lysogens suggest that viruses are important members of the microbial community in the Gulf of Trieste. Microbial ecology. 2004, vol. 47, str. 1-8. ISSN 0095-3628. [COBISS.SI-ID 2910328]

89. MANDIĆ-MULEC, Ines, HACIN, Janez, KRAIGHER, Barbara, STRES, Blaž, STOPAR, David, MAHNE, Ivan. Effect of environmental gradients on activity and structure of microbial communities in peat soils of Ljubljana marsh. V: Rhizosphere management in soils contaminated with organic and inorganic pollutants : COST action 631, Understanding and Modelling Plant-Soil Interactions in the Rhizosphere Environment (UMPIRE) : Kraków-Tomaszowice, Poland, 12-14 May, 2005. [Kraków: European Union, Ministry of Scientific Research and Information Technology: Institute of botany of the Jagiellonian University], 2005. Str. 41. [COBISS.SI-ID 3144056]

90. DANEVČIČ, Tjaša, RILFORS, Leif, ŠTRANCAR, Janez, LINDBLOM, Göran, STOPAR, David. Effects of lipid composition on the membrane activity and lipid phase behaviour of Vibrio sp. DSM14379 cells grown at various NaCl concentrations. Biochimica et biophysica acta. Biomembranes. [Print ed.]. 2005, vol. 1712, str. 1-8. ISSN 0005-2736. [COBISS.SI-ID 19091495]

91. STOPAR, David, ŠTRANCAR, Janez, SPRUIJT, Ruud B., HEMMINGA, Marcus A. Exploring the local conformational space of a membrane protein by site-directed spin labeling. Journal of chemical information and modeling. [Print ed.]. 2005, vol. 45, str. 1621-1627. ISSN 1549-9596. [COBISS.SI-ID 3108472]

92. MANDIĆ-MULEC, Ines, AVGUŠTIN, Gorazd, ČADEŽ, Polona, HACIN, Janez, JERMAN, Vesna, KRAIGHER, Barbara, LESKOVEC, Simona, MAHNE, Ivan, STOPAR, David, STRES, Blaž. Ljubljansko barje - ocena okoljskih sprememb z aktivnostjo in strukturo mikrobne združbe : letno poročilo o rezultatih raziskovalnega projekta v letu 2004 : šifra projekta J4-6149-0481-04. Ljubljana: Biotehnična fakulteta, 2005. 7 f. [COBISS.SI-ID 3337336]

93. STOPAR, David, HEMMINGA, Marcus A., ŠTRANCAR, Janez. A new look on electron spin resonance spectra analyses : an application for membrane proteins. V: Biophysical chemistry meets molecular medicine : YCW : workshop : June 1-4, 2005, Sesimbra Beach, Portugal : book of abstracts. [Ciências: Departamento de Química e Bioquímica, Faculdade de Ciências, Universidade de Lisboa], 2005. Str. 39. [COBISS.SI-ID 3064696]

94. ČEH, Vanja. Poskus izolacije virusnih nukleinskih kislin v hrani in vodi : diplomsko delo, univerzitetni študij = Isolation of viral nucleic acids from food and water : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [V. Čeh]: [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2005. X, 54 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 204. [COBISS.SI-ID 3042424]

95. STOPAR, David, ODIĆ, Duško, MAHNE, Ivan. Praktikum iz mikrobne ekologije : za študente biologije. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2005. 35 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 2989704]

96. DRUFOVKA, Kristina. Razgradnja organofosfatnih insekticidov, diazinona in malationa z mikroorganizmi iz različnih vzorcev tal : diplomsko delo, univerzitetni študij = Microbial degradation of organophosphorus insecticides diazinon and malathion from different soil extracts : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [K. Drufovka]: [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2005. XI, 43 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 219. [COBISS.SI-ID 3077496]

97. DOGŠA, Iztok, LAGGNER, Peter, ŠTRANCAR, Janez, STOPAR, David. Small-angle X-ray scattering (SAXS) investigation and structural modelling of bacterial extracellular polysaccharides (EPS) = Meritve ozkokotnega sipanja rentgenskih žarkov (SAXS) in strukturno modeliranje bakterijskih zunajceličnih polisaharidov (EPS). V: TREBŠE, Polonca (ur.), MOZETIČ VODOPIVEC, Branka (ur.). Book of abstracts = Knjiga povzetkov. 14th International Symposium Spectroscopy in Theory and Practice, Nova Gorica, Slovenia, April 10-13, 2005 = 14. mednarodni simpozij Spektroskopija v teoriji in praksi, Nova Gorica, Slovenija, 10.-13. april 2005. Nova Gorica: Politehnika, 2005. Str. 12, o1. ISBN 961-6311-29-8. [COBISS.SI-ID 3064184]

98. ŠTRANCAR, Janez, KOKLIČ, Tilen, ARSOV, Zoran, FILIPIČ, Bogdan, STOPAR, David, HEMMINGA, Marcus A. Spin label EPR-based characterization of biosystem complexity. Journal of chemical information and modeling. [Print ed.]. 2005, vol. 45, no. 2, str. 394-406. ISSN 1549-9596. [COBISS.SI-ID 18953511]

99. DOGŠA, Iztok, KRIECHBAUM, Manfred, STOPAR, David, LAGGNER, Peter. Structure of bacterial extracellular polymeric substances at different pH values as determined by SAXS. Biophysical journal. 2005, vol. 89, no. 4, str. 2711-2720. ISSN 0006-3495. [COBISS.SI-ID 3107704]

100. GNEZDA MEIJER, Kaja. Vpliv virusne indukcije na metabolno ravnovesje bakterijskega gostitelja : doktorska disertacija = Viral induction influences metabolic homeostasis of the host bacterium : doctoral dissertation. Ljubljana: [Biotehniška fakulteta]: [K. Gnezda Meijer], 2005. XIV, 84 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Ljubljana, Doktorske disertacije, 132. [COBISS.SI-ID 3134328]

101. STOPAR, David, SPRUIJT, Ruud B., HEMMINGA, Marcus A. Anchoring mechanisms of membrane-associated M13 major coat protein. V: FINDLAY, B. C. (ur.). Protein: Lipid Interactions - COST action D22 Meeting, Dubrovnik, Croatia, 6-8October 2005. Amsterdam: North-Holland, 2006. Vol. 141, str. 83-93. Chemistry and physics of lipids, Vol. 141, Issues 1-2, 2006. ISSN 0009-3084. [COBISS.SI-ID 3169144]

102. DOGŠA, Iztok, UMEK, Polona, ARČON, Denis, AUSEC, Luka, KONTE, Tilen, STOPAR, David, ŠTRANCAR, Janez. Biological and EPR spectroscopy assay of antimicrobial properties of ▫$TiO_2$▫-based nanoparticles. V: ARČON, Denis (ur.). SLONANO 2006 : Organic, inorganic and biomolecular nanostructures: from fundamental science to applications : program and abstracts. 5th Symposium of Science and Technology of Nanomaterials in Slovenia, September 20-21, 2006, Ljubljana, Slovenia. [Ljubljana: Jožef Stefan Institute, 2006]. Str. [35]. [COBISS.SI-ID 20149287]

103. LENARČIČ, Rok. Bioremediacijski potencial šotnih tal : diplomsko delo, univerzitetni študij = Bioremediational potential of peat soil : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [R. Lenarčič]: [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2006. X, 53 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 262. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_lenarcic_rok.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3213944]

104. ODIĆ, Duško, TURK, Valentina, STOPAR, David. Environmental stress determines quality of bacterial lysate and its utilization efficiency in a simple microbial loop. V: The Hidden powers - Microbial communities in action : ISME 11 : Vienna 2006 : 11th International Symposium on Microbial Ecology - ISME-11, Vienna, Austria, August 20-25, 2006 : book of abstracts. Vienna: International Society for Microbial Ecology - ISME, 2006. Str. a307. [COBISS.SI-ID 3243128]

105. ŠTRANCAR, Janez, KAVALENKA, Oleg, STOPAR, David, HEMMINGA, Marcus A. From SDSL EPR experiments to conformational spaces and membrane protein structure : [invited talk]. V: Programme and book of abstracts. EFEPR-06, 6th European Federation of EPR Groups Meeting, 5-8 September 2006,. [S. l.: s. n.], 2006. [COBISS.SI-ID 20167207]

106. GNEZDA MEIJER, Kaja, MAHNE, Ivan, POLJŠAK-PRIJATELJ, Mateja, STOPAR, David. Host physiological status determines phage-like particle distribution in the lysate. FEMS microbiology, ecology. 2006, vol. 55, no. 1, str. 136-145. ISSN 0168-6496. [COBISS.SI-ID 3108216]

107. MANDIĆ-MULEC, Ines, AVGUŠTIN, Gorazd, ČADEŽ, Polona, HACIN, Janez, JERMAN, Vesna, KRAIGHER, Barbara, LESKOVEC, Simona, MAHNE, Ivan, STOPAR, David, STRES, Blaž. Ljubljansko barje - ocena okoljskih sprememb z aktivnostjo in strukturo mikrobne združbe : letno poročilo o rezultatih raziskovalnega projekta v letu 2005 : šifra projekta J4-6149-0481-04. Ljubljana: Biotehnična fakulteta, 2005 [i. e. 2006]. 5 f. [COBISS.SI-ID 3337592]

108. STRES, Blaž, DANEVČIČ, Tjaša, PAL, Levin, RESMAN, Lara, HACIN, Janez, KRAIGHER, Barbara, STOPAR, David, JERMAN, Vesna, LESKOVEC, Simona, MAHNE, Ivan, MANDIĆ-MULEC, Ines. Microbial communities of drained Ljubljana Marsh soil. V: The Hidden powers - Microbial communities in action : ISME 11 : Vienna 2006 : 11th International Symposium on Microbial Ecology - ISME-11, Vienna, Austria, August 20-25, 2006 : book of abstracts. Vienna: International Society for Microbial Ecology - ISME, 2006. Str. a311. [COBISS.SI-ID 3255160]

109. HACIN, Janez, STRES, Blaž, DANEVČIČ, Tjaša, PAL, Levin, RESMAN, Lara, KRAIGHER, Barbara, JERMAN, Vesna, STOPAR, David, LESKOVEC, Simona, MAHNE, Ivan, MANDIĆ-MULEC, Ines. Microbial communities of drained Ljubljana Marsh soils. V: Abstract book : Integrating microbial knowledge into human life. 2nd FEMS Congress of European Microbiologists, Spain, Madrid, July 4 - 8, 2006. Madrid, Spain: FEMS, 2006. Str. 164, p.env.60. [COBISS.SI-ID 3206264]

110. STOPAR, David. Mikrobni spleti : predavanje v okviru razstave Kaj spreminja svet, Prirodoslovni muzej, 1.6.2006. Ljubljana: Prirodoslovni muzej, 2006. [COBISS.SI-ID 3186808]

111. STOPAR, David, JERŠEK, Barbara. Moč življenja. V: JERŠEK, Miha (ur.), et al. Kaj spreminja svet. Ljubljana: Prirodoslovni muzej Slovenije: Agencija RS za okolje, 2006. Str. 91-110. ISBN 961-6367-14-5. [COBISS.SI-ID 3157112]

112. STOPAR, David, ŠTRANCAR, Janez, SPRUIJT, Ruud B., HEMMINGA, Marcus A. Motional restrictions of membrane proteins : a site-directed spin labeling study. Biophysical journal. 2006, vol. 91, no. 9, str. 3341-3348. ISSN 0006-3495. [COBISS.SI-ID 3214968]

113. PETKOVŠEK, Ana, STOPAR, David, MAČEK, Matej, STRES, Blaž, MAJES, Bojan. Poročilo o geomehanskih laboratorijskih preiskavah sivice iz ozkega vplivnega območja cevi obstoječega cestnega predora Ljubno. Ljubljana: Univerza v Ljubljani, Fakulteta za gradbeništvo in geodezijo, Katedra za mehaniko tal z laboratorijem, 2006. 13 f., pril., ilustr. [COBISS.SI-ID 3457377]

114. STOPAR, David, STRES, Blaž. Poročilo o opravljeni analizi vzorcev iz NEK : [naročnik] Nuklearna elektrarna Krško. Ljubljana: Biotehnična fakulteta, Oddelek za živilstvo, Katedra za mikrobiologijo, 2006. 7 f. [COBISS.SI-ID 3341432]

115. STOPAR, David, STRES, Blaž, MAHNE, Ivan. Praktikum iz mikrobne ekologije za študente mikrobiologije. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2006. 71 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 4897912]

116. DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Salt induced stress changes energy metabolism of Vibrio sp. DSM14379. V: The Hidden powers - Microbial communities in action : ISME 11 : Vienna 2006 : 11th International Symposium on Microbial Ecology - ISME-11, Vienna, Austria, August 20-25, 2006 : book of abstracts. Vienna: International Society for Microbial Ecology - ISME, 2006. Str. a237. [COBISS.SI-ID 3255416]

117. GOZNIK, Aleš. Sprememba parametrov kvalitete lizata Vibrio sp. DSM14379 v odvisnosti od koncentracije NaCl : diplomsko delo, univerzitetni študij = The change of the Vibrio sp. DSM14379 lysate quality parameters depending on NaCl concentration : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [A. Goznik]: [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2006. XIII, 50 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 279. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_goznik_ales.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3255672]

118. KRAČUN, Nataša. Struktura in aktivnost mikrobne združbe vzdolž slanostnega gradienta v Sečoveljskih solinah : diplomsko delo, univerzitetni študij = Structure and activity of microbial community along salinity gradient of Sečovlje salterns : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [N. Kračun]: [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije], 2006. XII, 52 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 274. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_kracun_natasa.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3226744]

119. DANEVČIČ, Tjaša. Vpliv slanosti na energetski metabolizem pri bakteriji Vibrio sp. : doktorska disertacija = Effect of salinity on Vibrio sp. energy metabolism : doctoral dissertation. Ljubljana: [T. Danevčič], 2006. XV, 94 f., [10] f. pril., ilustr., tabele. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dd_danevcic_tjasa.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 3244664]

120. FAJFAR, Nataša. Vpliv vrste in koncentracije koloidov na aktivnost bakterij : diplomsko delo, univerzitetni študij = Influence of colloid type and concentration on bacterial activity : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [BF, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije]: [N. Fajfar], 2006. X, 33 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 259. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_fajfar_natasa.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3192696]

121. HABJAN DOVČ, Meta. Vsebnost vitamina C in nitrata v radiču : diplomsko delo, univerzitetni študij = The content of vitamin C and nitrate in chicory : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [BF, Oddelek za živilstvo]: [M. Habjan Dovč], 2006. VIII, 53 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Ljubljana, Diplomske naloge, 1213. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_habjandovc_Meta.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3196280]

122. DOGŠA, Iztok, UMEK, Polona, ARČON, Denis, KURE, Sandra, KURE, Sandra, BAJD, Franci, KONTE, T., STOPAR, David, ŠTRANCAR, Janez. Antimicrobial properties of ▫$TiO_2$▫-based nanotube suspensions and films. V: BAVCON KRALJ, Mojca (ur.), TREBŠE, Polonca (ur.). Book of abstracts = Knjiga povzetkov. 15th International Symposium Spectroscopy in Theory and Practice = 15. mednarodni simpozij Spektroskopija v teoriji in praksi, Nova Gorica, Slovenija, 18.-21. april 2007. Nova Gorica: Univerza, 2007. Str. 110. ISBN 978-961-6311-44-1. [COBISS.SI-ID 21374503]

123. STOPAR, David. Biofilms : lecture at the Department of Biology and Ecology, Novi Sad, February 20th 2007. Novi Sad: Faculty of Science, Department of Biology and Ecology, 2007. [COBISS.SI-ID 3293304]

124. STOPAR, David. Definiranje okolja mikroorganizmov : predavanje na Prirodno-matematičkom fakultetu, Novi Sad, 21.2.2007. Novi Sad: Društvo mikrobiologa Srbije, Podružnica za mikrobiologiju, 2007. [COBISS.SI-ID 3293560]

125. STOPAR, David. Definiranje okolja mikroorganizmov v vodnih ekosistemih. V: RASPOR, Peter (ur.), KUŠČER, Enej (ur.). Voda. Pomen biotehnologije in mikrobiologije za prihodnost: voda, Ljubljana, 18.-19. januarja 2007. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2007. Str. 59-70. Pomen mikrobiologije in biotehnologije za prihodnost, 04. ISBN 978-961-6333-51-1. [COBISS.SI-ID 3289208]

126. STRES, Blaž, DANEVČIČ, Tjaša, LESKOVEC, Simona, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. Denitrification in drained Ljubljana marsh soil at spring thaw. V: KOSALEC, Ivan (ur.), PIGAC, Jasenka (ur.), VUJAKLIJA, Dušica (ur.). Power of microbes in industry and environment : programme and abstracts. Zagreb: Croatian Microbiological Society: Faculty of Veterinary Medicine, [2007]. Str. 137, p 77. ISBN 978-953-96567-5-9. [COBISS.SI-ID 3361656]

127. STRES, Blaž, DANEVČIČ, Tjaša, LESKOVEC, Simona, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. Denitrification in vertical profile of drained Ljubljana marsh soil. V: Denitrification: a challenge for pure and applied science : book of abstracts. Aberdeen: University of Aberdeen, [2007?]. Str. [59]. [COBISS.SI-ID 2295432]

128. MANDIĆ-MULEC, Ines, STRES, Blaž, DANEVČIČ, Tjaša, MRKONJIĆ FUKA, Mirna, KRAIGHER, Barbara, PAL, Levin, RESMAN, Lara, HACIN, Janez, STOPAR, David. Dinamics in microbial activity and changes in community structure in the drained fen soil of the Ljubljana Marsh. V: KOSALEC, Ivan (ur.), PIGAC, Jasenka (ur.), VUJAKLIJA, Dušica (ur.). Power of microbes in industry and environment : programme and abstracts. Zagreb: Croatian Microbiological Society: Faculty of Veterinary Medicine, [2007]. Str. 44, op 6. ISBN 978-953-96567-5-9. [COBISS.SI-ID 3361912]

129. STOPAR, David (recenzent). Dne 05.01.2007 je bil David Stopar imenovan za recenzenta za izvajanje evalvacije domačih znanstvenih periodičnih publikacij in znanstvenih monografij. Ljubljana: Javna agencija za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije, 2007. [COBISS.SI-ID 3295608]

130. DOGŠA, Iztok, ŠTRANCAR, Janez, STOPAR, David. Efficient modeling of polysaccharide conformations based on SAXS experiments. V: ZIMÁNYI, László (ur.), KÓTA, Zoltán (ur.), SZALONTAI, Balázs (ur.). Book of abstracts. RBC 2007, Regional Biophysical Conference, 21-25 August 2007, Balatonfüred, Hungary. [S. l.]: Hungarian Biophysical Society, 2007. Str. 87. [COBISS.SI-ID 21374759]

131. DANEVČIČ, Tjaša, STARIČ, Nejc, MANDIĆ-MULEC, Ines, STOPAR, David. Environmental factors influence pigmentation of Vibrio sp. DSM 14379. V: KOSALEC, Ivan (ur.), PIGAC, Jasenka (ur.), VUJAKLIJA, Dušica (ur.). Power of microbes in industry and environment : programme and abstracts. Zagreb: Croatian Microbiological Society: Faculty of Veterinary Medicine, [2007]. Str. 102, p 42. ISBN 978-953-96567-5-9. [COBISS.SI-ID 3359608]

132. ODIĆ, Duško, TURK, Valentina, STOPAR, David. Environmental stress determines the quality of bacterial lysate and its utilization efficiency in a simple microbial loop. Microbial ecology. 2007, vol. 53, str. 639-649. ISSN 0095-3628. [COBISS.SI-ID 3210360]

133. ŠTEFANIČ, Polonca, DOBLEKAR, Barbara, STRES, Blaž, KRAIGHER, Barbara, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. The evolution of the Bacillus subtilis quorum sensing gene comQ at the microscale. V: Cell-cell communication in bacteria. ASM Confrerences, October 7-10, 2007, Austin, Texas. Washington: American Society for Microbiology, 2007. Str. 35, 23b. ISBN 1-55581-477-8. [COBISS.SI-ID 3419256]

134. ŠTRANCAR, Janez, KAVALENKA, Aleh A., STOPAR, David, ZIHERL, Primož, BELLE, B., FOURNEL, F., HEMMINGA, Marcus A. From local rotational conformational spaces to the protein structures : [invited talk]. V: ZIMÁNYI, László (ur.), KÓTA, Zoltán (ur.), SZALONTAI, Balázs (ur.). Book of abstracts. RBC 2007, Regional Biophysical Conference, 21-25 August 2007, Balatonfüred, Hungary. [S. l.]: Hungarian Biophysical Society, 2007. Str. 23. [COBISS.SI-ID 22519847]

135. MANDIĆ-MULEC, Ines, DANEVČIČ, Tjaša, HACIN, Janez, STRES, Blaž, STOPAR, David. Greenhouse gas emission and the nitrogen cycle in peat soils of Ljubljana marsh. V: Denitrification and related aspects : achievements of COST 856. [S. l.]: Swedish University of Agricultural Sciences, [2007?]. [str. 37]. [COBISS.SI-ID 2224520]

136. STRES, Blaž, DANEVČIČ, Tjaša, PAL, Levin, RESMAN, Lara, JERMAN, Vesna, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. Greenhouse gas emission rates from drained Ljubljana marsh microcosm experiments. V: Microbial community networks : programme : BAGECO 9. 9th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology, 23-27 June 2007, Wernigerode. [S.l.: s.n., 2007]. Str. 162-163, p240. [COBISS.SI-ID 3335032]

137. DANEVČIČ, Tjaša, STRES, Blaž, PAL, Levin, LESKOVEC, Simona, HACIN, Janez, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. Greenhouse gas emission rates from drained Ljubljana marsh microcosm experiments. V: MANDIĆ-MULEC, Ines (ur.), STRES, Blaž (ur.), DANEVČIČ, Tjaša (ur.). COST action 856. Denitrification - basic research and its application in wetlands : book of abstracts. 13th Meeting of COST action 856, September 9 - September 11, University of Ljubljana, Biotechnical Faculty, Ljubljana, Slovenia. Ljubljana: Biotechnical Faculty, 2007. Str. 34. ISBN 978-961-6333-62-7. [COBISS.SI-ID 3338616]

138. PAL, Levin, STRES, Blaž, DANEVČIČ, Tjaša, LESKOVEC, Simona, HACIN, Janez, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. How does the oxic/anoxic cycling affect the pattern of nitrogen removal from Ljubljana marsh peat soil?. V: MANDIĆ-MULEC, Ines (ur.), STRES, Blaž (ur.), DANEVČIČ, Tjaša (ur.). COST action 856. Denitrification - basic research and its application in wetlands : book of abstracts. 13th Meeting of COST action 856, September 9 - September 11, University of Ljubljana, Biotechnical Faculty, Ljubljana, Slovenia. Ljubljana: Biotechnical Faculty, 2007. Str. 31-32. ISBN 978-961-6333-62-7. [COBISS.SI-ID 3339384]

139. ŠTEFANIČ, Polonca, DOBLEKAR, Barbara, STRES, Blaž, KRAIGHER, Barbara, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. How many quorum sensing languages do isolates of Bacillus subtilis use at the microscale. V: Microbial community networks : programme : BAGECO 9. 9th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology, 23-27 June 2007, Wernigerode. [S.l.: s.n., 2007]. Str. 83, p047. [COBISS.SI-ID 3334776]

140. ŠTEFANIČ, Polonca, STRES, Blaž, KRAIGHER, Barbara, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. How many quorum sensing languages do isolates of Bacillus subtilis use at the microscale. V: KOSALEC, Ivan (ur.), PIGAC, Jasenka (ur.), VUJAKLIJA, Dušica (ur.). Power of microbes in industry and environment : programme and abstracts. Zagreb: Croatian Microbiological Society: Faculty of Veterinary Medicine, [2007]. Str. 45, op 7. ISBN 978-953-96567-5-9. [COBISS.SI-ID 3361400]

141. STOPAR, David. The influence of redox potential on the microorganisms activity : lecture at the Department of Biology and Ecology, Novi Sad, February 20th 2007. Novi Sad: Faculty of Science, Department of Biology and Ecology, 2007. [COBISS.SI-ID 3293048]

142. DANEVČIČ, Tjaša, MANDIĆ-MULEC, Ines, STOPAR, David. Influence of salt stress on energy metabolism of Vibrio sp. DSM 14379. V: KOSALEC, Ivan (ur.), PIGAC, Jasenka (ur.), VUJAKLIJA, Dušica (ur.). Power of microbes in industry and environment : programme and abstracts. Zagreb: Croatian Microbiological Society: Faculty of Veterinary Medicine, [2007]. Str. 101, p 41. ISBN 978-953-96567-5-9. [COBISS.SI-ID 3360120]

143. KAMENŠEK, Simona. Izražanje od proteina LexA odvisnih genov bakterije Escherichia coli na ravni posameznih celic : diplomsko delo, univerzitetni študij = Expression of LexA regulated genes in Escherichia coli at the single cell level : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [S. Kamenšek], 2007. XII, 71 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 319. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/mikrobiologija/dn_kamensek_simona.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3365496]

144. JERŠEK, Miha, HERLEC, Uroš, VIDRIH, Renato (avtor, fotograf), KUNAVER, Jurij (avtor, fotograf), TOME, Staša, JERNEJC KODRIČ, Mojca, JERŠEK, Barbara, SKET, Boris, STOPAR, David. Kaj spreminja svet. Ljubljana: Prirodoslovni muzej Slovenije: Mladinska knjiga, sep. 2007. 1 plakat, barve. [COBISS.SI-ID 632821]

145. MANDIĆ-MULEC, Ines, AVGUŠTIN, Gorazd, ČADEŽ, Polona, HACIN, Janez, JERMAN, Vesna, KRAIGHER, Barbara, LESKOVEC, Simona, MAHNE, Ivan, STOPAR, David, STRES, Blaž. Ljubljansko barje - ocena okoljskih sprememb z aktivnostjo in strukturo mikrobne združbe : zaključno poročilo o rezultatih raziskovalnega projekta : šifra projekta J4-6149-0481-05. Ljubljana: Biotehnična fakulteta, 2007. 10 f. [COBISS.SI-ID 3337080]

146. LAMOVŠEK, Janja. Osmotske volumske spremembe humanega eritrocita zaradi vpliva Hg2+, Pb2+ in Cd2+ na delovanje membranskih kanalčkov : diplomsko delo, univerzitetni študij = Osmotic volume changes in human erythrocyte due to effects of Hg2+, Pb2+ and Cd2+ on membrane channels : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [J. Goršek], 2007. XIII, 71 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 283. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_gorsek_janja.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3271544]

147. IVANČIČ, Tina, MANDIĆ-MULEC, Ines, STOPAR, David. Physiological response of Escherichia coli to temperature cycling. V: KOSALEC, Ivan (ur.), PIGAC, Jasenka (ur.), VUJAKLIJA, Dušica (ur.). Power of microbes in industry and environment : programme and abstracts. Zagreb: Croatian Microbiological Society: Faculty of Veterinary Medicine, [2007]. Str. 131, p 71. ISBN 978-953-96567-5-9. [COBISS.SI-ID 3359864]

148. STOPAR, David, DANEVČIČ, Tjaša. Poročilo o opravljeni mikrobiološki analizi vzorcev vode in lesa najstarejšega kolesa, odkritega na Ljubljanskem Barju : [naročnik] Katarina Toman Kračina, Mestni muzej Ljubljana. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Katedra za mikrobiologijo, 2007. 4 f. [COBISS.SI-ID 3341176]

149. HACIN, Janez, DANEVČIČ, Tjaša, STRES, Blaž, PAL, Levin, LESKOVEC, Simona, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. Potential for nitrogen removal in the peat soils of Ljubljana marsh. V: MANDIĆ-MULEC, Ines (ur.), STRES, Blaž (ur.), DANEVČIČ, Tjaša (ur.). COST action 856. Denitrification - basic research and its application in wetlands : book of abstracts. 13th Meeting of COST action 856, September 9 - September 11, University of Ljubljana, Biotechnical Faculty, Ljubljana, Slovenia. Ljubljana: Biotechnical Faculty, 2007. Str. 22. ISBN 978-961-6333-62-7. [COBISS.SI-ID 3338872]

150. DANEVČIČ, Tjaša, MANDIĆ-MULEC, Ines. Praktikum iz fiziologije mikroorganizmov : za študente mikrobiologije. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2007. 66 str., ilustr. ISBN 978-961-6333-59-7. [COBISS.SI-ID 234760448]

151. STOPAR, David. Priročnik iz mikrobne ekologije : za študente mikrobiologije. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2007. 430 str., ilustr. ISBN 978-961-6333-53-5. [COBISS.SI-ID 231292672]

152. KURE, Sandra, DOGŠA, Iztok, UMEK, Polona, ARČON, Denis, BAJD, Franci, KONTE, T., STOPAR, David, ŠTRANCAR, Janez. Reactive oxygen species generation in ▫$TiO_2$▫-based nanotube suspensions under different physico-chemical conditions. V: ZIMÁNYI, László (ur.), KÓTA, Zoltán (ur.), SZALONTAI, Balázs (ur.). Book of abstracts. RBC 2007, Regional Biophysical Conference, 21-25 August 2007, Balatonfüred, Hungary. [S. l.]: Hungarian Biophysical Society, 2007. Str. 140. [COBISS.SI-ID 21604647]

153. FAJDIGA, Marko. Salinomicin v metafilaksi kokcidioze pri piščancih brojlerjih : doktorska disertacija. Ljubljana: [M. Fajdiga], 2007. 85 f., graf. prikazi, tabele. [COBISS.SI-ID 2776954]

154. KAVALENKA, Aleh A., ŠTRANCAR, Janez, STOPAR, David, ZIHERL, Primož, BELLE, Valerie, HEMMINGA, Marcus A. SDSL EPR - GHOST and conformation space modeling for membrane protein structure determination. V: ZIMÁNYI, László (ur.), KÓTA, Zoltán (ur.), SZALONTAI, Balázs (ur.). Book of abstracts. RBC 2007, Regional Biophysical Conference, 21-25 August 2007, Balatonfüred, Hungary. [S. l.]: Hungarian Biophysical Society, 2007. Str. 78. [COBISS.SI-ID 21604391]

155. STRES, Blaž, DANEVČIČ, Tjaša, MRKONJIĆ FUKA, Mirna, KRAIGHER, Barbara, PAL, Levin, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. Seasonal changes in microbial activity are not accompanied by major changes in community structure in the fen soil of the Ljubljana Marsh. V: MANDIĆ-MULEC, Ines (ur.), STRES, Blaž (ur.), DANEVČIČ, Tjaša (ur.). COST action 856. Denitrification - basic research and its application in wetlands : book of abstracts. 13th Meeting of COST action 856, September 9 - September 11, University of Ljubljana, Biotechnical Faculty, Ljubljana, Slovenia. Ljubljana: Biotechnical Faculty, 2007. Str. 33. ISBN 978-961-6333-62-7. [COBISS.SI-ID 3339896]

156. MANDIĆ-MULEC, Ines, STRES, Blaž, DANEVČIČ, Tjaša, MRKONJIĆ FUKA, Mirna, KRAIGHER, Barbara, PAL, Levin, RESMAN, Lara, STOPAR, David. Seasonal changes in microbial activity are not accompanied by major changes in community structure in the fen soil of the Ljubljana Marsh. V: Microbial community networks : programme : BAGECO 9. 9th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology, 23-27 June 2007, Wernigerode. [S.l.: s.n., 2007]. Str. 120, p136. [COBISS.SI-ID 3335288]

157. ODIĆ, Duško. Vpliv kvalitete bakterijskega lizata na prevezavo hranil v mikrobni zanki : doktorska disertacija = The effect of bacterial lysate quality on nutrients turnover in the microbial loop : doctoral dissertation. [Ljubljana: D. Odić], 2007. XIII, 145, [11] f., ilustr., tabele. [COBISS.SI-ID 236007936]

158. STARIČ, Nejc. Vpliv okoljskih faktorjev na produkcijo barvila naravnega izolata Vibrio sp. : diplomsko delo, univerzitetni študij = Influence of environmental factors on pigment production in a natural isolate Vibrio sp. : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [N. Starič], 2007. X, 37 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 316. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_staric_nejc.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3352440]

159. JORDAN, Martina. Vpliv okoljskih faktorjev na sintezo in aktivnost protimikrobne snovi izolirane iz naravnega izolata Vibrio sp. : diplomsko delo, univerzitetni študij = Influence of environmental factors on the production and activity of antimicrobial substance isolated from natural isolate Vibrio sp. : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [M. Jordan], 2007. X, 47 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 318. [COBISS.SI-ID 3365240]

160. BREGAR, Olja. Vpliv spreminjanja temperature med rastjo celic na presnovno aktivnost bakterij Escherichia coli : diplomsko delo, univerzitetni študij = Influence of shifting temperature during cell growth on metabolic activity of bacteria Escherichia coli : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [O. Bregar], 2007. X, 50 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 313. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_bregar_olja.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3343736]

161. BISTAN, Mirjana. Vpliv strupenih dejavnikov na profil celičnih maščobnih kislin bakterije Pseudomonas putida : diplomsko delo, univerzitetni študij = Influence of toxic compounds on cellular fatty acid profile of bacteria Pseudomonas putida : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [M. Bistan], 2007. XII, 69 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 311. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_bistan_mirjana.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3343224]

162. REPIČ, Doroteja. Aktivnost in številčnost mikrobne združbe v različnih globinah barjanskih tal : diplomsko delo, univerzitetni študij = Activity and abundance of microbial community in different depths of peat-land soil : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [D. Repič], 2008. X, 59 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 347. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_repic_doroteja.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3467640]

163. DANEVČIČ, Tjaša, STARIČ, Nejc, ŠTERN, Alja, STOPAR, David. Bioactivity and regulation of prodigiosin like pigment from Vibrio sp. DSM14379. V: BARLIČ-MAGANJA, Darja (ur.), RASPOR, Peter (ur.). Microbiology for today : book of abstracts = zbornik povzetkov. 4th Congress of the Slovenian Microbiological Society with International Participation, Portorož, November 2008. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo: = Slovenian Microbiological Society, 2008. Str. 109. ISBN 978-961-90346-4-4. [COBISS.SI-ID 3538040]

164. IVANČIČ, Tina, JAMNIK, Polona, MANDIĆ-MULEC, Ines, STOPAR, David. Does periodic temperature cycling affect physiology of bacteria Escherichia coli?. V: Abstract Book. XII. International Congress of Bacteriology and Applied Microbiology, 5-9 August 2008, Istanbul. Istanbul: Turkish Microbiological Society, 2008. Str. bp-528. [COBISS.SI-ID 3530104]

165. DANEVČIČ, Tjaša, GNEZDA MEIJER, Kaja, ODIĆ, Duško, DOGŠA, Iztok, ŽIGMAN, Mihaela, ČERNE, Aleša, TRČEK, Tatjana, BOŠTJANČIČ, Emanuela, GOZNIK, Aleš, JORDAN, Martina, JERMAN, Vesna, STARIČ, Nejc, ŠTERN, Alja, MANDIĆ-MULEC, Ines, ŠTRANCAR, Janez, RILFORS, Leif, LINDBLOM, Göran, DIJKEMA, Cor, STOPAR, David. Ecophysiology of Vibrio sp. DSM 14379 isolated from the Northern Adriatic Sea. V: BARLIČ-MAGANJA, Darja (ur.), RASPOR, Peter (ur.). Microbiology for today : book of abstracts = zbornik povzetkov. 4th Congress of the Slovenian Microbiological Society with International Participation, Portorož, November 2008. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo: = Slovenian Microbiological Society, 2008. Str. 128. ISBN 978-961-90346-4-4. [COBISS.SI-ID 3537016]

166. DOGŠA, Iztok, ŠTRANCAR, Janez, LAGGNER, Peter, STOPAR, David. Efficient modeling of polysaccharide conformations based on Small-Angle X-ray Scattering experimental data. Polymer. [Print ed.]. 2008, vol. 49, str. 1398-1406. ISSN 0032-3861. [COBISS.SI-ID 3417464]

167. DANEVČIČ, Tjaša, STRES, Blaž, HACIN, Janez, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. Emissions of CO2, CH4 and N2O from fen and bog peatlands at Ljubljana Marsh. V: BARLIČ-MAGANJA, Darja (ur.), RASPOR, Peter (ur.). Microbiology for today : book of abstracts = zbornik povzetkov. 4th Congress of the Slovenian Microbiological Society with International Participation, Portorož, November 2008. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo: = Slovenian Microbiological Society, 2008. Str. 94. ISBN 978-961-90346-4-4. [COBISS.SI-ID 3538296]

168. DOLENEC, Sabina, STOPAR, David, MIRTIČ, Breda. Evaluation of bioreceptivity of some Slovenian limestones. V: ŁUKASZEWICZ, Jadwiga W. (ur.), NIEMCEWICZ, Piotr (ur.). Proceedings. 11th International Congress on Deterioration and Conservation of Stone, 15-20 September 2008, Torun, Poland. Toruń: Uniwersytetu Mikołaja Kopernika, cop. 2008. Str. 685-692. ISBN 978-83-231-2236-4, ISBN 978-83-231-2237-1. [COBISS.SI-ID 512117291]

169. IVANČIČ, Tina, JAMNIK, Polona, MANDIĆ-MULEC, Ines, RASPOR, Peter, STOPAR, David. Fiziološki odgovor bakterije Escherichia coli na periodično spreminjanje temperature = Physiology response of Escherichia coli on cyclic changes of temperature. V: RASPOR, Peter (ur.), JAMNIK, Polona (ur.). Proteomika. Posvetovanje Pomen biotehnologije in mikrobiologije za prihodnost, 31. januar in 1. februar 2008, Ljubljana. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2008. Str. 119-127. Pomen biotehnologije in mikrobiologije za prihodnost, 05. ISBN 978-961-6333-63-4. [COBISS.SI-ID 3404152]

170. MARINŠEK, Tjaša. Frakcionacija morskih makroagregatov med mikrobno razgradnjo : diplomsko delo, univerzitetni študij = Fractionation of marine macroaggregates during microbial degradation : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [T. Marinšek], 2008. XII, 69 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 358. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_marinsek_tjasa.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3501432]

171. PAVLICA, Vesna. Frakcionacija produktov med encimsko razgradnjo morskih makroagregatov : diplomsko delo, univerzitetni študij = Fractionation of marine macroaggregate products during enzymatic degradation : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [V. Pavlica], 2008. X, 56 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 369. [COBISS.SI-ID 3546744]

172. STARIČ, Nejc, DANEVČIČ, Tjaša, ŠTERN, Alja, STOPAR, David. Influence of environmental factors on pigment production in Vibrio sp. DSM14379. V: BARLIČ-MAGANJA, Darja (ur.), RASPOR, Peter (ur.). Microbiology for today : book of abstracts = zbornik povzetkov. 4th Congress of the Slovenian Microbiological Society with International Participation, Portorož, November 2008. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo: = Slovenian Microbiological Society, 2008. Str. 135. ISBN 978-961-90346-4-4. [COBISS.SI-ID 3537784]

173. STRES, Blaž, DANEVČIČ, Tjaša, PAL, Levin, MRKONJIĆ FUKA, Mirna, RESMAN, Lara, LESKOVEC, Simona, HACIN, Janez, STOPAR, David, MAHNE, Ivan, MANDIĆ-MULEC, Ines. Influence of temperature and soil water content on bacterial, archaeal and denitrifying microbial communities in drained fen grassland soil microcosms. V: Community networks - BAGECO 9 conference on bacterial genetics and ecology : Wernigerode, Germany, June 23-27 2007. Amsterdam: Elsevier, 2008. Issue 1, vol. 66, str. 110-122. FEMS microbiology, ecology, Vol. 66, Issue 1, 2008. ISSN 0168-6496. DOI: 10.1111/j.1574-6941.2008.00555.x. [COBISS.SI-ID 2343816]

174. DOGŠA, Iztok. Karakterizacija strukturiranosti glikoziliranih celičnih površin z metodo ozkokotnega rentgenskega sipanja in elektronsko paramagnetno resonanco : doktorska disertacija (s področja biotehnologije) = Characterization of structural properties of glycosylated cellular surfaces by small angle X-ray scattering and electron paramagnetic resonance : Doctoral dissertation. Ljubljana: [I. Dogša]: [BF, Podiplomski študij bioloških in biotehniških znanosti], 2008. XIII, 97 f., ilustr., preglednice. [COBISS.SI-ID 3412856]

175. MANDIĆ-MULEC, Ines, AUSEC, Luka, DANEVČIČ, Tjaša, DOGŠA, Iztok, HACIN, Janez, LEVIČNIK HOEFFERLE, Špela, JERMAN, Vesna, KRAIGHER, Barbara, LEŠNJAK, Mojca, PAL, Levin, STOPAR, David. Microbial communities cycling soil nutrients and their structure-function relationships. V: VUJAKLIJA, Dušica (ur.). 4th Croatian microbiological congress with international participation : Zadar, Croatia, 24th-27th September, 2008 : programme and abstracts. Zagreb: Croatian Microbiological Society, 2008. Str. 31. ISBN 978-953-96567-7-3. [COBISS.SI-ID 3523960]

176. BRATAŠEVEC, Kristina, DANEVČIČ, Tjaša, TREBŠE, Polonca, STOPAR, David. Microorganisms trigger chemical degradation of diazinon. International biodeterioration & biodegradation. [Print ed.]. 2008, vol. 62, str. 293-296. ISSN 0964-8305. DOI: 10.1016/j.ibiod.2008.02.003. [COBISS.SI-ID 3457912]

177. STOPAR, David. Mikrobna oaza v tleh = Microbial oasis in the soil. V: STRGULC KRAJŠEK, Simona (ur.), VIČAR, Minka (ur.), JABLONKA, Eva. Ekosistemi - povezanost živih sistemov : zbornik prispevkov = Ecosystems - interdependence of living systems : proceedings. 1. natis. Ljubljana: Zavod RS za šolstvo, 2008. Str. 57-60. ISBN 978-961-234-725-3. [COBISS.SI-ID 3589752]

178. STOPAR, David, ABEDON, Stephen T. Modeling bacteriophage population growth. V: ABEDON, Stephen T. (ur.). Bacteriophage ecology : population growth, evolution, and impact of bacterial viruses. Cambridge: Cambridge University Press, 2008. Str. 389-414. Advances in molecular and cellular microbiology, 15. ISBN 978-0-521-85845-8, ISBN 0-521-85845-3. [COBISS.SI-ID 3457144]

179. JURADA, Mateja. Morfologija, kultivabilnost in preživelost celic ter izražanje genov flaA in groEL bakterij Campylobacter jejuni v razmerah toplotnega stresa : diplomsko delo, univerzitetni študij = Morphology, cultivability and viability of Campylobacter jejuni cells and expression of the genes flaA and groEL in conditions of heat stress : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [M. Jurada], 2008. XII, 77 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Ljubljana, Diplomske naloge, 1279. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_jurada_mateja.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3456376]

180. ŠTERN, Alja. Opis lastnosti rdečega pigmenta iz naravnega izolata bakterije Vibrio sp. : diplomsko delo, univerzitetni študij = Characterization of a red pigment from the natural isolate Vibrio sp. : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [A. Štraser], 2008. XI, 51 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 363. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_straser_alja.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3506552]

181. IVANČIČ, Tina, JAMNIK, Polona, MANDIĆ-MULEC, Ines, STOPAR, David. Periodic temperature cycling affects physiology of bacteria Escherichia coli. V: Protein identification - mass spectrometry : programme and abstracts of lectures and posters presented at the 2nd European summer school in proteomic basics : Brixen/Bressanone, July 13-19, 2008. [S. l.: s. n.], 2008. Str. 75. [COBISS.SI-ID 3530360]

182. DOGŠA, Iztok, STOPAR, David. Structural properties of bacterial polysaccharides by small-angle-X-ray scattering. V: BARLIČ-MAGANJA, Darja (ur.), RASPOR, Peter (ur.). Microbiology for today : book of abstracts = zbornik povzetkov. 4th Congress of the Slovenian Microbiological Society with International Participation, Portorož, November 2008. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo: = Slovenian Microbiological Society, 2008. Str. 131. ISBN 978-961-90346-4-4. [COBISS.SI-ID 3536760]

183. STOJKOVIČ, Gorazd. Vpliv hitrega periodičnega spreminjanja temperature na rast bakterije Escherichia coli : diplomsko delo, univerzitetni študij = Influence of fast periodic temperature cycling on growth of bacteria Escherichia coli : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [G. Stojkovič], 2008. X, 34 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 356. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_stojkovic_gorazd.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3494008]

184. ŠTRANCAR, Janez, KAVALENKA, Aleh A., ZIHERL, Primož, STOPAR, David, HEMMINGA, Marcus A. Analysis of side chain rotational restrictions of membrane-embedded proteins by spin-label ESR spectroscopy. Journal of magnetic resonance. 2009, vol. 197, no. 2, str. 245-248. ISSN 1090-7807. [COBISS.SI-ID 22594087]

185. STOPAR, David, KOEHORST, Rob B. M., SPRUIJT, Ruud B., HEMMINGA, Marcus A. Asymmetric dipping of bacteriophage M13 coat protein with increasing lipid bilayer thickness. Biochimica et biophysica acta. Biomembranes. [Print ed.]. 2009, vol. 1788, no. 10, str. 2217-2221. ISSN 0005-2736. [COBISS.SI-ID 3739256]

186. IVANČIČ, Tina, VODOVNIK, Maša, MARINŠEK-LOGAR, Romana, STOPAR, David. Conditioning of the membrane fatty acid profile of Escherichia coli during periodic temperature cycling. Microbiology. 2009, vol. 155, no. 10, str. 3461-3463. ISSN 1350-0872. DOI: 10.1099/mic.0.029637-0. [COBISS.SI-ID 3663736]

187. DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Environmental quality determines physiological behaviour of bacteria. V: DRURY, Evan K. (ur.), PRIDGEN, Taylor S. (ur.). Handbook on environmental quality. New York: Nova Science Publishers, cop. 2009. Str. 349-364. Environmental research advances series. ISBN 1-60741-420-1, ISBN 978-1-60741-420-9. [COBISS.SI-ID 3624568]

188. MAČEK, Irena, VIDEMŠEK, Urška, KASTELEC, Damijana, STOPAR, David, VODNIK, Dominik. Geological CO2 affects microbial respiration rates in Stavešinci mofette soils = Geološki CO2 vpliva na mikrobno dihanje v tleh na območju mofete Stavešinci. Acta biologica slovenica : ABS. [Tiskana izd.]. 2009, vol. 52, št. 2, str. 41-48. ISSN 1408-3671. Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 6209657]

189. STOPAR, David, SPRUIJT, Ruud B., HEMMINGA, Marcus A. Membrane protein frustration : protein incorporation into hydrophobic mismatched binary lipid mixtures. Biophysical journal. feb. 2009, vol. 96, str. 1408-1414. ISSN 0006-3495. [COBISS.SI-ID 3625080]

190. RASPOR, Peter, BATIČ, Martin, ČADEŽ, Neža, DANEVČIČ, Tjaša, AVBELJ, Martina, FUJS, Štefan, GASPARIČ, Aleš, GNEZDA MEIJER, Kaja, MIKLIČ MILEK, Damjana, HACIN, Janez, LEVIČNIK HOEFFERLE, Špela, JAMNIK, Polona, JERMAN, Sergej, JENKO-BRINOVEC, Špelca, JERŠEK, Barbara, KLANČNIK, Anja, KOVAČ, Boris, KRAIGHER, Barbara, KURINČIČ, Marija, MAHNE, Ivan, MANDIĆ-MULEC, Ines, MAVRI, Jan, PAŠ, Maja, ODIĆ, Duško, PETKOVIĆ, Hrvoje, PLAPER, Andreja, POVHE JEMEC, Katja, IVANČIČ, Tina, SMOLE MOŽINA, Sonja, STOPAR, David, STRES, Blaž, ŠERGAN, Matej, ŠTEFANIČ, Polonca, ZORMAN, Tina, ZUPAN, Jure. Mikrobiologija in biotehnologija živil in okolja = Microbiology and biotechnology of food and environment. V: RASPOR, Peter (ur.), PETKOVIĆ, Hrvoje (ur.). Protimikrobne snovi. Posvetovanje Pomen biotehnologije in mikrobiologije za prihodnost, 29. in 30. januar 2009, Ljubljana. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2009. Str. 259-272. Pomen biotehnologije in mikrobiologije za prihodnost, 06. ISBN 978-961-6333-71-9. [COBISS.SI-ID 3581304]

191. ŠTIMPFEL, Martin. Molekularno biološka analiza pritrjenih in planktonskih bakterijskih združb v lokalnem vodovodnem sistemu : diplomsko delo = Characterization of attached and planktonic bacterial communities in local water distribution system by molecular methods : graduation thesis. Ljubljana: [M. Štimpfel], 2009. XI, 56 f., [34] f. pril., ilustr., preglednice. Biotehniška fakulteta, Študij biotehnologije, Diplomska dela, 20. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_stimpfel_martin.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 6116473]

192. STOPAR, David, DANEVČIČ, Tjaša. Poročilo o opravljeni mikrobiološki analizi bistvene oskrbovalne vode in oblog toplotnega izmenjevalca iz NEK : [naročnik] Nuklearna elektrarna Krško. Ljubljana: Biotehnična fakulteta, Oddelek za živilstvo, Katedra za mikrobiologijo; Krško: Nuklearna elektrarna Krško, 2009. 7 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 3761784]

193. DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Praktikum iz mikrobiologije : za študente agronomije. 2. izd. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2009. IV, 44 str., ilustr. ISBN 978-961-6333-75-7. [COBISS.SI-ID 245756928]

194. STOPAR, David, STRES, Blaž, MAHNE, Ivan. Praktikum iz mikrobne ekologije za študente mikrobiologije. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2009. ISBN 978-961-6333-60-3. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 234767872]

195. DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Protimikrobne snovi iz morskih mikroorganizmov : primer Vibrio sp. = Antimicrobial agents from marine microorganisms : case Vibrio sp. V: RASPOR, Peter (ur.), PETKOVIĆ, Hrvoje (ur.). Protimikrobne snovi. Posvetovanje Pomen biotehnologije in mikrobiologije za prihodnost, 29. in 30. januar 2009, Ljubljana. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2009. Str. 107-118. Pomen biotehnologije in mikrobiologije za prihodnost, 06. ISBN 978-961-6333-71-9. [COBISS.SI-ID 3575928]

196. BORIĆ VEZJAK, Maja. Razvoj nove metode za merjenje mikroviskoznosti v mikrobiologiji : diplomsko delo, univerzitetni študij = Development of a new method for measurement of microviscosity in microbiology : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [M. Borić], 2009. IX, 32 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 406. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_boric_maja.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3668088]

197. KOS KRAMAR, Maja. Vloga naravne morske bakterijske združbe pri razgradnji odmrlega materiala meduze Aurelia aurita : diplomsko delo, univerzitetni študij = Role of natural marine bacterial community in degradation of dead jellyfish Aurelia aurita : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [M. Kos], 2009. XIV, 67 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 417. [COBISS.SI-ID 3696760]

198. BENKO, Julija. Vpliv divjega tipa Vibrio sp. na konkurenčno sposobnost nepigmentiranih sevov Vibrio sp. : diplomsko delo, univerzitetni študij = Influence of wild type strain of Vibrio sp. on the fitness of nonpigmented strains of Vibrio sp. : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [J. Benko], 2009. XI, 36 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 393. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_benko_julija.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3643000]

199. GORIŠEK, Maja. Vpliv nonilfenola na strukturo mikrobne združbe v reaktorju s pritrjeno biomaso : diplomsko delo, univerzitetni študij = The effect of nanylphenol on the structure of microbial community in bioreactor with attached biomass : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [M. Gorišek], 2009. XIV, 80 f., ilustr., preglednice. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 388. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_gorisek_maja.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3612792]

200. RASPOR, Peter, AVBELJ, Martina, ČADEŽ, Neža, DANEVČIČ, Tjaša, DOGŠA, Iztok, JAMNIK, Polona, KLANČNIK, Anja, KOSEL, Janez, MANDIĆ-MULEC, Ines, SMOLE MOŽINA, Sonja, STOPAR, David, ZUPAN, Jure. Communication among microorganisms : the phenomen with biotech challenge : [invited lecture]. V: FRECE, Jadranka (ur.), KOS, Blaženka (ur.), MRŠA, Vladimir (ur.). Power of microbes in industry and environment 2010 : programme and abstracts. Central European Symposium on Industrial Microbiology and Microbial Ecology, Malinska, Croatia, 22nd-25th September, 2010. Zagreb: Croatian Microbiological Society, [2010]. Str. 17, il 2. ISBN 978-953-7778-00-2. [COBISS.SI-ID 3812984]

201. RASPOR, Peter, AVBELJ, Martina, ČADEŽ, Neža, DANEVČIČ, Tjaša, DOGŠA, Iztok, JAMNIK, Polona, KLANČNIK, Anja, KOSEL, Janez, MANDIĆ-MULEC, Ines, SMOLE MOŽINA, Sonja, STOPAR, David, ZUPAN, Jure. Communication among microorganisms : who talks to whom and why?. V: Mikromed 2010. VII Kongres Mikrobiologa Srbije, Beograd, 03-05. jun 2010. [Beograd]: Udruženje mikrobiologa Srbije: Udruženje medicinskih mikrobiologa Srbije: Institut za higijenu i tehnologiju mesa, 2010. Str. [1]. [COBISS.SI-ID 4366200]

202. DRČAR, Tjaša. Določanje signalnih molekul in vpliv slanosti na njihovo produkcijo pri bakteriji Vibrio sp. : diplomsko delo, univerzitetni študij = Detection of signal molecules and influence of salinity on their production in Vibrio sp. : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [T. Drčar], 2010. XI, 52 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 428. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_drcar_tjasa.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3763064]

203. DANEVČIČ, Tjaša, MANDIĆ-MULEC, Ines, STRES, Blaž, STOPAR, David, HACIN, Janez. Emissions of CO2, CH4 and N2O from Southern European peatlands. Soil biology & biochemistry. [Print ed.]. 2010, vol. 42, str. 1437-1446. ISSN 0038-0717. DOI: 10.1016/j.soilbio.2010.05.004. [COBISS.SI-ID 3779192]

204. VRABEC, Katarina. Fizikalno-kemijski opis zunajceličnih polimernih substanc (EPS) pri bakteriji Bacillus subtilis : diplomsko delo, univerzitetni študij = Physico-chemical description of extracellular polymeric substances (EPS) of Bacillus subtilis : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [K. Vrabec], 2010. IX, 36 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 449. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_vrabec_katarina.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3809656]

205. ODIĆ, Duško, BUDIČ, Bojan, MANDIĆ-MULEC, Ines, STOPAR, David. Influence of bacterial lysate quality on growth of two bacterioplankton species. Microbial ecology. 2010, issue 2, vol. 59, str. 246-252. ISSN 0095-3628. DOI: 10.1007/s00248-009-9557-1. [COBISS.SI-ID 3653496]

206. KOVČE RAMŠAK, Barbara. Mikrobna raznolikost prevlek, ki tvorijo 'jamsko srebro' v Pajsarjevi jami : diplomsko delo = The diversity of microbial communities that colonize cave walls and form 'the cave silver phenomenon' in the cave Pajsarjeva jama : graduation thesis. Ljubljana: [B. Kovče], 2010. X, 57 f., ilustr. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 456. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_kovce_barbara.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3821432]

207. STOPAR, David. The more you see : spectroscopy in molecular biophysics. European biophysics journal. 2010, vol. 39, str. 497-497. ISSN 0175-7571. DOI: 10.1007/s00249-010-0588-9. [COBISS.SI-ID 3754360]

208. STOPAR, David, DANEVČIČ, Tjaša. Poročilo o opravljeni mikrobiološki analizi vzorcev tal in lesa iz kolišča odkritega na območju Špice med Ljubljanico in Gruberjevim prekopom na Prulah : [naročnik] Irena Šinkovec, Mestni muzej Ljubljana. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Katedra za mikrobiologijo, 2010. 5 f., ilustr. [COBISS.SI-ID 3868536]

209. DOGŠA, Iztok, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines, LAGGNER, Peter. A small angle X-ray scattering (SAXS) approach to study complex extracellular bacterial matrices. V: Biofilms IV : Communities bridging disciplines : conference handbook. 4th International Conference Biofilms, 1-3 September 2010, Winchester, UK. Southampton: University of Southampton, 2010. Str. 66, no. 106. [COBISS.SI-ID 3872376]

210. REBERNIK, Mateja. Študij vezave polifenolov na goveji serumski albumin z diferenčno dinamično kalorimetrijo : diplomsko delo, univerzitetni študij = The study of polyphenols binding to bovine serum albumin with differential scanning calorimetry : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [M. Presečnik], 2010. XI, 46 f., [5] f. pril., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Ljubljana, Diplomske naloge, 1394. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_presecnik_mateja.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3808120]

211. STARIČ, Nejc, DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Vibrio sp. DSM 14379 pigment production - a competitive advantage in the environment?. Microbial ecology. 2010, vol. 60, no. 3, str. 592-598. ISSN 0095-3628. DOI: 10.1007/s00248-010-9671-0. [COBISS.SI-ID 3772024]

212. HEMMINGA, Marcus A., VOS, Werner L., NAZAROV, Petr V., KOEHORST, Rob B. M., WOLFS, Cor J. A. M., SPRUIJT, Ruud B., STOPAR, David. Viruses : incredible nanomachines. New advances with filamentous phages. European biophysics journal. 2010, issue 4, vol. 39, str. 541-550. ISSN 0175-7571. DOI: 10.1007/s00249-009-0523-0. [COBISS.SI-ID 3659128]

213. RAKUŠA, Janko. Vpliv okoljskih dejavnikov na proizvodnjo N2O pri bakteriji Vibrio sp. DSM14379 : diplomsko delo, univerzitetni študij = Influence of environmental factors on production of N2O in Vibrio sp. DSM14379 : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [J. Rakuša], 2010. IX, 35 f., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 458. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_rakusa_janko.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3839608]

214. ŠPAN, Nataša. Vpliv strupenih dejavnikov na profil celičnih maščobnih kislin praživali Tetrahymena thermophila : diplomsko delo = Influence of toxic compounds on cellular fatty acid profile of protozoon Tetrahymena thermophila : graduation thesis. Ljubljana: [N. Špan], 2010. XIII, 56 f., [14] f. pril., ilustr., preglednice. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 429. [COBISS.SI-ID 3763320]

215. DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Asymmetric response of carbon metabolism at high and low salt stress in Vibrio sp. DSM14379. Microbial ecology. 2011, vol. 62, str. 198-204. ISSN 0095-3628. DOI: 10.1007/s00248-011-9870-3. [COBISS.SI-ID 3915640]

216. BORIĆ VEZJAK, Maja, DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Bacterial communication in viscous media - the same result with less signal molecules. V: 4th ASM Conference on Cell-cell communication in bacteria. ASM Conferences, November 6-9, 2011, Miami, Florida. Washington: American Society for Microbiology, 2011. Str. 61, [no.] 35. ISBN 978-1-55581-734-3. [COBISS.SI-ID 4027512]

217. SIMČIČ, Anja. Biorazgradnja derivatov celuloze z bakterijo Cellulomonas uda : diplomsko delo, univerzitetni študij = Biodegradation of cellulose derivates with bacterium Cellulomonas uda : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [A. Simčič], 2011. X, 39 f., [6] f. pril., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 483. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_simcic_anja.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3929976]

218. BORIĆ VEZJAK, Maja, DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. The effect of viscosity on physiological status of Vibrio sp. DSM 14379. V: FEMS 2011. 4th Congress of European Microbiologists, Geneva, Switzerland, June 26-30, 2011. Geneva: FEMS, 2011. Str. [1]. [COBISS.SI-ID 4150904]

219. DOGŠA, Iztok, BRLOŽNIK, Mojca, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. The impact of growth medium on biofilm morphology and exopolymer composition in Bacillus subtilis. V: JANEŽIČ, Sandra (ur.), et al. Abstract book. 9th Congress of the Slovenian Biochemical Society [also] 5th Congress of the Slovenian Microbiological Society with International Participation [also] 3rd CEFORM (Central European Forum for Microbiology), Maribor, 12th - 15th October 2011. Maribor: Zavod za zdravstveno varstvo, 2011. Str. 198, p72. ISBN 978-961-90895-5-2. [COBISS.SI-ID 3952760]

220. TOMC, Urška. Izolacija mikroorganizmov iz obrata proizvodnje vodnih barv in analiza učinkovitosti biocidov : diplomsko delo = Isolation of microorganisms from water-based paint manufacturing plant and analysis of efficiency of biocides : graduation thesis. Ljubljana: [U. Tomc], 2011. XII, 76 f., [8] f. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 479. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_tomc_urska.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3926392]

221. BORIĆ VEZJAK, Maja, DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Prodigiosin from Vibrio sp. DSM 14379 : a new UV-protective pigment. Microbial ecology. 2011, vol. 62, str. 528-536. ISSN 0095-3628. DOI: 10.1007/s00248-011-9857-0. [COBISS.SI-ID 3915896]

222. OVEN, Irena, KROŠNJAK, Andrea, KLADNIK, Urška, DANEVČIČ, Tjaša, DUŠANIĆ, Daliborka, STOPAR, David, NARAT, Mojca. Prodigiosin from Vibrio sp. DSM14379 has potent in vitro anticancer activity. V: JANEŽIČ, Sandra (ur.), et al. Abstract book. 9th Congress of the Slovenian Biochemical Society [also] 5th Congress of the Slovenian Microbiological Society with International Participation [also] 3rd CEFORM (Central European Forum for Microbiology), Maribor, 12th - 15th October 2011. Maribor: Zavod za zdravstveno varstvo, 2011. Str. 252, p126. ISBN 978-961-90895-5-2. [COBISS.SI-ID 2951816]

223. POKLAR ULRIH, Nataša, ABRAMOVIČ, Helena, BERTONCELJ, Jasna, DEMŠAR, Lea, HOČEVAR, Ivica, HRIBAR, Janez, JERŠEK, Barbara, MANDIĆ-MULEC, Ines, PAŠ, Maja, POGAČNIK DA SILVA, Lea, ROGELJ, Irena, SKVARČA, Marlena, STOPAR, David, ŠEGATIN, Nataša, VIDRIH, Rajko, ŽLENDER, Božidar, RASPOR, Peter. Razvoj in stanje kateder vključenih v študij živilske tehnologije = Development and conditions of the chairs at food science and technology programme. V: RASPOR, Peter (ur.), HOČEVAR, Ivica (ur.). Živilstvo in prehrana včeraj, danes za jutri : 50 let študija živilske tehnologije : Ljubljana, 29. in 30. september 2011. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2011. Str. 353-396. ISBN 978-961-6333-93-1. [COBISS.SI-ID 2946184]

224. OREHEK, Janez, IRŠIČ BEDENIK, Nataša, ERŽEN, Evgen, STOPAR, David. Spremembe reoloških lastnosti raztopin karboksimetil celuloze (CMC), kot posledica bakterijske razgradnje - fizikalno kemijsko ozadje opaženih pojavov = Rheological properties of carboxymethyl cellulose (CMC) solutions as a result of microbial degradation - physical chemical background of observed phenomenon. V: KRAVANJA, Zdravko (ur.), BRODNJAK-VONČINA, Darinka (ur.), BOGATAJ, Miloš (ur.). Slovenski kemijski dnevi 2011, Portorož, 14-16 september 2011. Maribor: FKKT, 2011. Str. [1-8]. ISBN 978-961-248-289-3. [COBISS.SI-ID 4298104]

225. KLADNIK, Urška. Ugotavljanje citotoksičnosti rdečega barvila bakterije Vibrio sp. za primarne mišje limfocite B : diplomsko delo = Cytotoxicity of red pigment from bacterium Vibrio sp. for primary mouse B lymphocytes : graduation thesis. Ljubljana: [U. Kladnik], 2011. XI, 47 f., ilustr., preglednice. Biotehniška fakulteta, Študij biotehnologije, Diplomska dela, 54. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_kladnik_urska.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 6722937]

226. BORIĆ VEZJAK, Maja, DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Viscosity as a stress factor for Vibrio sp. DSM 14379. V: JANEŽIČ, Sandra (ur.), et al. Abstract book. 9th Congress of the Slovenian Biochemical Society [also] 5th Congress of the Slovenian Microbiological Society with International Participation [also] 3rd CEFORM (Central European Forum for Microbiology), Maribor, 12th - 15th October 2011. Maribor: Zavod za zdravstveno varstvo, 2011. Str. 196, p70. ISBN 978-961-90895-5-2. [COBISS.SI-ID 3952504]

227. HORVAT, Marinka. Vloga krotonil-CoA reduktaze/karboksilaze iz primarnega metabolizma v biosintezi FK506 pri Streptomyces tsukubaensis : diplomsko delo = Role of crotonyl-CoA reductase/carboxylase from primary metabolism in the biosynthesis of FK506 in Streptomyces tsukubaensis : graduation thesis. Ljubljana: [M. Horvat], 2011. XIII, 70 f., [7] f. pril., ilustr., preglednice. Biotehniška fakulteta, Študij biotehnologije, Diplomska dela, 66. [COBISS.SI-ID 6882425]

228. ŠKUFCA, Barbara. Vpliv okolja na stabilnost pigmenta bakterije Vibrio sp. DSM 14379 : diplomsko delo, univerzitetni študij = Influence of environment on the stability of pigment from bacterial strain Vibrio sp. DSM 14379 : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [B. Škufca], 2011. IX, 33 f., [7] f. pril., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 498. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_skufca_barbara.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 4000120]

229. KRAJNC, Marko. Vpliv okoljskih dejavnikov na produkcijo zunajceličnih signalnih molekul pri naravnem izolatu Vibrio sp. : diplomsko delo, univerzitetni študij = Influence of environmental factors on production of extracellular signalling molecules in a natural isolate Vibrio sp. : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [M. Krajnc], 2011. XI, 39 f., [4] f. pril., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 493. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/dn_krajnc_marko.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3946872]

230. BORIĆ VEZJAK, Maja, DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Communication among Vibrio ruber in media with different viscosities : [presented at] Young Microbiologists Symposium on Microbe Signalling, Organisation and Pathogens [also] YMS Cork 2012, 21st and 22nd June 2012, Cork, Ireland. Cork: University College Cork, 2012. [COBISS.SI-ID 4151416]

231. IVANČIČ, Tina, JAMNIK, Polona, STOPAR, David. Fatty acid composition and protein expression during periodic temperature cycling in bacteria E. coli. V: Programme [and] book of abstracts : Second International Conference on Microbial stress from molecules to systems, May 10th to May 13th 2012, Belgirate, (Italy). Second International Conference on Microbial stress from molecules to systems, May 10th to May 13th 2012, Belgirate, Italy. [Barcelona]: European Federation of Biotechnology (EFB); [Delft: Federation of European Microbiology Societies (FEMS), 2012]. Str. 100, poster 15. [COBISS.SI-ID 4100984]

232. IVANČIČ, Tina. Fiziološki odziv bakterije Escherichia coli na periodično spreminjanje temperature : doktorska disertacija = Physiological response of bacteria Escherichia coli to periodic temperature cycling : doctoral dissertation. Ljubljana: [T. Ivančič], 2012. XIII, 81 f., [2] f. pril., ilustr. [COBISS.SI-ID 4111736]

233. DOBLEKAR, Marjana. Sinteza in reološke lastnosti karboksimetil celuloznih tozilatov = Synthesis and rheological properties of carboxymethyl cellulose tosylates : diplomsko delo. Ljubljana: [M. Doblekar], 2012. III, 33 f., ilustr. [COBISS.SI-ID 36048133]

234. BORIĆ VEZJAK, Maja, DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Viscosity dictates metabolic activity of Vibrio ruber. Frontiers in microbiology. July 2012, vol. 3, no. article 255, str. 1-12. ISSN 1664-302X. http://www.frontiersin.org/Microbial_Physiology_and_Metabolism/10.3389/fmicb.2012.00255/full, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.3389/fmicb.2012.00255. [COBISS.SI-ID 4146552]

235. STOPAR, David, RASPOR, Peter. Aktualni študijski programi mikrobiologije = The current study microbiology. V: RASPOR, Peter (ur.), et al. Mikrobiologija za znanje in napredek : 20 let univerzitetnega študija mikrobiologije. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Katedra za biotehnologijo, mikrobiologijo in varnost živil, 2013. Str. 29-40, ilustr. Pomen biotehnologije in mikrobiologije za prihodnost, 11. ISBN 978-961-6908-03-0. [COBISS.SI-ID 4339576]

236. KOŠIR, Gašper, STOPAR, David, KAVKLER, Katja, PODJED, Matevž. Barje - zakladnica arheoloških najdišč : sodelovanje na RTV Slovenija, TV Slovenija 1, 19. 9. 2013. Ljubljana: RTV Slovenija, TV Slovenija, 2013. http://ava.rtvslo.si/predvajaj/barje-zakladnica-arheoloskih-najdisc/ava2.168028797/. [COBISS.SI-ID 4297080]

237. PETEK, Klemen. Biorazgradljivost celuloznih derivatov : magistrsko delo = Biodegradability of cellulose derivates : M. Sc. thesis. Ljubljana: [K. Petek], 2013. XI, 40 f., [3] f. pril., ilustr., preglednice. Biotehniška fakulteta, Študij biotehnologije, Magistrsko delo magistrskega študija - 2. stopnja Biotehnologija, 2. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/biotehnologija/du2_petek_klemen.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 7438457]

238. IVANČIČ, Tina, JAMNIK, Polona, STOPAR, David. Cold shock CspA and CspB protein production during periodic temperature cycling in Escherichia coli. BMC research notes. 2013, vol. 6, article no. 248, str. 1-9. ISSN 1756-0500. http://www.biomedcentral.com/content/pdf/1756-0500-6-248.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1186/1756-0500-6-248. [COBISS.SI-ID 4262776]

239. BORIĆ VEZJAK, Maja, DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Ecophysiology of Vibrio harveyi and Vibrio ruber in viscous media. V: MANDIĆ-MULEC, Ines (ur.). Networking and plasticity of microbial communities : the secret to success ; BAGECO 12. 12th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology, 9-13 June 2013, Ljubljana, Slovenia. Jena: Conventus Congressmanagement & Marketing, 2013. Str. 122, p177. [COBISS.SI-ID 4260472]

240. DOGŠA, Iztok, BRLOŽNIK, Mojca, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. Exopolymer diversity and the role of levan in Bacillus subtilis biofilms. V: MANDIĆ-MULEC, Ines (ur.). Networking and plasticity of microbial communities : the secret to success ; BAGECO 12. 12th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology, 9-13 June 2013, Ljubljana, Slovenia. Jena: Conventus Congressmanagement & Marketing, 2013. Str. 123, p179. [COBISS.SI-ID 4261240]

241. DOGŠA, Iztok, BRLOŽNIK, Mojca, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. Exopolymer diversity and the role of levan in Bacillus subtilis biofilms. PloS one. 2013, vol. 8, iss. 4, str. 1-10, e62044. ISSN 1932-6203. DOI: 10.1371/journal.pone.0062044. [COBISS.SI-ID 4242040]

242. STOPAR, David. Izzivi mikrobiologije = Microbiology - challenges ahead. V: RASPOR, Peter (ur.). Slavnostna akademija ob "20 letnici študija mikrobiologije na Univerzi v Ljubljani" : v tednu univerze v decembru leta 2013 : zbornik predstavitev, Ljubljana, 5. 12. 2013. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Katedra za biotehnologijo, mikrobiologijo in varnost živil, 2013. Str. 43. ISBN 978-961-6908-05-4. [COBISS.SI-ID 4343928]

243. KOROŠEC, Mojca, STOPAR, David, BAŠA, Lidija, TENZE, Goran. Med znanostjo in mediji : oddaja Pogled v znanost : sodelovanje na RTV Slovenija, Radio Slovenija, ARS - 3. program, Ljubljana 28.1.2013 ob 13.05. Ljubljana: Radiotelevizija Slovenija, Radio Slovenija, 2013. http://tvslo.si/#ava2.157094200;;, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 4241016]

244. RASPOR, Peter (glavni urednik), AVGUŠTIN, Gorazd (urednik), MANDIĆ-MULEC, Ines (urednik), MARINŠEK-LOGAR, Romana (urednik), PETROVEC, Miroslav (urednik), SEPČIĆ, Kristina (urednik), STOPAR, David (urednik), STRES, Blaž (urednik), ZALAR, Polona (urednik), ŽGUR-BERTOK, Darja (urednik). Mikrobiologija za znanje in napredek : 20 let univerzitetnega študija mikrobiologije. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Katedra za biotehnologijo, mikrobiologijo in varnost živil, 2013. XX, 752 str., ilustr. Pomen biotehnologije in mikrobiologije za prihodnost, 11. ISBN 978-961-6908-03-0. [COBISS.SI-ID 268457216]

245. STOPAR, David, FAGANELI, Jadran. Mikrobna ekologija = Microbial ecology. V: RASPOR, Peter (ur.), et al. Mikrobiologija za znanje in napredek : 20 let univerzitetnega študija mikrobiologije. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Katedra za biotehnologijo, mikrobiologijo in varnost živil, 2013. Str. 201-220, ilustr. Pomen biotehnologije in mikrobiologije za prihodnost, 11. ISBN 978-961-6908-03-0. [COBISS.SI-ID 4340344]

246. STOPAR, David, DANEVČIČ, Tjaša, KOZJEK, Barbara. Poročilo o monitoringu depozitorija arheološkega mokrega lesa v obdobju od marca do avgusta 2013 : [naročnik] Mestni muzej Ljubljana. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Katedra za mikrobiologijo, 2013. [22] str., ilustr. [COBISS.SI-ID 4294776]

247. STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. Primerjava univerzitetnega študija I. in II. stopnje mikrobiologije = Comparison of academic study microbiology (B. Sc.) and master study (M. Sc.). V: RASPOR, Peter (ur.), et al. Mikrobiologija za znanje in napredek : 20 let univerzitetnega študija mikrobiologije. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Katedra za biotehnologijo, mikrobiologijo in varnost živil, 2013. Str. 73-82, ilustr. Pomen biotehnologije in mikrobiologije za prihodnost, 11. ISBN 978-961-6908-03-0. [COBISS.SI-ID 4340088]

248. DANEVČIČ, Tjaša, BORIĆ VEZJAK, Maja, STARIČ, Nejc, STOPAR, David. Prodigiosin - mechanisms of antimicrobial action. V: MANDIĆ-MULEC, Ines (ur.). Networking and plasticity of microbial communities : the secret to success ; BAGECO 12. 12th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology, 9-13 June 2013, Ljubljana, Slovenia. Jena: Conventus Congressmanagement & Marketing, 2013. Str. 123-124, p180. [COBISS.SI-ID 4260984]

249. BORIĆ VEZJAK, Maja, DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Rheology of liquid media influences bacterial physiology. V: KNIEWALD, Zlatko (ur.). Biotehnologija u Hrvatskoj do 2020. = Biotechnology in Croatia by 2020 : [book of abstracts]. II. međunarodni simpozij "Vera Johanides", Zagreb, 10.-11. svibnja 2013. = The 2nd International Symposium "Vera Johanides", Zagreb, May 10-11, 2013. Zagreb: Croatian Academy of Engineering, 2013. Str. 57-58. ISBN 978-953-7076-21-4. [COBISS.SI-ID 4244344]

250. BENIGAR, Elizabeta, DOGŠA, Iztok, STOPAR, David, JAMNIK, Andrej, TOMŠIČ, Matija. Structural investigation of aqueous systems of nonionic polysaccharide Levan by SAXS, SLS and DLS. V: ECIS 2013. 27th Conference of the European Colloid and Interface Society, 1-6 September 2013, Sofia, Bulgaria. [S. l.: s. n.]. 2013, str. [1]. http://ecis2013.org/media/docs/Polymers_T6_P.pdf. [COBISS.SI-ID 1701167]

251. OREHEK, Janez, DOGŠA, Iztok, TOMŠIČ, Matija, JAMNIK, Andrej, KOČAR, Drago, STOPAR, David. Structural investigation of carboxymethyl cellulose biodeterioration by Bacillus subtilis subsp. subtilis NCIB 3610. International biodeterioration & biodegradation. [Print ed.]. 2013, vol. 77, no. 1, str. 10-17. ISSN 0964-8305. DOI: 10.1016/j.ibiod.2012.10.007. [COBISS.SI-ID 36573957]

252. BENIGAR, Elizabeta, DOGŠA, Iztok, STOPAR, David, JAMNIK, Andrej, TOMŠIČ, Matija. Strukturne raziskave vodnih raztopin polisaharida levana : [predavanje]. V: KRAVANJA, Zdravko (ur.), BRODNJAK-VONČINA, Darinka (ur.), BOGATAJ, Miloš (ur.). Slovenski kemijski dnevi 2013, Maribor, 10.-12. september 2013. Maribor: Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo, 2013. Str. 1-9, ilustr. ISBN 978-961-248-403-3. [COBISS.SI-ID 1627183]

253. OREHEK, Janez. Strukturni opis biorazgradnje gostil na celulozni osnovi : doktorska disertacija = Structural characterization of cellulose thickeners biodegradation : doctoral dissertation. Ljubljana: [J. Orehek], 2013. XII, 100 f., ilustr. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/biotehnologija/dd_orehek_janez.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 4258936]

254. KAVKLER, Katja, DANEVČIČ, Tjaša, TOMAN KRACINA, Katarina, ŠINKOVEC, Irena, STOPAR, David. Submerged wooden cultural heritage depository : a preliminary research of environmental risks on stored objects. V: Programme and abstract book. 2nd International conference on Biodeterioration of wood and wood products, BWWP 2013, Tartu, Estonia, April 24-27, 2013. Riga: Estonian University of Life Sciences: IBBS: FEMS, 2013. Str. 84. [COBISS.SI-ID 512961579]

255. BORIĆ VEZJAK, Maja. Vpliv viskoznosti medija na ekofiziologijo bakterije Vibrio ruber : doktorska disertacija = The effect of viscosity on ecophysiology of Vibrio ruber : doctoral dissertation. Ljubljana: [M. Borić], 2013. XVI, 140, [33] f., ilustr. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/mikrobiologija/dd_boric_maja.pdf, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 4235128]

256. DOGŠA, Iztok, TOMŠIČ, Matija, OREHEK, Janez, BENIGAR, Elizabeta, JAMNIK, Andrej, STOPAR, David. Amorphous supramolecular structure of carboxymethyl cellulose in aqueous solution at different pH values as determined by rheology, small angle X-ray and light scattering. Carbohydrate polymers. [Print ed.]. 2014, vol. 111, str. 492-504. ISSN 0144-8617. DOI: 10.1016/j.carbpol.2014.04.020. [COBISS.SI-ID 4392568]

257. STOPAR, David (intervjuvanec). Bitka z mikrobi. VideoLectures.net : exchange ideas & share knowledge. 12. nov. 2014. http://videolectures.net/znanostnacesti_stopar_mikrobi/?q=bitka. [COBISS.SI-ID 4482168]

258. STOPAR, David (intervjuvanec). Boj z mikrobi - boj z mlini na veter? : oddaja Frekvenca X : sodelovanje na RTV Slovenija, Radio Slovenija, Val 202 ,13. 11. 2014. Ljubljana: RTV Slovenija, Radio Slovenija, 2014. http://4d.rtvslo.si/arhiv/frekvenca-X/174304232, http://val202.rtvslo.si/2014/11/res-ne-bomo-uzili-srece-dokler-ne-bo-premagan-zadnji-mikrob/. [COBISS.SI-ID 4482424]

259. KAVKLER, Katja, STOPAR, David. Conservation of archaeological wooden objects from waterlogged sites. V: HABJANIČ, Oskar (ur.). Uporabna vrednost lesenega kolesa = The practical value of the wooden wheel : the collected volume of the symposium 26. and 27. 9. 2014. Maribor: Pokrajinski muzej: = Regional Museum, 2014. Str. 77-82. Zbirka Museoeurope, 1. ISBN 978-961-93424-2-8. [COBISS.SI-ID 4491640]

260. DANEVČIČ, Tjaša, BORIĆ VEZJAK, Maja, TABOR, Maja, STARIČ, Nejc, STOPAR, David. Ekofiziološka vloga prodigiozina. V: KUŠAR, Darja (ur.), OCEPEK, Matjaž (ur.). Knjiga povzetkov : kongres SMD 2014. 6. kongres Slovenskega mikrobiološkega društva, 24.-26. september 2014, Bled, Slovenija. Ljubljana: Veterinarska fakulteta, 2014. Str. 63, pr-24. ISBN 978-961-6199-67-4. [COBISS.SI-ID 4426104]

261. BIDOVEC, Boštjan. Fiziološki odziv bakterije Escherichia coli v različno viskoznih gojiščih : diplomsko delo, univerzitetni študij = Physiological response of bacterium Escherichia coli in media with different viscosities : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [B. Bidovec], 2014. X, 45, [4] f. pril., graf. prikazi, tabele. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 534. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/mikrobiologija/dn_bidovec_bostjan.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 4391800]

262. ŠVAGELJ, Tomaž, ŠINKOVEC, Irena (intervjuvanec), STOPAR, David (intervjuvanec), KAVKLER, Katja (intervjuvanec). Kako ohraniti mokro arheološko dediščino : podvodni depozitorij za testne vzorce mokrega lesa z različnih lokacij. Delo. [Tiskana izd.]. 2014, letn. 56, št. 78, str. 13. ISSN 0350-7521. [COBISS.SI-ID 4380024]

263. STOPAR, David. Microbial ecology : visiting lecturer on Kazakh National Agrarian University, Almaty, Kazakhstan, from 6th September till 21st September, 2014. [COBISS.SI-ID 4423288]

264. DANEVČIČ, Tjaša, BORIĆ VEZJAK, Maja, STOPAR, David. Microbial ecophysiology of Vibrio ruber. Food technology and biotechnology : journal of the Faculty of Food Technology and Biotechnology University of Zagreb. 2014, vol. 52, no. 2, str. 198-203. ISSN 1330-9862. [COBISS.SI-ID 4367736]

265. STOPAR, David, DOGŠA, Iztok, TOMŠIČ, Matija, BENIGAR, Elizabeta, STOJKOVIĆ, Biljana, SRETENOVIĆ, Simon, JAMNIK, Andrej, POBERAJ, Igor. Nanostructure of extracellular space in biofilms. V: Biofilms 6 : welcome and general information, information for presenter, social events, program overview. International Conference on Microbial Biofilms, 11-13 May 2014, Vienna, Austria. Vienna: University of Vienna, 2014. Str. 3-4. [COBISS.SI-ID 4388984]

266. STOPAR, David. Nanostruktura zunajceličnih polimernih matriksov v mikrobnih biofilmih. V: KUŠAR, Darja (ur.), OCEPEK, Matjaž (ur.). Knjiga povzetkov : kongres SMD 2014. 6. kongres Slovenskega mikrobiološkega društva, 24.-26. september 2014, Bled, Slovenija. Ljubljana: Veterinarska fakulteta, 2014. Str. 34, vpr-06. ISBN 978-961-6199-67-4. [COBISS.SI-ID 4424312]

267. OREHEK, Janez, PETEK, Klemen, DOGŠA, Iztok, STOPAR, David. New carboxymethyl cellulose tosylate with low biodeterioration. Carbohydrate polymers. [Print ed.]. 2014, vol. 113, str. 16-21. ISSN 0144-8617. DOI: 10.1016/j.carbpol.2014.06.016. [COBISS.SI-ID 4397688]

268. KAVKLER, Katja (avtor razstave, fotograf, ilustrator), STOPAR, David (avtor razstave, ilustrator), ŠINKOVEC, Irena (avtor razstave, fotograf), TOMAN KRACINA, Katarina (avtor razstave, ilustrator), DANEVČIČ, Tjaša, KOZJEK, Barbara. Ohranjanje lesa iz mokrih okolij : spremljevalna razstava ob razstavi Kolo, 5200 let = Wheel, 5200 years, Ljubljana, Muzeji in galerije mesta Ljubljana, Mestni muzej Ljubljana, 12. februar - 2. marec 2014. [COBISS.SI-ID 4363640]

269. KAVKLER, Katja (avtor razstave), STOPAR, David (avtor razstave), ŠINKOVEC, Irena (avtor razstave), TOMAN KRACINA, Katarina (avtor razstave), DANEVČIČ, Tjaša, KOZJEK, Barbara. Ohranjanje lesa iz mokrih okolij : spremljevalna razstava ob razstavi Kolo, 5200 let : pregledna razstava v avli Biološkega središča, Oddelka za biologijo Biotehniške fakultete Univerze v Ljubljani od 7. 4. 2014 do 9. 10. 2014. [COBISS.SI-ID 4449144]

270. LORENZETTI, Martina, TRINKAUS, Katja, DOGŠA, Iztok, STOPAR, David, NOVAK, Saša, KOBE, Spomenka, et al. On the biocompatibility of UV pre-irradiated hydrothermally grown ▫$TiO_2$▫ - coating. V: Final programme. 26th Annual Conference [of] European Society for Biomaterials, 31st August - 3rd September 2014, Liverpool. [S. l.: s. n.], 2014. Str. p99. http://esb2014.org/full_programme.pdf. [COBISS.SI-ID 27912999]

271. STOPAR, David, KAVKLER, Katja. Preventivno varovanje in konservacija predmetov iz mokrega lesa : naravoslovne raziskave - moker les : ohranjanje lesenih predmetov : predavanje v okviru razstave Kolo - 5200 let = Wheel - 5200 years, Mestni muzej Ljubljana, 13. februar 2014. [COBISS.SI-ID 4363384]

272. BORIĆ VEZJAK, Maja, DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Rheology of liquid media influences bacterial physiology. V: KNIEWALD, Zlatko (ur.). [Biotechnology in Croatia by 2020]. The 2nd International Symposium "Vera Johanides", Zagreb, May 10-11, 2013. Zagreb: Croatian Academy of Engineering, 2014. Str. 265-266. Annual ... of the Croatian Academy of Engineering, 2013. ISSN 1332-3482. [COBISS.SI-ID 4433528]

273. BENIGAR, Elizabeta, DOGŠA, Iztok, STOPAR, David, JAMNIK, Andrej, KRALJ CIGIĆ, Irena, TOMŠIČ, Matija. Structure and dynamics of a polysaccharide matrix : aqueous solutions of bacterial levan. Langmuir. 2014, vol. 30, issue 14, str. 4172-4182. ISSN 0743-7463. DOI: 10.1021/la500830j. [COBISS.SI-ID 4381304]

274. DOGŠA, Iztok, BRLOŽNIK, Mojca, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. Vloga levana pri formiranju in stabiliziranju plavajočih biofilmov Bacillus subtilis. V: KUŠAR, Darja (ur.), OCEPEK, Matjaž (ur.). Knjiga povzetkov : kongres SMD 2014. 6. kongres Slovenskega mikrobiološkega društva, 24.-26. september 2014, Bled, Slovenija. Ljubljana: Veterinarska fakulteta, 2014. Str. 131, po-52. ISBN 978-961-6199-67-4. [COBISS.SI-ID 4425592]

275. GASPARI, Andrej (intervjuvanec), DRAKSLER, Matej (intervjuvanec), BADOVINAC, David (intervjuvanec), STOPAR, David (intervjuvanec). 2000 let star deblak iz Ljubljanice je izjemna arheološka najdba, saj sodi med tri največje v Evropi : prispevek v oddaji Slovenski magazin = Slovenian Magazine, TV Slovenija, 1. program, 30. 11. 2015. [COBISS.SI-ID 4620664]

276. STOPAR, David (intervjuvanec), DANEVČIČ, Tjaša (intervjuvanec), ROGELJ, Irena (intervjuvanec), AVGUŠTIN, Gorazd (intervjuvanec), RUPNIK, Maja (intervjuvanec), DACINGER, Renata (oseba, ki intervjuva, urednik). Ali bi lahko živeli brez mikroorganizmov? : oddaja Ugriznimo znanost, TV SLO 1, 19. mar. 2015. Ljubljana: RTV Slovenija, 2015. http://4d.rtvslo.si/arhiv/ugriznimo-znanost/174325937. [COBISS.SI-ID 4620920]

277. STOPAR, David. Biofilmi v okolju : predavanje za študente 1. stopnje študijskih programov Biologija in Ekologija z naravovarstvom na Fakulteti za naravoslovje in matematiko Univerze v Mariboru, 10. 12. 2015. [COBISS.SI-ID 4617848]

278. BENIGAR, Elizabeta, TOMŠIČ, Matija, SRETENOVIĆ, Simon, STOPAR, David, JAMNIK, Andrej, DOGŠA, Iztok. Evaluating SAXS results on aqueous solutions of various bacterial levan utilizing the string-of-beads model. Acta chimica slovenica. [Tiskana izd.]. 2015, vol. 62, no. 3, str. 509-517. ISSN 1318-0207. https://journals.matheo.si/index.php/ACSi/article/view/1437/671, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si, DOI: 10.17344/acsi.2015.1437. [COBISS.SI-ID 4564088]

279. STOPAR, David. Gradual transition into a floating biofilm : Elektronski vir. V: Eurobiofilms 2015 : abstract book. Fourth European Congress on Microbial Biofilms - Basic and clinical aspects, Brno, Czech Republic, 23-26 June, 2015. [Basel]: European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID), 2015. Str. 29, s08.1. [COBISS.SI-ID 4551288]

280. STOPAR, David, CIGIĆ, Blaž. Hidrokoloidi = Hydrocolloids. V: KOROŠEC, Mojca (ur.), DEMŠAR, Lea (ur.), POLAK, Tomaž (ur.). Hrana, prehrana in mediji = Food, nutrition and media. 28. Bitenčevi živilski dnevi 2015, Ljubljana, 17. junij 2015. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2015. Str. 39-55. ISBN 978-961-6908-07-8. [COBISS.SI-ID 4554360]

281. LORENZETTI, Martina, DOGŠA, Iztok, STOPAR, David, LIPS, Katrin Susanne, SCHNETTLER, Reinhard, KALIN, Mitjan, KOBE, Spomenka, NOVAK, Saša. Hydrothermally-treated nano-crystalline ▫$TiO_2$▫ coatings boost the "race for the surface" towards osteogenesis rather than bacterial adhesion. V: Final programme and book of abstracts. 27th Annual Conference [of] European Society for Biomaterials, ESB 2015, 30 August - 3 September, Kraków, Poland 210% a[S. l. cs. n.] d2015. Kraków: Polish Society for Biomaterials, 2015. ISBN 978-83-63663-63-6. [COBISS.SI-ID 28832807]

282. LORENZETTI, Martina, DOGŠA, Iztok, STOŠICKI, Tjaša, STOPAR, David, KALIN, Mitjan, KOBE, Spomenka, NOVAK, Saša. The influence of surface modification on bacterial adhesion to titanium-based substrates. ACS applied materials & interfaces. 2015, vol. 7, str. 1644-1651, ilustr. ISSN 1944-8244. DOI: 10.1021/am507148n. [COBISS.SI-ID 4496504]

283. KOZJEK, Barbara. Mikrobiološka razgradnja arheološkega mokrega lesa : magistrsko delo = Microbiological decay of waterlogged archaeological wood : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [B. Kozjek], 2015. XIV, 69 f., [19] f. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 39. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/mikrobiologija/du2_kozjek_barbara.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 4541304]

284. SNOJ, Luka (intervjuvanec), STOPAR, David (intervjuvanec), RAVNJAK, Blanka (intervjuvanec), BAVCON, Jože (intervjuvanec), SMODIŠ, Borut (intervjuvanec), CINDRO, Vladimir (intervjuvanec), HITI, Bojan (intervjuvanec), BIZJAK, Srečko, JAZBEC, Anže (intervjuvanec), KUZMAN, Uroš (intervjuvanec), DACINGER, Renata (oseba, ki intervjuva, urednik). Odporni proti sevanju : Ugriznimo znanost, TV SLO1, 17. 12. 2015. Ljubljana: RTV Slovenija, 2015. http://4d.rtvslo.si/arhiv/ugriznimo-znanost/174377696. [COBISS.SI-ID 29170727]

285. STRMLJAN, Tina. Opis razgradnje karboksimetil celuloze z bakterijami Cellulomonas uda in Bacillus subtilis : diplomsko delo, univerzitetni študij = The description of degradation of carboxymethyl cellulose by bacteria Cellulomonas uda and Bacillus subtilis : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [T. Strmljan], 2015. X, 45 f., [2] f. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 540. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/mikrobiologija/dn_strmljan_tina.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 4553080]

286. CERAR, Ana. Optimizacija gojenja mikroalg v iztoku iz bioplinske naprave za proizvodnjo bioplina : magistrsko delo = Optimization of microalgal cultivation in biogas plant effluent for biogas production : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [A. Cerar], 2015. XV, 77 f., [18] f. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 36. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/mikrobiologija/du2_cerar_ana.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 4522872]

287. MIHELIČ, Miha. Pomen pršenja slapov pri razširjanju bakterij : diplomsko delo : univerzitetni študij = Dispersal of microorganisms with the help of waterfalls : graduation thesis : university studies. Ljubljana: [M. Mihelič], 2015. XII, 66 f., [1] f. pril., ilustr. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/biologija/dn_mihelic_miha.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 3312463]

288. STOPAR, David, DANEVČIČ, Tjaša. Poročilo o monitoringu depozitorija arheološkega mokrega lesa v obdobju od aprila 2014 do aprila 2015 : [naročnik] Mestni muzej Ljubljana. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Katedra za mikrobiologijo, 2015. [17] str., ilustr. [COBISS.SI-ID 4619384]

289. TESOVNIK, Tanja. Preučevanje difuzijskih lastnosti biofilmov pri bakteriji Bacillus subtilis : magistrsko delo = Study of diffusion properties of Bacillus subtilis biofilms : M. Sc. thesis. Ljubljana: [T. Tesovnik], 2015. X, 40 f., ilustr. Biotehniška fakulteta, Študij biotehnologije, Magistrsko delo magistrskega študija - 2. stopnja Biotehnologija, 44. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 8234105]

290. BENIGAR, Elizabeta. Strukturne raziskave osnovnega matriksa biofilma bakterije Bacillus subtilis z metodami sipanja svetlobe : doktorska disertacija. Ljubljana: [E. Benigar], 2015. 148 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 1536298435]

291. BENIGAR, Elizabeta, DOGŠA, Iztok, KRALJ CIGIĆ, Irena, ZUPANČIČ-VALANT, Andreja, SRETENOVIĆ, Simon, STOPAR, David, JAMNIK, Andrej, TOMŠIČ, Matija. Strukturne raziskave vodnih raztopin komponent biofilma bakterije Bacillus subtilis. V: KLJUN, Jakob (ur.), KLEMENČIČ, Marina (ur.). Kemijske znanosti 2015 : zbornik povzetkov. Ljubljana: Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo, 2015. Str. 21-22, ilustr. ISBN 978-961-6756-51-8. [COBISS.SI-ID 1536213699]

292. DANEVČIČ, Tjaša, KAVKLER, Katja, DRAKSLER, Matej, BADOVINAC, David, ŠINKOVEC, Irena, STOPAR, David. Submerging the archeological waterlogged wood?. V: OGRINC, Nives (ur.), POTOČNIK, Doris (ur.), FAGANELI, Jadran (ur.). Dynamics of Biogeochemical Systems : processes and modeling : conference program and abstracts. [Ljubljana]: National Institute of Biology: Jožef Stefan Institute, [2015]. Str. 73. [COBISS.SI-ID 4616824]

293. STOJKOVIĆ, Biljana, SRETENOVIĆ, Simon, DOGŠA, Iztok, POBERAJ, Igor, STOPAR, David. Viscoelastic properties of levan-DNA mixtures Important in microbial biofilm formation as determined by micro- and macrorheology. Biophysical journal. 2015, vol. 108, iss. 3, str. 758-765. ISSN 0006-3495. DOI: 10.1016/j.bpj.2014.10.072. [COBISS.SI-ID 4506744]

294. STOPAR, David. Visiting lecturer at the Kazakh National Agrarian University, Almaty, Kazakhstan, from 15th November till 29th November, 2015. [COBISS.SI-ID 4595320]

295. SRETENOVIĆ, Simon. Vloga levana pri strukturiranju bakterijskih biofilmov : magistrsko delo : [Prešernova nagrada Univerze v Ljubljani za leto 2015] = The role of levan in structuring bacterial biofilms : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [S. Sretenović], 2015. XII, 62 f., [7] f. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 45. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/mikrobiologija/du2_sretenovic_simon.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 4559736]

296. STOPAR, David. Biofilmi. V: BAVEC, Aljoša (ur.), et al. BIOmolekularec.si : Dan biomolekularnih znanosti : zbornik povzetkov : Ljubljana, 22. september 2016. BIOmolekularec.si [tudi] Dan biomolekularnih znanosti, Ljubljana, 22. september 2016. Ljubljana: Slovensko biokemijsko društvo, 2016. Str. 33. ISBN 978-961-93879-2-4. http://biomolekularec.si/zbornik16.pdf. [COBISS.SI-ID 4693368]

297. STOPAR, David. Biofilms : from molecular anatomy to supramolecular systems : Radboud University, Radboud Summer School, Nijmegen, 1-5 August 2016. [COBISS.SI-ID 4696696]

298. STOPAR, David. Biofilms : on a liquid to gel transition : lecture at the DSV Seminars 2016, Phd Program in Molecular Biomedicine, 15 January 2016, Trieste, Università degli Studi di Trieste, Dipartimento di Scienze della Vita. [COBISS.SI-ID 4622712]

299. STOPAR, David, IVANČIČ, Tina. Cold shock CspA protein production during periodic temperature cycling in Escherichia coli. V: BRUIJN, Frans J. de (ur.). Stress and environmental regulation of gene expression and adaptation in bacteria. Hoboken: J. Wiley & Sons, cop. 2016. Str. 854-858, ilustr. ISBN 978-1-119-00488-2, ISBN 1-119-00488-8. [COBISS.SI-ID 4706424]

300. DOGŠA, Iztok, SRETENOVIĆ, Simon, BENIGAR, Elizabeta, TOMŠIČ, Matija, STOJKOVIĆ, Biljana, MANDIĆ-MULEC, Ines, KOSTANJŠEK, Rok, POBERAJ, Igor, STOPAR, David. Hardening of Bacillus subtilis soft mater during biofilm formation. V: MELO, Luís (ur.). Biofilms7 : microbial works of art : [book of abstracts] : [international meeting, 26-28 June 2016, Porto, Portugal]. Braga: Universidade do Minho, Departamento de Engenharia Biológica, 2016. Str. 63, s08: 8. ISBN 978-989-97478-7-6. [COBISS.SI-ID 4748408]

301. BENIGAR, Elizabeta, ZUPANČIČ-VALANT, Andreja, DOGŠA, Iztok, SRETENOVIĆ, Simon, STOPAR, David, JAMNIK, Andrej, TOMŠIČ, Matija. Investigating structural and dynamic roles of polymers in model Levan-based biofilm mixtures. V: ROVIGATTI, Lorenzo (ur.). Book of abstracts. 30th Conference of the European Colloid and Interface Society, September 4-9, Rome, 2016. [S. l.: s. n.], 2016. Str. 345, ilustr. [COBISS.SI-ID 1537349827]

302. STOPAR, David (intervjuvanec), DOGŠA, Iztok (intervjuvanec), HRIBAR, Janez (intervjuvanec), VIDRIH, Rajko (intervjuvanec), PEČJAK, Silvester (intervjuvanec), DACINGER, Renata (oseba, ki intervjuva, urednik). Kako podaljšati rok trajanja hrane : Ugriznimo znanost, TV SLO1, 28. apr. 2016. Ljubljana: RTV Slovenija, 2016. http://4d.rtvslo.si/arhiv/ugriznimo-znanost/174402392. [COBISS.SI-ID 4696184]

303. STOJKOVIĆ, Biljana, SRETENOVIĆ, Simon, DOGŠA, Iztok, POBERAJ, Igor, STOPAR, David. Micro and macro-rheology study of DNA-levan mixtures. V: MARION, Sanjin (ur.). Book of abstracts : ABC of physics of life. 13th International School of Biophysics, Adriatic Coast, Croatia, September 1-10, 2016. Zagreb: Croatian Biophysical Society & Institute of Physics, 2016. Str. 144. ISBN 978-953-7666-14-9. [COBISS.SI-ID 32842457]

304. SKODLAR, Janko, ŠINKOVEC, Irena, STOPAR, David, GASPARI, Andrej, GAŠPARIČ, Damijan. Moja Ljubljanica : novinarska konferenca pred odprtjem stalne razstave Moja Ljubljanica, ki je rezultat širšega projekta Doživljajsko razstavišče Ljubljanica, Vrhnika, 13. september 2016, [v organizaciji Občine Vrhnika in Službe vlade Republike Slovenije za razvoj in evropsko kohezijsko politiko]. [COBISS.SI-ID 4695928]

305. ŠARC, Andrej. Odstranjevanje bakterije Legionella pneumophila s pomočjo hidrodinamske kavitacije : doktorsko delo. Ljubljana: [A. Šarc], 2016. XXVIII, 117 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 15113243]

306. STOPAR, David. Podvodni depozitorij arheološkega mokrega lesa : [vabljeno predavanje na]: Okrogli mizi - Ohranjanje arheoloških najdišč v barjih in mokriščih (primer Ljubljanskega barja), Ljubljana, Krajinski park Ljubljansko Barje, 27. 9. 2016. [COBISS.SI-ID 4692600]

307. DANEVČIČ, Tjaša, BORIĆ VEZJAK, Maja, ZOREC, Maša, STOPAR, David. Prodigiosin - a multifaceted Escherichia coli antimicrobial agent. PloS one. 2016, vol. 11, iss. 9, str. 1-13, e0162412, ilustr. ISSN 1932-6203. DOI: 10.1371/journal.pone.0162412. [COBISS.SI-ID 4693880]

308. DANEVČIČ, Tjaša, BORIĆ VEZJAK, Maja, TABOR, Maja, ZOREC, Maša, STOPAR, David. Prodigiosin induces autolysins in actively grown Bacillus subtilis cells. Frontiers in microbiology. Jan. 2016, vol. 7, article 27, str. 1-10, ilustr. ISSN 1664-302X. DOI: 10.3389/fmicb.2016.00027. [COBISS.SI-ID 4619128]

309. BENIGAR, Elizabeta, ZUPANČIČ-VALANT, Andreja, DOGŠA, Iztok, SRETENOVIĆ, Simon, STOPAR, David, JAMNIK, Andrej, TOMŠIČ, Matija. Structure and dynamics of a model polymer mixture mimicking a levan-based bacterial biofilm of Bacillus subtilis. Langmuir. 2016, vol. 32, iss. 32, str. 8182-8194, ilustr. ISSN 0743-7463. http://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.langmuir.6b02041, DOI: 10.1021/acs.langmuir.6b02041. [COBISS.SI-ID 1537177283]

310. ZADEL, Urška. Struktura mikrobne združbe in mineralizacija modelne organske snovi po remediaciji s kovinami onesnaženih tal : magistrsko delo = Microbial community structure and model organic matter mineralization after remediation of metal contaminated soil : M. Sc. thesis. Ljubljana: [U. Zadel], 2016. XII, 69 f., [3] f. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Oddelek za agronomijo, Magistrsko delo magistrskega študija - 2. stopnja Biotehnologija, 73. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/biotehnologija/du2_zadel_urska.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 8581753]

311. STOJKOVIĆ, Biljana, SRETENOVIĆ, Simon, TEUBLE, Birgit, DOGŠA, Iztok, ZEMLJIČ JOKHADAR, Špela, POBERAJ, Igor, STOPAR, David, ROBBELG, Eva. Study of viscoelastic properties of different biological systems with optical tweezers. V: MARION, Sanjin (ur.). Book of abstracts : ABC of physics of life. 13th International School of Biophysics, Adriatic Coast, Croatia, September 1-10, 2016. Zagreb: Croatian Biophysical Society & Institute of Physics, 2016. Str. 143. ISBN 978-953-7666-14-9. [COBISS.SI-ID 32842201]

312. LORENZETTI, Martina, STOPAR, David, NOVAK, Saša. Titania surface layer can prevent adhesion of bacteria to titanium implants. V: WILLERT-PORADA, Monika (ur.). ISFGMs 2016, 14th International Symposium Functional Graded Materials, Multiscale & Multifunctional Structures, September 18-22 2016, Bayreuth, Germany : proceedings. Bayreuth: University of Bayreuth, 2016. Str. 46. ISBN 978-3-9814164-3-5. [COBISS.SI-ID 29778727]

313. KOŽELJ, Špela. Validacija metode za določevanje koliformnih bakterij in vpliv površine na njihovo adhezijo : magistrsko delo = Validation of method for detection of coliform bacteria and the influence of surface on their adhesion : M. Sc. thesis. Ljubljana: [Š. Koželj], 2016. XI, 53 f., [10] f. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Študij biotehnologije, Magistrsko delo magistrskega študija - 2. stopnja Biotehnologija, 53. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/biotehnologija/du2_kozelj_spela.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 8372857]

314. PETROVIČ, Nejc. Vloga prolina pri pigmentaciji bakterije Vibrio ruber DSM 14379 : diplomsko delo, univerzitetni študij = The role of proline in Vibrio ruber DSM 14379 pigmentation : graduation thesis, university studies. Ljubljana: [N. Petrovič], 2016. IX, 36 f., [4] f. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Enota medoddelčnega študija mikrobiologije, Ljubljana, Diplomske naloge, 545. http://www.digitalna-knjiznica.bf.uni-lj.si/mikrobiologija/dn_petrovic_nejc.pdf, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 4676984]

315. TURK, Filip. Vpliv tokovnih razmer na obstojnost biofilmov : diplomska naloga univerzitetnega študija. Ljubljana: [F. Turk], 2016. XXII, 55 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 14922011]

316. STOPAR, David, DANEVČIČ, Tjaša. Zaključno poročilo o spremljanju fizikalno-kemijskih in mikrobioloških parametrov depozitorija arheološkega mokrega lesa v ribniku na Verdu pri Vrhniki med marcem 2013 in avgustom 2016. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Katedra za mikrobiologijo, 2016. 40 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 4712568]

317. MAHNE OPATIĆ, Anja, NEČEMER, Marijan, LOJEN, Sonja, MASTEN RUTAR, Jasmina, ZLATIĆ, Emil, ŠIRCELJ, Helena, STOPAR, David, VIDRIH, Rajko. A preliminary traceability model for tomato using analysis of stable isotopes, elementsl content and chemical markers. V: Book of abstracts : 5th MS Food day, October 11-13, 2017, Bologna. 5th MS Food day, October 11-13, 2017, Bologna. Bologna: Societa Chimica Italiana, 2017. . [COBISS.SI-ID 31091751]

318. BAŠ, Sara, KRAMER, Mateja, STOPAR, David. Biofilm surface density determines biocide effectiveness. Frontiers in microbiology. 2017, vol. 8, str. 1-9. ISSN 1664-302X. DiRROS - Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije, DOI: 10.3389/fmicb.2017.02443. [COBISS.SI-ID 1388638]

319. STOPAR, David. Biofilms : from molecular anatomy to supramolecular systems : Radboud University, Radboud Summer School, Nijmegen, 14 August - 18 August, 2017. [COBISS.SI-ID 4865144]

320. DOGŠA, Iztok, SRETENOVIĆ, Simon, STOJKOVIĆ, Biljana, KOSTANJŠEK, Rok, POBERAJ, Igor, STOPAR, David. Cell-cell interconnections in dilute bacterial suspension of Bacillus subtilis. V: Abstract book. 19th International Conference on Bacilli & Gram-Positive Bacteria, 11-15 June 2017, Berlin, Germany. Berlin: [s. n.], 2017. Str. 265, p 178. http://www.bacillus-2017.de/index.php?eID=tx_nawsecuredl&u=0&g=0&t=901498030884&hash=d71b98d873d86117e4e0cc43f25765ef39b3bb18&file=fileadmin/congress/media/gpc2017/druckelemente/GPC_Abstractbook.pdf. [COBISS.SI-ID 4815480]

321. TINTA, Tinkara, TURK, Valentina, KOS KRAMAR, Maja, TRAMŠEK, Kaja, STOPAR, David. Culture collection of dominant colony forming bacteria from coastal marine ecosystem (the Gulf of Trieste, northern Adriatic Sea) and their biotechnological potential. V: ORLIĆ, Sandi (ur.). Symposium on Aquatic Microbial Ecology - SAME 15 - Book of abstracts. The 12th Symposium on Aquatic Microbial Ecology - SAME 15, Zagreb, 03.09. - 08.09. 2017. Zagreb: SAME secretariat IRB - Rudjer Bošković Institute, 2017. Str. 126-127. [COBISS.SI-ID 4434255]

322. SRETENOVIĆ, Simon, STOJKOVIĆ, Biljana, DOGŠA, Iztok, KOSTANJŠEK, Rok, POBERAJ, Igor, STOPAR, David. An early mechanical coupling of planktonic bacteria in dilute suspensions. Nature communications. Aug. 2017, vol. 8, str. 1-10, ilustr. ISSN 2041-1723. https://www.nature.com/articles/s41467-017-00295-z, DOI: 10.1038/s41467-017-00295-z. [COBISS.SI-ID 33363673]

323. BAČNIK, Katarina. Infektivnost virusa zelene lisavosti in mozaika kumar ter virusa blage lisavosti paprike v vodnih vzorcih vtoka v čistilno napravo Domžale-Kamnik : magistrsko delo = Infectivity of cucumber green mottle mosaic virus and pepper mild mottle virus in wastewater treatment plant Domžale-Kamnik : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [K. Bačnik], 2017. XI, 52 f., [7] f. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 96. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 4818808]

324. SRETENOVIĆ, Simon, STOJKOVIĆ, Biljana, DOGŠA, Iztok, KOSTANJŠEK, Rok, POBERAJ, Igor, STOPAR, David, LEVNAJIĆ, Zoran (urednik). Medcelična povezanost med bakterijami. Metina lista : spletna postaja za osebe širokih pogledov in aktivnega duha. 29. 9. 2017. ISSN 2536-3425. https://metinalista.si/top-objave-september-2017/. [COBISS.SI-ID 4860792]

325. DOGŠA, Iztok, SRETENOVIĆ, Simon, STOJKOVIĆ, Biljana, KOSTANJŠEK, Rok, POBERAJ, Igor, STOPAR, David. Mehanske medcelične povezave v razredčenih bakterijskih kulturah. V: VODOVNIK, Maša (ur.), KUŠAR, Darja (ur.), MARINŠEK-LOGAR, Romana (ur.). Knjiga povzetkov. 7. kongres Slovenskega mikrobiološkega društva, 20.-22. september 2017, Bled, Slovenija. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 2017. Str. 58, pr13. ISBN 978-961-90346-6-8. [COBISS.SI-ID 4825208]

326. CESAR, Tjaša, DANEVČIČ, Tjaša, KAVKLER, Katja, STOPAR, David. Melamine polymerization in organic solutions and waterlogged archaeological wood studied by FTIR spectroscopy. Journal of cultural heritage. 2017, vol. 23, str. 106-110, ilustr. ISSN 1296-2074. DOI: 10.1016/j.culher.2016.09.009. [COBISS.SI-ID 4703096]

327. STOPAR, David (intervjuvanec), BRECELJ, Marija (urednik). O mehanskih povezavah bakterij v suspenzijah : oddaja Hevreka, RAI Furlanija Julijska krajina, 27. 11. 2017, od 18.00 do 18.30. http://www.rai.it/dl/portali/site/articolo/ContentItem-99a019aa-ca1e-4865-b5e0-bc047ac1bab4.html#. [COBISS.SI-ID 4861560]

328. ROGELJ-PETRIČ, Silvestra. Odkritje mehanskih povezav med bakterijami : dosežek slovenskih raziskovalcev: nov pogled na sodelovanje in sporazumevanje med bakterijami ter njihov vpliv na okolje. Delo.si. [Spletna izd.]. 3. nov. 2017, ilustr. ISSN 1854-6544. http://www.delo.si/znanje/znanost/odkritje-mehanskih-povezav-med-bakterijami.html. [COBISS.SI-ID 4863608]

329. JURŠIČ, Nina. Opis reoloških lastnosti rabljenega gojišča mutante Bacillus subtilis PS 216 : magistrsko delo = Rheological characterisation of mutant bacterium Bacillus subtilis PS 216 spent medium : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [N. Juršič], 2017. XII, 47 f., [4] f pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 94. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 4819576]

330. SRETENOVIĆ, Simon, STOJKOVIĆ, Biljana, DOGŠA, Iztok, KOSTANJŠEK, Rok, POBERAJ, Igor, STOPAR, David. Prelomno odkritje o mehanskih povezavah planktonskih bakterij v redkih suspenzijah. V: KRAJNC, Matjaž (ur.). Najodličnejši raziskovalni dosežki Univerze v Ljubljani v letu 2017. V Ljubljani: Univerza, 2017. Str. 6, ilustr. https://www.uni-lj.si/mma/Knjizica%20raziskovalnih%20dosezkov%20UL%202017/2017120413185209/. [COBISS.SI-ID 4872056]

331. TOVORNIK, Natalija. Preučevanje reverzibilne vezave bakteriofagov na bakterije : magistrsko delo = Study of bacteriophage reversible binding on bacteria : M. Sc. thesis. Ljubljana: [N. Tovornik], 2017. XII, 50 f., [14] f. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Študij biotehnologije, Magistrsko delo magistrskega študija - 2. stopnja Biotehnologija, 100. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 8760441]

332. STOPAR, David. Prof. dr. France Megušar : (1931-2017). Loški razgledi. 2017, 64, str. 365-367, ilustr. ISSN 0459-8210. Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 5019512]

333. TABOR, Maja. Protimikrobno delovanje prodigiozina na bakterije iz rodu Bacillus : magistrsko delo = Antibacterial action of prodigiosin on Bacillus genus : M. Sc. thesis. Ljubljana: [M. Tabor], 2017. XI, 44 f., [17] f. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Študij biotehnologije, Magistrsko delo magistrskega študija - 2. stopnja Biotehnologija, 103. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 8760185]

334. MASTEN, Aljoša. Slovenski raziskovalci odkrili mrežo, ki bi lahko povezala praživljenje : odkritje na Biotehniški fakulteti v Ljubljani. MMC RTV SLO : prvi multimedijski portal. 28. okt. 2017. ISSN 1581-372X. http://www.rtvslo.si/znanost-in-tehnologija/slovenski-raziskovalci-odkrili-mrezo-ki-bi-lahko-povezala-prazivljenje/436376#comments. [COBISS.SI-ID 4863864]

335. ROBNIK LEVART, Monika. Vpliv faze rasti bakterijske kulture na pritrjevanje ter vpliv laminarnega toka tekočine na odstranjevanje pritrjenih bakterij : magistrsko delo = Impact of growth phase of the bacterial culture on bacterial adhesion and influence of laminar flow on bacterial detachment : master's degree thesis. Ljubljana: [M. Robnik], 2017. 42 str., [2] str. pril., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 5364075]

336. BAŠ, Sara, KRAMER, Mateja, STOPAR, David. Vpliv pokritosti površine z biofilmi na učinkovitost delovanja protimikrobnih sredstev. V: VODOVNIK, Maša (ur.), KUŠAR, Darja (ur.), MARINŠEK-LOGAR, Romana (ur.). Knjiga povzetkov. 7. kongres Slovenskega mikrobiološkega društva, 20.-22. september 2017, Bled, Slovenija. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 2017. Str. 62, pr17. ISBN 978-961-90346-6-8. [COBISS.SI-ID 4827000]

337. BAŠ, Sara. Vpliv strukture biofilma na delovanje protimikrobnih sredstev : magistrsko delo = Effect of biofilm structure on effectivness of antimicrobials : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [S. Baš], 2017. X, 46 f., [6] f. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 99. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 4822136]

338. ALIČ, Špela. Bacterial soft rot disease caused by new Dickeya species and its bacteriophage biocontrol possibilities : doctoral dissertation = Bakterijska bolezen mehkih gnilob, ki jo povzroča nova vrsta rodu Dickeya in možnost biološkega nadzora bolezni z bakteriofagi : doktorska disertacija. Ljubljana: [Š. Alič], 2018. XXII, 93 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 4692303]
nagrada: Špela Alič je za nalogo prejela veliko Krkino nagrado

339. STOPAR, David. Biodegradation of natural and synthetic polymers : 8 hours of lectures presented for Erasmus+ Staff Teaching Mobility at the Institut supérieur d'agriculture de Lille, Lille, France, 21. 11. - 23. 11. 2018. [COBISS.SI-ID 5020024]

340. STOPAR, David. Brez mikroba me ni : predavanje na TEDx, Ljubljana, 9. 12. 2018. https://www.youtube.com/watch?v=NhYtZOH4Kh0. [COBISS.SI-ID 5020792]

341. DOGŠA, Iztok, SRETENOVIĆ, Simon, JERŠINOVIČ, Nataša, STOJKOVIĆ, Biljana, KOSTANJŠEK, Rok, POBERAJ, Igor, MANDIĆ-MULEC, Ines, STOPAR, David. Cell lysis prompts an early mechanical coupling and biofilm formation in dilute bacterial suspensions. V: Biofilms 8 : programme & abstracts. Biofilms International Conference, 27-29 May 2018, Aarhus, Denmark. Aarhus: Aarhus University, 2018. Str. 29, o12. [COBISS.SI-ID 4973944]

342. MAHNE OPATIĆ, Anja, NEČEMER, Marijan, LOJEN, Sonja, MASTEN RUTAR, Jasmina, ZLATIĆ, Emil, ŠIRCELJ, Helena, STOPAR, David, VIDRIH, Rajko. Determination of geographical origin of commercial tomato through analysis of stable isotopes, elemental composition and chemical markers. Food control. [Print ed.]. 2018, vol 89, str. 133-141, ilustr. ISSN 0956-7135. DOI: 10.1016/j.foodcont.2017.11.013. [COBISS.SI-ID 4845944]

343. MEGUŠAR, Polona, STOPAR, David, POKLAR ULRIH, Nataša, ROGELJ, Luka, STERGAR, Jošt, MILANIČ, Matija, ŽIVKOVIĆ, Andrej, POŽRL, Tomaž, DOGŠA, Iztok, PRISLAN, Iztok. Effects of different starches and hydrocolloids on model dough properties and quality of gluten-free bread. V: BEŠTER-ROGAČ, Marija (ur.), et al. Book of abstracts. 32nd Conference of The European Colloid and Interface Society, Ljubljana, Slovenia, 2nd-7th September 2018. Ljubljana: Faculty of Chemistry and Chemical Technology, 2018. Str. 466, op8.15. ISBN 978-961-6756-90-7. [COBISS.SI-ID 4972664]

344. PRŠIN, Tjaša. Eksperimentalna evolucija virusa mozaika pepina (PepMV) in virusa Y krompirja (PVY) v mešani in samostojnih okužbah : magistrsko delo : magistrski študij - 2. stopnja = Experimental evolution of Pepino mosaic virus (PepMV) and Potato virus Y (PVY) in mixed and single infections : M. Sc. Thesis : Master Study Programmes. Ljubljana: [T. Pršin], 2018. XI, 58, [19] f., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 4930639]

345. MEGUŠAR, Polona, STOPAR, David, POKLAR ULRIH, Nataša, ROGELJ, Luka, STERGAR, Jošt, MILANIČ, Matija, ŽIVKOVIĆ, Andrej, POŽRL, Tomaž, DOGŠA, Iztok, PRISLAN, Iztok. Interactions between starch and different hydrocolloids studied with differential scanning calorimetry, rheometry and hyperspectral imaging. V: New trends on sensing-monitoring-telediagnosis for life sciences, Brasov, Romania, NT SMT-LS 2018, August 30-September 1, 2018 : abstract book. Brasov: [Transilvania University of Brasov ... etc.], 2018. Str. 96, p3.3. [COBISS.SI-ID 4959352]

346. NABERGOJ, Dominik. Kontinuirana proizvodnja bakteriofagov v sistemu dveh zaporednih bioreaktorjev : doktorska disertacija = Continuous production of bacteriophages in a system of two consecutive bioreactors : doctoral dissertation. Ljubljana: [D. Nabergoj], 2018. XX, 119, [11] f., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 9120633]

347. STOPAR, David. Mehka mikrobna tkiva v redkih bakterijskih suspenzijah : vabljeno predavanje v okviru biofizikalnega seminarja Društva biofizikov Slovenije in Laboratorija za biofiziko (IJS), Institut Jožef Stefan, Ljubljana, 25. januar 2018. [COBISS.SI-ID 4875640]

348. ŠKRABAN, Jure, JANČIČ, Nina, DOGŠA, Iztok, STOPAR, David, TRČEK, Janja. Partial characterization of exopolysaccharides from selected strains of acetic acid bacteria. V: Program. 5th International Conference on Acetic Acid Bacteria (AAB2018), 04-07 September 2018, Freising, Germany. Munich: Tehnical University of Munich, School of Life Sciences Weihenstephan, 2018. Str. 49. [COBISS.SI-ID 24030984]

349. STOPAR, David, DANEVČIČ, Tjaša. Poročilo o " Selektivnem testiranju mikrobiološke aktivnosti v oblogah depozita savske strani toplotnega izmenjevalca " : [naročnik] NEK. Ljubljana: Biotehnična fakulteta, Oddelek za živilstvo, Katedra za mikrobiologijo; Krško: Nuklearna elektrarna Krško, 2018. 13 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 4911736]

350. SRETENOVIĆ, Simon, STOJKOVIĆ, Biljana, DOGŠA, Iztok, KOSTANJŠEK, Rok, POBERAJ, Igor, STOPAR, David. Protocols for evaluating local bacterial viscoelastic environment and mechanical coupling in dilute bacterial suspensions. Protocol exchange. 2018, str. 1-7, ilustr. ISSN 2043-0116. DOI: 10.1038/protex.2018.016. [COBISS.SI-ID 4874104]

351. OGRIZEK, Janja. Rastlinski inhibitorji zaznavanja kvoruma patogenih bakterij, prenosljivih s hrano : diplomsko delo = Plant compounds as quorum sensing inhibitors of food-borne pathogenic bacteria : B. Sc. thesis. Ljubljana: [J. Ogrizek], 2018. VII, 25 f., ilustr. Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, Ljubljana, Diplomsko delo univerzitetnega študija - 1. stopnja Živilstvo in prehrana, 453. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 4948344]

352. ŠARC, Andrej, KOSEL, Janez, STOPAR, David, ODER, Martina, DULAR, Matevž. Removal of bacteria Legionella pneumophila, Escherichia coli, and Bacillus subtilis by (super)cavitation. Ultrasonics sonochemistry. Apr. 2018, vol. 42, str. 228-236, ilustr. ISSN 1350-4177. https://ac.els-cdn.com/S1350417717305072/1-s2.0-S1350417717305072-main.pdf?_tid=8731f192-db3f-11e7-96e6-00000aacb35d&acdnat=1512645336_7ae6f9b0762e2f47704d5873693ed3c0, DOI: 10.1016/j.ultsonch.2017.11.004. [COBISS.SI-ID 15787803]

353. BEC, Sabina. Vpliv dodatkov in predhodne obdelave zgoščenega sekundarnega blata na produkcijo bioplina : magistrsko delo = Influence of supplements and pre-treatment of concentrated secondary sludge on the production of biogas : M. Sc. thesis. Ljubljana: [S. Bec], 2018. XIII, 54 f., [26] f. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Študij biotehnologije, Magistrsko delo magistrskega študija - 2. stopnja Biotehnologija, 130. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 8915577]

354. HORVAT, Maruša. Vpliv zunajceličnih polimerov na mehanske in funkcionalne lastnosti biofilmov bakterije Escherichia coli : magistrsko delo = The effect of extracellular matrix polimers on mechanical and functional properties of Escherichia coli biofilms : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [M. Horvat], 2018. X, 44 str., [3] str. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 146. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 4974968]
nagrada: Fakultetna Prešernova nagrada BF za leto 2019

355. DOGŠA, Iztok, SIMUNIČ, Urh, PANDUR, Žiga, KOSEL, Janez, DULAR, Matevž, STOPAR, David. What makes bacterial resistant to hydrodynamic cavitation treatment?. V: DULAR, Matevž (ur.). Workshop on Cavitation Exploitation, 27- 28 September 2018, Ljubljana, Slovenia. Ljubljana: University of Ljubljana, Faculty of Mechanical Engineering; [Brussels]: European Research Council, 2018. Str. 57. [COBISS.SI-ID 5019768]

356. ZUPANC, Mojca, PANDUR, Žiga, STEPIŠNIK PERDIH, Tadej, STOPAR, David, PETKOVŠEK, Martin, DULAR, Matevž. Effects of cavitation on different microorganisms : the current understanding of the mechanisms taking place behind the phenomenon : a review and proposals for further research. Ultrasonics sonochemistry. Oct. 2019, vol. 57, str. 147-165, ilustr. ISSN 1350-4177. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1350417719302305?via%3Dihub#!, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.ultsonch.2019.05.009. [COBISS.SI-ID 16633627]

357. KOSTANJŠEK, Rok, SRETENOVIĆ, Simon, STOJKOVIĆ, Biljana, DOGŠA, Iztok, POBERAJ, Igor, STOPAR, David. A first proof of an early mechanical coupling and biofilm formation in dilute bacterial suspensions. V: GRBOVIĆ NOVAKOVIĆ, Jasmina D. (ur.), NESTOROVIĆ, Nataša (ur.), RAJNOVIĆ, Dragan (ur.). MCM2019 : proceedings from the 14th Multinational Congress on Microscopy, September 15-20, 2019, Belgrade, Serbia. Belgrade: University of Belgrade, Institute for Biological Research "Siniša Stanković", National Institute of Republic of Serbia: Serbian Society for Microscopy, 2019. Str. 144-145, ilustr. ISBN 978-86-80335-11-7. https://www.sdm.edu.rs/mcm2019/assets/docs/Proceedings_MCM2019.pdf. [COBISS.SI-ID 5169743]

358. DRAB, Mitja, STOPAR, David, KRALJ-IGLIČ, Veronika, IGLIČ, Aleš. Inception mechanisms of tunneling nanotubes. Cells. 2019, no. 6, 626, str. 1-17, ilustr. ISSN 2073-4409. https://www.mdpi.com/2073-4409/8/6/626, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.3390/cells8060626. [COBISS.SI-ID 12576084]

359. STOPAR, David. Kaj se zgodi, ko mikroba ni? : predavanje na dogodku BEST dnevi tehnike in naravoslovja (BDTN 2019), Ljubljana, 5. 12. 2019. https://www.bestljubljana.si/bdtn-2019/. [COBISS.SI-ID 5140856]

360. STROJIN, Bernarda. Konjugacijski prenos plazmida pOX38a v realnem času : magistrsko delo = Conjugation transfer of pOX38a plasmid in real time : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [B. Strojin], 2019. XI, 47 f., [3] f. pril., ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 173. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 5099640]

361. KOSTANJŠEK, Rok, SRETENOVIĆ, Simon, STOJKOVIĆ, Biljana, DOGŠA, Iztok, POBERAJ, Igor, STOPAR, David. Mehanske povezave planktonskih bakterij v redkih suspenzijah. V: PIRKER, Luka (ur.), et al. Knjiga povzetkov. 3. slovensko posvetovanje mikroskopistov, 16. in 17. maj, Ankaran. 1. izd. Ljubljana: Slovensko društvo za mikroskopijo, 2019. Str. 32, ilustr. ISBN 978-961-94264-1-8. [COBISS.SI-ID 5053816]

362. STOPAR, David. Mikrobna ekologija : predavanje za študente 1. stopnje študijskih programov Biologija in Ekologija z naravovarstvom na Fakulteti za naravoslovje in matematiko Univerze v Mariboru, 24. 4. 2019. [COBISS.SI-ID 5155960]

363. STOPAR, David. Nevidne bakterijske povezave v redki suspenziji. Letno poročilo ... [Slovenska tiskana izd.]. 2019, str. 84, ilustr. ISSN 2350-5621. http://www.arrs.si/sl/analize/publ/inc/19/ARRS-LP-18.pdf. [COBISS.SI-ID 5139320]

364. STOPAR, David. Okoljska mikrobiologija : predavanje na Svečani akademiji ob 60. obletnici delovanja Slovenskega mikrobiološkega društva, Ljubljana, 30. 9. 2019. https://www.smd.si/svecana-akademija-ob-60-obletnici-delovanja-slovenskega-mikrobioloskega-drustva/. [COBISS.SI-ID 5140344]

365. STOPAR, David, DANEVČIČ, Tjaša. Poročilo o " Selektivnem testiranju mikrobiološke aktivnosti v oblogah depozita savske strani toplotnega izmenjevalca " : [naročnik] NEK. Ljubljana: Biotehnična fakulteta, Oddelek za živilstvo, Katedra za mikrobiologijo; Krško: Nuklearna elektrarna Krško, 2019. 12 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 5139576]

366. HUDEJ, Lara. Preučevanje biofilma bakterije Enterococcus faecalis Symbioflor 1 na modelnih zobnih površinah : magistrsko delo = A study of the bacterium Enterococcus faecalis Symbioflor 1 biofilm on model dental surfaces : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [L. Hudej], 2019. IX, 43 f., ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 169. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 5089400]

367. STOPAR, David (intervjuvanec). Prof. dr. David Stopar : mikroorganizmi ne čakajo in nimajo počitnic : bakterije niso tako osamljene, kot se je zdelo. Peti maj. sep. 2019, št. 6, str. 48-52, ilustr. [COBISS.SI-ID 5142392]

368. ERIČ, Miran, STOPAR, David, SOLINA, Franc, KAVKLER, Katja. Reconceptualization of the contemporary maritime museum : do we really need the original waterlogged wooden artefacts and objects?. Skyllis : Zeitschrift für Unterwasserarchäologie. 2019, jhg. 19, ht. 1/2, str. 11-28, ilustr. ISSN 1436-3372. [COBISS.SI-ID 32571395]

369. TRAMŠEK, Kaja. Reološka analiza izbranih morskih bakterijskih izolatov : magistrsko delo : magistrski študij - 2. stopnja = Rheological analysis of the selected marine bacteria isolates : M. Sc. Thesis : Master Study Programmes. Ljubljana: [K. Tramšek], 2019. XI f., 63, [13] str., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 5079375]

370. STOPAR, David, SRETENOVIĆ, Simon, KOSTANJŠEK, Rok, STOJKOVIĆ, Biljana, POBERAJ, Igor, TURK, Valentina, DOGŠA, Iztok. Soft microbial tissues in dilute bacterial suspensions. V: AERC 2019 : book of abstracts. 13th Annual European Rheology Conference, April 8-11, 2019, Portorož, Slovenia. [Ljubljana]: Slovenian Society for Experimental Mechanics: Slovenian Society of Rheology, 2019. Str. 15, la6. [COBISS.SI-ID 5139832]

371. PANDUR, Žiga, STOPAR, David, DULAR, Matevž. Stabilnost lipidnih veziklov na različne fizikalno-kemijske dejavnike = Lipid vesicle stability to different physico-chemical stress factors. V: DOVČ, Peter (ur.). Zbornik povzetkov. Prvi doktorski dan Bi(o)znanosti, 16. maj 2019, Ljubljana. 1. izd. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, 2019. Str. 11-12. ISBN 978-961-6379-51-9. http://www.bioznanosti.si/images/novice/Zbornik_povzetkov-doktorski_dan/Bioznanosti-2019-e-zbornik.pdf. [COBISS.SI-ID 5057912]

372. KRAIGHER, Barbara, LESKOVEC, Simona, STOPAR, David. Študijsko gradivo za vaje pri predmetu Okolje in mikrobi : Študij mikrobiologije, 2. stopnja. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2019. https://vis.bf.uni-lj.si/. [COBISS.SI-ID 5052536]

373. DACINGER, Renata (urednik, oseba, ki intervjuva), VALERIJ, Maj (scenarist), TREBŠE, Polonca (intervjuvanec), MIHELIČ, Rok (intervjuvanec), LAMBERT, Suzanne (intervjuvanec), STOPAR, David (intervjuvanec). Uporaba človeškega urina. Ljubljana: RTV Slovenija, javni zavod, 2019. Ugriznimo znanost. https://4d.rtvslo.si/arhiv/ugriznimo-znanost/174586453. [COBISS.SI-ID 9133689]

374. HORVAT, Maruša, PANNURI, Archana, ROMEO, Tony, DOGŠA, Iztok, STOPAR, David. Viscoelastic response of Escherichia coli biofilms to genetically altered expression of extracellular matrix components. Soft matter. 2019, vol. 15, str. 5042-5051, ilustr. ISSN 1744-683X. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1039/c9sm00297a. [COBISS.SI-ID 5060728]

375. HYMPANOVA, Michaela, TERLEP, Saša, MARKOVA, Aneta, PRCHAL, Lukas, DOGŠA, Iztok, PULKRABKOVA, Lenka, BENKOVA, Marketa, MAREK, Jan, STOPAR, David. The antibacterial effects of new N-Alkylpyridinium salts on planktonic and biofilm bacteria. Frontiers in microbiology. Oct. 2020, vol. 11, str. 1-12, article 573951, ilustr. ISSN 1664-302X. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.3389/fmicb.2020.573951. [COBISS.SI-ID 33768963]

376. TERLEP, Saša, HYMPANOVA, Michaela, DOGŠA, Iztok, PAJK, Franja, STOPAR, David. Fotoakustično odstranjevanje biofilmov Enterococcus faecalis iz titanovih površin z laserjem Er:YAG s super kratkimi pulzi. V: JAMNIKAR CIGLENEČKI, Urška (ur.), KUŠAR, Darja (ur.). 8. kongres Slovenskega mikrobiološkega društva : knjiga povzetkov : 23.-25. september 2020 : kongres SMD, 23.-25. 9. 2020 : virtualni kongres. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 2020. Str. 105. ISBN 978-961-90346-8-2. http://www.smd.si/wp-content/uploads/2020/09/Knjiga-povzetkov_SMD_2020_WEB_koncna_ver3_compressed.pdf. [COBISS.SI-ID 33478659]

377. STOPAR, David (intervjuvanec). Kako koronavirus preživi v telesu? : oddaja Infodrom, RTV SLO 1, 18. 3. 2020. Ljubljana: Radiotelevizija Slovenija javni zavod, 2020. https://www.youtube.com/watch?v=iPkjpeDOEcc. [COBISS.SI-ID 19278595]

378. STOPAR, David. Kakšen film je biofilm?. V: RUPNIK, Maja (ur.), MARINŠEK-LOGAR, Romana (ur.). Majhno, manjše, najmanjše : eseji o mikrobiologiji. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 2020. Str. 95-100. ISBN 978-961-90346-7-5. [COBISS.SI-ID 37832451]

379. ZAJKOSKA, Sandra. Karakterizacija biofilma klavniških in okoljskih sevov bakterij Campylobacter jejuni : magistrsko delo = Biofilm characterization of slaughterhouse and environmental isolates in Campylobacter jejuni : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [S. Zajkoska], 2020. XII, 60 f., [1] f. pril, ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 192. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 5166968]

380. STOPAR, David (intervjuvanec). Koronavirus : oddaja Nedeljski gost, Radio Sora, Val 202, 23. 3. 2020. Škofja Loka: Radio Sora, 2020. 1 spletni vir (1 zvočna datoteka (25 min, 55 sek)). https://www.radio-sora.si/arhiv-oddaj/nedeljski-gost/55/4338. [COBISS.SI-ID 19284483]

381. SIMUNIČ, Urh, PIPP, Peter, DULAR, Matevž, STOPAR, David. The limitations of hydrodynamic removal of biofilms from the dead-ends in a model drinking water distribution system. Water research. 2020, vol. 178, str. 1-13, ilustr. ISSN 0043-1354. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0043135420303754?via%3Dihub, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.watres.2020.115838. [COBISS.SI-ID 12956163]

382. PANDUR, Žiga, DOGŠA, Iztok, DULAR, Matevž, STOPAR, David. Liposome destruction by hydrodynamic cavitation in comparison to chemical, physical and mechanical treatments. Ultrasonics sonochemistry. Mar. 2020, vol. 61, str. 1-11, ilustr. ISSN 1350-4177. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1350417719309228?via%3Dihub, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.ultsonch.2019.104826. [COBISS.SI-ID 5144696]

383. MANDIĆ-MULEC, Ines, KRAIGHER, Barbara, DOGŠA, Iztok, ŠTEFANIČ, Polonca, DANEVČIČ, Tjaša, ŠPACAPAN, Mihael, BELCIJAN PANDUR, Katarina, EREGA, Andi, PODNAR, Eli, ŠIMUNOVIĆ, Katarina, BOLJEŠIĆ, Maja, KOVAČEC, Eva, BLAZNIK, Mojca, STOPAR, David, SMOLE MOŽINA, Sonja. Mehanizmi in posledice socialnih interakcij v biofilmu. V: JAMNIKAR CIGLENEČKI, Urška (ur.), KUŠAR, Darja (ur.). 8. kongres Slovenskega mikrobiološkega društva : knjiga povzetkov : 23.-25. september 2020 : kongres SMD, 23.-25. 9. 2020 : virtualni kongres. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 2020. Str. 22. ISBN 978-961-90346-8-2. http://www.smd.si/wp-content/uploads/2020/09/Knjiga-povzetkov_SMD_2020_WEB_koncna_ver3_compressed.pdf. [COBISS.SI-ID 31537411]

384. PANDUR, Žiga, DULAR, Matevž, STOPAR, David. Odpornost bakterijskih celic Escherichia coli na sonolizo. V: JAMNIKAR CIGLENEČKI, Urška (ur.), KUŠAR, Darja (ur.). 8. kongres Slovenskega mikrobiološkega društva : knjiga povzetkov : 23.-25. september 2020 : kongres SMD, 23.-25. 9. 2020 : virtualni kongres. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 2020. Str. 99. ISBN 978-961-90346-8-2. http://www.smd.si/wp-content/uploads/2020/09/Knjiga-povzetkov_SMD_2020_WEB_koncna_ver3_compressed.pdf. [COBISS.SI-ID 37779459]

385. SIMUNIČ, Urh. Odstranjevanje bakterij v modelnih vodovodnih sistemih : magistrsko delo : [Fakultetna Prešernova nagrada BF za leto 2020] = Removal of bacteria in model plumbing systems : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [U. Simunič], 2020. XIV, 88 str., [14] str. pril, ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 191. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 5151096]
nagrada: Fakultetna Prešernova nagrada BF za leto 2020

386. SINKOVIČ, Lovro, NEČEMER, Marijan, OGRINC, Nives, ŽNIDARČIČ, Dragan, STOPAR, David, VIDRIH, Rajko, MEGLIČ, Vladimir. Parameters for discrimination between organic and conventional production : a case study for chicory plants (Cichorium intybus L.). Food and chemical toxicology. Feb. 2020, vol. 136, article no. 111109, str. 1-7, ilustr. ISSN 0278-6915. DiRROS - Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije, DOI: 10.1016/j.fct.2019.111109. [COBISS.SI-ID 5948264]
nagrada: Priznanje Znanstvenega sveta KIS za pomemben znanstveno-raziskovalni dosežek2020

387. STOPAR, David (intervjuvanec). Radiovedni: Koliko tehtajo vsi trenutno aktivni SARS-CoV-2 virusi v Sloveniji? : intervju, Radio Slovenija, Val 202. MMC RTV SLO : prvi multimedijski portal. 19. 11. 2020. ISSN 1581-372X. https://val202.rtvslo.si/2020/11/radiovedni-koliko-tehtajo-vsi-trenutno-aktivni-sars-cov-2-virusi-v-sloveniji/. [COBISS.SI-ID 42966787]

388. VAJDIČ, Tadeja, ŠKRABAN, Jure, FIJOK, Kim, JANČIČ, Nina, DOGŠA, Iztok, STOPAR, David, TRČEK, Janja. Raznolikost vodotopnih zunajceličnih heteropolisaharidov ocetnokislinskih bakterij in njihove viskoelastične lastnosti. V: JAMNIKAR CIGLENEČKI, Urška (ur.), KUŠAR, Darja (ur.). 8. kongres Slovenskega mikrobiološkega društva : knjiga povzetkov : 23.-25. september 2020 : kongres SMD, 23.-25. 9. 2020 : virtualni kongres. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 2020. Str. 112. ISBN 978-961-90346-8-2. http://www.smd.si/wp-content/uploads/2020/09/Knjiga-povzetkov_SMD_2020_WEB_koncna_ver3_compressed.pdf. [COBISS.SI-ID 30878467]

389. HYMPANOVA, Michaela, TERLEP, Saša, MARKOVA, Aneta, PRCHAL, Lukas, DOGŠA, Iztok, MAREK, Jan, STOPAR, David. The susceptibility of E. faecalis biofilm against selected new quaternary ammonium compounds. V: Proceedings of the Biofilms 9, 29 September 2020 - 01 October 2020, Karlsruhe, Germany : online conference. Karlsruhe: Institute of Technology, 2020. Str. 80. http://www.biofilms9.kit.edu/biofilms9_proceedings.pdf, DOI: 10.5194/biofilms9-30. [COBISS.SI-ID 48438275]

390. DOGŠA, Iztok, KOSTANJŠEK, Rok, STOPAR, David. A thin line between plankton and biofilm. V: Proceedings of the Biofilms 9, 29 September 2020 - 01 October 2020, Karlsruhe, Germany : online conference. Karlsruhe: Institute of Technology, 2020. Str. 121. http://www.biofilms9.kit.edu/biofilms9_proceedings.pdf, DOI: 10.5194/biofilms9-157. [COBISS.SI-ID 48433923]

391. LENGAR, Živa. Uporaba meduznega mukusa v procesih dekontaminacije vode : magistrsko delo = The use of jellyfish mucus in decontamination of water : M. Sc. thesis. Ljubljana: [Ž. Lengar], 2020. IX, 38 str., ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 12983555]

392. STOPAR, David (intervjuvanec). Virus - nanomašina, ki lahko z 20 geni uniči organizem, ki jih ima 20.000 : oddaja na Radio Slovenija, Val 202, 19. 3. 2020. Ljubljana: Radiotelevizija Slovenija javni zavod, 2020. 1 spletni vir (1 zvočna datoteka (32 min, 24 sek)). https://val202.rtvslo.si/2020/03/davidstopar/. [COBISS.SI-ID 19283203]

393. BLAZNIK, Mojca, ŠTEFANIČ, Polonca, MANDIĆ-MULEC, Ines, STOPAR, David, DOGŠA, Iztok. Viskoelastične lastnosti novo nastajajočih peliklov bakterije Bacillus subtilis na interfazi tekočina/zrak. V: JAMNIKAR CIGLENEČKI, Urška (ur.), KUŠAR, Darja (ur.). 8. kongres Slovenskega mikrobiološkega društva : knjiga povzetkov : 23.-25. september 2020 : kongres SMD, 23.-25. 9. 2020 : virtualni kongres. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 2020. Str. 122. ISBN 978-961-90346-8-2. http://www.smd.si/wp-content/uploads/2020/09/Knjiga-povzetkov_SMD_2020_WEB_koncna_ver3_compressed.pdf. [COBISS.SI-ID 37762819]

394. TRČEK, Janja, DOGŠA, Iztok, ACCETTO, Tomaž, STOPAR, David. Acetan and acetan-like polysaccharides: genetics, biosynthesis, structure, and viscoelasticity. Polymers. Mar. 2021, vol. 13, iss. 5, [article no.] 815, str. 1-16, ilustr. ISSN 2073-4360. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, Digitalna knjižnica Univerze v Mariboru – DKUM, DOI: 10.3390/polym13050815, DOI: 20.500.12556/DKUM-81351. [COBISS.SI-ID 54160899]
projekt: P2-0006 Fizikalno kemijski pojavi na površinskih plasteh in uporaba nanodelcev; financer: ARRS
projekt: P4-0097 Prehrana in mikrobna ekologija prebavil; financer: ARRS
projekt: P4-0116 Mikrobiologija in biotehnologija živil in okolja; financer: ARRS
projekt: J2-2487 Bioaktivne, in situ modificirane, vlaknate membrane na osnovi bakterijske celuloze: procesiranje, karakterizacija in ocena uporabnosti v biomedicini; financer: ARRS

395. MOLAN, Katja, MANDIĆ-MULEC, Ines, STOPAR, David. Bakterijski virus Phi6 kot surogat za SARS-CoV-2. Mikrobiolog.si. dec. 2021, letn. 1, št. 3, str. 6-9, ilustr. ISSN 2784-4463. http://www.smd.si/wp-content/uploads/2022/02/3_mikrobiolog_si.pdf. [COBISS.SI-ID 98907395]

396. PANDUR, Žiga, STOPAR, David. Evolution of mechanical stability from lipid layers to complex bacterial envelope structures. V: BONGIOVANNI, Antonella (ur.), et al. Advances in biomembranes and lipid self-assembly. 1st ed. [London]: Elsevier: Academic Press, cop. 2021. Str. 207-251, ilustr. Advances in biomembranes and lipid self-assembly, vol. 33. ISBN 978-0-12-824608-5. ISSN 2451-9634. https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S2451963420300339#!. [COBISS.SI-ID 37370371]

397. PANDUR, Žiga, ZEVNIK, Jure, PODBEVŠEK, Darjan, STOJKOVIĆ, Biljana, STOPAR, David, DULAR, Matevž. Interaction between a single cavitation bubble and bacteria : recent developments in the understading of the mechanisms of cavitation. V: ESS-JSS-AOSS 1st Joint Sonochemistry Conference (online), November 8-10, 2021 : abstract book. [S. l.]: Japan Society of Sonochemistry, 2021. Str. [13], ilustr. [COBISS.SI-ID 85715715]

398. PANDUR, Žiga, DULAR, Matevž, STOPAR, David. Izzivi pri proučevanju vpliva hidrodinamske kavitacije na bakterijske celice = Challenges in study of hydrodinamic cavitation effects on bacterial cells. V: STOPAR, David (ur.). Mikrobiološke ideje na prepihu : zbornik prispevkov. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2021. Str. 137-147, ilustr. ISBN 978-961-6908-26-9. [COBISS.SI-ID 60811267]

399. GUNDE-CIMERMAN, Nina, RAVNIKAR, Maja, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. Majhno, manjše, najmanjše. Večer. [Tiskana izd.]. 27. mar. 2021, str. 24. ISSN 0350-4972. [COBISS.SI-ID 58937091]

400. STOPAR, David (urednik). Mikrobiološke ideje na prepihu : zbornik prispevkov. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2021. VIII, 167 str., ilustr. ISBN 978-961-6908-26-9. [COBISS.SI-ID 49089027]

401. DRAB, Mitja, PANDUR, Žiga, PENIČ, Samo, IGLIČ, Aleš, KRALJ-IGLIČ, Veronika, STOPAR, David. Monte Carlo studies of detergent solubilization of lipid bilayers. V: KRALJ-IGLIČ, Veronika (ur.). Sokratska predavanja : 4. mednarodni minisimpozij, Ljubljana, 11.-12. december 2020 : zbornik recenziranih prispevkov = Socratic lectures : 4th international minisymposium, Ljubljana, 11.-12. December 2020 : peer reviewed proceedings. Ljubljana: Zdravstvena fakulteta, 2021. Str. 14-19. ISBN 978-961-7112-02-3. https://www.zf.uni-lj.si/images/stories/datoteke/Zalozba/Sokratska_2021.pdf. [COBISS.SI-ID 52926467]
projekt: J1-9162, P2-0232, P3-0388, P4-0116.; financer: ARRS

402. DRAB, Mitja, PANDUR, Žiga, PENIČ, Samo, IGLIČ, Aleš, KRALJ-IGLIČ, Veronika, STOPAR, David. A Monte Carlo study of giant vesicle morphologies in nonequilibrium environments. Biophysical journal. 2021, vol. 120, iss. 20, str. 4418-4428, ilustr. ISSN 0006-3495. https://www.cell.com/biophysj/fulltext/S0006-3495(21)00739-6, DOI: 10.1016/j.bpj.2021.09.005. [COBISS.SI-ID 77233667]

403. SIMUNIČ, Urh, PIPP, Peter, DULAR, Matevž, STOPAR, David. Omejitve pri hidrodinamskem odstranjevanju biofilmov iz vodovodnih sistemov. V: BREGANT PERIĆ, Mateja (ur.). BFestival 2021 : predstavitev znanstvenih dosežkov strok v letu 2020 : Ljubljana, marec 2021. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, 2021. Str. 13, ilustr. [COBISS.SI-ID 54462979]

404. STOPAR, David. Omejitve pri hidrodinamskem odstranjevanju biofilmov iz vodovodnih sistemov. Mikrobiolog.si. apr. 2021, letn. 1, št. 1, str. 3-4, ilustr. ISSN 2784-4463. http://www.smd.si/wp-content/uploads/2021/05/Mikrobiolog_si_11_03-05-2021.pdf. [COBISS.SI-ID 63631619]

405. LENGAR, Živa, KLUN, Katja, DOGŠA, Iztok, ROTTER, Ana, STOPAR, David. Sequestration of polystyrene microplastics by jellyfish mucus. Frontiers in marine science. Jul. 2021, vol. 8, str. 1-11, ilustr. ISSN 2296-7745. https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmars.2021.690749/full, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DiRROS - Digitalni repozitorij raziskovalnih organizacij Slovenije, DOI: 10.3389/fmars.2021.690749. [COBISS.SI-ID 70901251]

406. TERLEP, Saša, STOPAR, David. Uporaba fotoakustičnega pretakanja tekočin z Er:YAG laserjem za odstranjevanje biofilmov iz zobnih vsadkov = Biofilm removal from dental implantants with Er:YAG photoacoustic streaming. V: STOPAR, David (ur.). Mikrobiološke ideje na prepihu : zbornik prispevkov. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2021. Str. 149-159, ilustr. ISBN 978-961-6908-26-9. [COBISS.SI-ID 60813315]

407. STOPAR, David. Uvodna beseda. V: STOPAR, David (ur.). Mikrobiološke ideje na prepihu : zbornik prispevkov. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2021. Str. vii. ISBN 978-961-6908-26-9. [COBISS.SI-ID 60760835]

408. BLAZNIK, Mojca, STOPAR, David. Viskoelastične lastnosti in morfologija plavajočih biofilmov bakterije Bacillus subtilis = Viscoelastic properties and morphology of newly formed pellicles by Bacillus subtilis on liquid-air interphase. V: STOPAR, David (ur.). Mikrobiološke ideje na prepihu : zbornik prispevkov. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2021. Str. 89-100, ilustr. ISBN 978-961-6908-26-9. [COBISS.SI-ID 60802819]

409. STOPAR, David. Vloga bakterij in virusov v ekosistemih in njihov vpliv na kroženje snovi. V: KOBAL, Tanja (ur.), GUMZEJ, Špela (ur.). Vsestranska uporabnost mikroorganizmov : Poletna šola Biotehniške fakultete, 27.-30. september 2021 : zbornik. Elektronska izd. Ljubljana: Biotehniška fakulteta: Študentski svet Biotehniške fakultete, 2021. Str. 36-37. ISBN 978-961-6379-57-1. https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?id=150127. [COBISS.SI-ID 83349507]

410. BLAZNIK, Mojca, ŠTEFANIČ, Polonca, STOPAR, David. Vpliv frekvence vrtenja na nastanek in na propad peliklov bakterije Bacillus subtilis. V: HOSTNIK, Maja (ur.), KUJOVIĆ, Amela (ur.), MRAVLJE, Jure (ur.). Drugi doktorski dan Bi(o)znanosti : zbornik prispevkov : [27. maj 2021, Biotehniška fakulteta (spletni dogodek)]. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, 2021. Str. 27-35, ilustr. ISBN 978-961-6379-56-4. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=127208. [COBISS.SI-ID 65292035]

411. VERTOT, Manca. Zunajcelični polisaharidni sloj bakterij Campylobacter jejuni : magistrsko delo = The extracellular polysaccharide layer of Campylobacter jejuni : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [M. Vertot], 2021. X, 60 f., ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 241. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 87091971]
nagrada: Krkino priznanje s posebno pohvalo za leto 2022

412. PANDUR, Žiga, DULAR, Matevž, KOSTANJŠEK, Rok, STOPAR, David. Bacterial cell wall material properties determine E. coli resistance to sonolysis. Ultrasonics sonochemistry. Feb. 2022, vol. 83, str. 1-10, art. 105919, ilustr. ISSN 1350-4177. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1350417722000128?via%3Dihub, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.ultsonch.2022.105919. [COBISS.SI-ID 93971971]
projekt: 771567 An investigation of the mechanisms at the interaction between cavitation bubbles and contaminants [CABUM]; financer: EU
projekt: P2-0401 Energetsko strojništvo; financer: ARRS
projekt: P4-0116 Mikrobiologija in biotehnologija živil in okolja; financer: ARRS
projekt: I0-0022 Mreža raziskovalnih infrastrukturnih centrov Univerze v Ljubljani (MRIC UL); financer: ARRS

413. STOPAR, David. Biofilmi: osnovni koncepti in z njimi povezani fenomeni : predavanje preko videokonference na 22. Slovenskih parodontoloških dnevih, 8. 4. 2022. [COBISS.SI-ID 115169027]

414. ZEVNIK, Jure. Cavitation Bubble Interaction with Deformable Structures on a Micron Level : doctoral dissertation. Ljubljana: [J. Zevnik], 2022. XXVI, 142 str., ilustr. https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?id=164865&lang=slv, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 136130563]

415. PANDUR, Žiga, ZEVNIK, Jure, PODBEVŠEK, Darjan, STOJKOVIĆ, Biljana, STOPAR, David, DULAR, Matevž. A fight between a single cavitation bubble and bacteria. V: Cavitation meets data science : advances, applications, and challenges at the interfaces of nonlinear physics, data processing, and machine learning. International Symposium, June 10-11, 2022 Göttingen, Germany. Göttingen: [s. n.], 2022. Str. 25-26. [COBISS.SI-ID 117336323]

416. RAHMANI, Ramin, MOLAN, Katja, BROJAN, Miha, PRASHANTH, Konda Gokuldoss, STOPAR, David. High virucidal potential of novel ceramic–metal composites fabricated via hybrid selective laser melting and spark plasma sintering routes. International journal of advanced manufacturing technology. 2022, vol. 120, str. 975-988, ilustr. ISSN 0268-3768. https://link.springer.com/article/10.1007/s00170-022-08878-x, DOI: 10.1007/s00170-022-08878-x. [COBISS.SI-ID 97005571]
projekt: ASTRA6-6; financer: Estonian Ministry of Education and Research, European Regional Development Fund
projekt: P2-0263 Mehanika v tehniki; financer: ARRS
projekt: P4-0116 Mikrobiologija in biotehnologija živil in okolja; financer: ARRS

417. BLAZNIK, Mojca, ŠTEFANIČ, Polonca, KOSTANJŠEK, Rok, MANDIĆ-MULEC, Ines, DOGŠA, Iztok, STOPAR, David. The holistic approach on studying Bacillus subtilis pellicle development in situ. V: B10films, Ecology meets technology, 9th -11th May 2022, Leipzig, Germany : Book of abstracts. Leipzig: Helmholtz Centre for Environmental Research (UFZ), 2022. Str. 66. https://www.ufz.de/index.php?en=49335. [COBISS.SI-ID 117295363]

418. MEGUŠAR, Polona, MILANIČ, Matija, STOPAR, David, POKLAR ULRIH, Nataša, ŽIVKOVIĆ, Andrej, POŽRL, Tomaž, DOGŠA, Iztok, PRISLAN, Iztok. Hyperspectral imaging of gluten-free dough and bread. V: SANDAK, Anna Malgorzata (ur.), et al. 1st SensorFINT International Conference : Non-destructive spectral sensors advances and future trends : 10-12 May 2022 Izola, Slovenia : book of abstracts. Electronic ed. Izola: Innorenew CoE; Koper: University of Primorska Press, cop. 2022. Str. [1]. ISBN 978-961-293-153-7, ISBN 978-961-293-154-4. https://www.hippocampus.si/ISBN/978-961-293-153-7.pdf. [COBISS.SI-ID 108714755]

419. STOPAR, David. Katedra za mikrobno ekologijo in fiziologijo. V: Petinsedemdesetletnica Biotehniške fakultete Univerze v Ljubljani. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, 2022. Str. 52-53, ilustr. ISBN 978-961-6379-67-0. https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?id=163347&lang=slv. [COBISS.SI-ID 130971907]

420. PANDUR, Žiga. Mehanizem delovanja kavitacijskih mehurčkov na bakterijsko celico : doktorska disertacija = Mechanism of action of the cavitation bubbles on bacterial cell : doctoral dissertation. Ljubljana: [Ž. Pandur], 2022. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (XI, 137 f., [75] f. pril.), ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 134466051]

421. DRAB, Mitja, PANDUR, Žiga, PENIČ, Samo, IGLIČ, Aleš, KRALJ-IGLIČ, Veronika, STOPAR, David. Nonspecific Influence of surfactin on lipid membranes is temperature dependent. V: KRALJ-IGLIČ, Veronika (ur.). Socratic Lectures : 6th international symposium, Ljubljana, Slovenia, December 11, 2021 : peer reviewed proceedings. 1st digital ed. Ljubljana: University of Ljubljana Press, 2022. Str. 125-129, ilustr. ISBN 978-961-7128-20-8. https://www.zf.uni-lj.si/images/stories/datoteke/Zalozba/Sokratska_6.pdf. [COBISS.SI-ID 159003651]

422. STOPAR, David. Okoljska mikrobiologija v svetu in Sloveniji v zadnjih 10 letih = Environmental microbiology worldwide and in Slovenia in the past decade. V: RUPNIK, Maja (ur.), BARLIČ-MAGANJA, Darja (ur.). 60 let Slovenskega mikrobiološkega društva : zbornik. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 2022. Str. 61-69. ISBN 978-961-90346-9-9. [COBISS.SI-ID 128682499]

423. MOLAN, Katja, RAHMANI, Ramin, KRKLEC, Daniel, BROJAN, Miha, STOPAR, David. Phi 6 bacteriophage inactivation by metal salts, metal powders, and metal surfaces. Viruses. 2022, vol. 14, iss. 2, str. 1-12, art. 204. ISSN 1999-4915. https://www.mdpi.com/1999-4915/14/2/204, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.3390/v14020204. [COBISS.SI-ID 94779907]
projekt: P4-0116 Mikrobiologija in biotehnologija živil in okolja; financer: ARRS
projekt: P2-0263 Mehanika v tehniki; financer: ARRS

424. TERLEP, Saša. Photoacoustic biofilm removal from titanium surfaces of dental implants with Er: YAG laser : doctoral dissertation. Ljubljana: [S. Terlep], 2022. XVIII, 108 f., ilustr. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=141811&lang=slv, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, Digitalna knjižnica Slovenije - dLib.si. [COBISS.SI-ID 131139587]

425. TERLEP, Saša, HYMPANOVA, Michaela, DOGŠA, Iztok, PAJK, Franja, STOPAR, David. Photoacoustic removal of Enterococcus faecalis biofilms from titanium surface with an Er:Yag laser using super short pulses. Lasers in medical science. 2022, vol. 37, str. 381–390. ISSN 0268-8921. DOI: 10.1007/s10103-021-03265-6. [COBISS.SI-ID 50278659]
projekt: Lifelong Learning Programme/Erasmus; financer: European Commission
projekt: P4-0116 Mikrobiologija in biotehnologija živil in okolja; financer: ARRS

426. DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Poročilo o " Selektivnem testiranju mikrobiološke aktivnosti v oblogah depozita savske strani kondenzatorja " : naročnik NEK, Krško. Ljubljana: Biotehnična fakulteta, Oddelek za mikrobiologijo, 2022. 15 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 133451267]

427. DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Poročilo o spremljanju fizikalno-kemijskih in mikrobioloških parametrov v depozitoriju arheološkega mokrega lesa v ribniku na Verdu pri Vrhniki maj 2022 : naročnik Mestni muzej Ljubljana. Ljubljana: Biotehnična fakulteta, Oddelek za mikrobiologijo, Katedra za mikrobno ekologijo in fiziologijo, maj 2022. 7 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 199072515]

428. MANDIĆ-MULEC, Ines, MOLAN, Katja, STOPAR, David, SMOLE MOŽINA, Sonja, PETKOVIĆ, Hrvoje, AVBELJ, Martina, MALIN, Valentina, LESKOVEC, Simona, GORŠEK, Sara, BELCIJAN PANDUR, Katarina, KRKLEC, Daniel. Razvoj aktivnih učinkovin in površin proti virusom z ovojnico : Program: Mikrobiologija in biotehnologija živil in okolja : raziskovalne skupine v svetu SARS-CoV-2 in COVID-19. Mikrobiolog.si. apr. 2022, letn. 2, št. 1, str. 44-45, ilustr. ISSN 2784-4463. http://www.smd.si/wp-content/uploads/2022/08/2-1_mikrobiolog_si-FINAL-050822-za-na-spletno-stran-1.pdf. [COBISS.SI-ID 139410691]

429. BLAZNIK, Mojca. Sistemski pogled na razvoj pelikla pri bakteriji Bacillus subtilis : mladi mikrobiologi se predstavijo. Mikrobiolog.si. dec. 2022, letn. 2, št. 3, str. 5-6, ilustr. ISSN 2784-4463. http://www.smd.si/wp-content/uploads/2023/02/MIKROBIOLOG.SI-DECEMBER-2022.pdf. [COBISS.SI-ID 143426051]

430. BLAZNIK, Mojca, ŠTEFANIČ, Polonca, KOSTANJŠEK, Rok, MANDIĆ-MULEC, Ines, DOGŠA, Iztok, STOPAR, David. Systems view of Bacillus subtilis pellicle development. V: MRAVLJE, Jure (ur.), et al. Tretji Doktorski dan Bi(o)znanosti? : zbornik povzetkov : [7. junij 2022, Biotehniška fakulteta]. Ljubljana: Biotehniška fakulteta, 2022. Str. 3. https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?id=157079&lang=slv. [COBISS.SI-ID 111666947]

431. BLAZNIK, Mojca, ŠTEFANIČ, Polonca, KOSTANJŠEK, Rok, MANDIĆ-MULEC, Ines, DOGŠA, Iztok, STOPAR, David. Systems view of Bacillus subtilis pellicle development. V: FEMS conference on microbiology : 30 June - 2 July 2022, Belgrade, Serbia : electronic abstract book. Belgrade: Serbian Society of Microbiology, 2022. Str. 570-571. ISBN 978-86-914897-8-6. https://www.femsbelgrade2022.org/abstract-book. [COBISS.SI-ID 125944579]

432. BLAZNIK, Mojca, ŠTEFANIČ, Polonca, KOSTANJŠEK, Rok, MANDIĆ-MULEC, Ines, DOGŠA, Iztok, STOPAR, David. Systems view of Bacillus subtilis pellicle development. npj biofilms and microbiomes. 2022, vol. 8, str. 1-11, art. 25, ilustr. ISSN 2055-5008. https://www.nature.com/articles/s41522-022-00293-0, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1038/s41522-022-00293-0. [COBISS.SI-ID 105098243]
projekt: P4-0116 Mikrobiologija in biotehnologija živil in okolja; financer: ARRS
projekt: J4-9302 Raziskave medceličnih komunikacij v večceličnih skupnostih različnih izolatov bakterije iz rodu Bacillus; financer: ARRS
projekt: J1-3021 Platforma osnovana na sintetičnih biofilmih za preučevanje in razvoj novih proti biofilmskih pristopov; financer: ARRS
projekt: L7-3186 Lasersko podprto odstranjevanje biofilmov pri parodontalnih in periimplantnih boleznih; financer: ARRS
projekt: 53622 Young researcher; financer: ARRS
projekt: Microscopy of biological samples; financer: ARRS, Mreža raziskovalnih infrastrukturnih centrov UL (MRIC UL)

433. MEGUŠAR, Polona, STOPAR, David, POKLAR ULRIH, Nataša, DOGŠA, Iztok, PRISLAN, Iztok. Thermal and rheological properties of gluten-free, starch-based model systems modified by hydrocolloids. Polymers. 2022, vol. 14, str. 1-15, art. 3242, ilustr. ISSN 2073-4360. https://www.mdpi.com/2073-4360/14/16/3242/htm, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.3390/polym14163242. [COBISS.SI-ID 118514691]
projekt: Research and Development Program Food4Future [F4F]; financer: European Regional Development Fund
projekt: P4-0121 Biokemijska in biofizikalno-kemijska karakterizacija naravnih snovi; financer: ARRS
projekt: P4-0116 Mikrobiologija in biotehnologija živil in okolja; financer: ARRS

434. KRKLEC, Daniel. Virucidno delovanje lipopeptidnih antibiotikov in virucidno delovanje kovinskih zlitin in keramičnih površin proti bakteriofagu PHI-6 : magistrsko delo = Virucidno delovanje lipopeptidnih antibiotikov in virucidno delovanje kovinskih zlitin in keramičnih površin proti bakteriofagu PHI-6 : M. Sc. thesis. Ljubljana: [D. Krklec], 2022. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (X, 41 f.), ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 127596035]

435. KODRIN, Benja. Vpliv vnosa odpadne vode iz čistilnih naprav na strukturo in delovanje mikrobne združbe v obalnem morskem ekosistemu : magistrsko delo = Influence of wastewater input on the structure and functioning of the microbial community in the coastal marine ecosystem : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [B. Kodrin], 2022. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (X, 55 str., [2] f. pril.)), ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 273. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 123549443]

436. MOLAN, Katja, FRAS ZEMLJIČ, Lidija, ŠULIGOJ, Andraž, MANDIĆ-MULEC, Ines, STOPAR, David, SMOLE MOŽINA, Sonja. Adhezijska in/ali virucidna aktivnost embalažnih folij s funkcionaliziranimi premazi proti virusu Phi6. V: PETKOVIĆ, Hrvoje (ur.). Letno srečanje programske skupine Mikrobiologija in biotehnologija živil in okolja (P4-0116) : Biotehniška fakulteta, Univerza v Ljubljani, Slovenija, Ljubljana, 3. 2. 2023. Ljubljana: Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2023. Str. 18, ilustr. [COBISS.SI-ID 140829443]

437. BLAZNIK, Mojca, MANDIĆ-MULEC, Ines, STOPAR, David, ŠIMUNOVIĆ, Katarina, STEINHOFF, Heiko, GRÜNBERGER, Alexander, ŠTEFANIČ, Polonca. B. subtilis kin discrimination on macroscale and single-cell level. V: Bageco 2023 : programme : 16th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology : 26 - 30 June, Copenhagen, Denmark. Copenhagen: CAP Partner, 2023. Str. 104, p18. https://bageco2023.org/wp-content/uploads/2023/06/CAP-Partner_Bageco2023_programme_A5_abstract-korr10.pdf. [COBISS.SI-ID 157996291]

438. ŠTEFANIČ, Polonca, STARE, Eva, BLAZNIK, Mojca, BELCIJAN PANDUR, Katarina, DANEVČIČ, Tjaša, KRAIGHER, Barbara, DOGŠA, Iztok, DRAGOŠ, Anna, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines, ŠIMUNOVIĆ, Katarina. Bacillus subtilis - smrtonosno dobra bakterija. V: BONČINA, Andrej (ur.), KITEK KUZMAN, Manja (ur.), POLAK, Tomaž (ur.). BFestival 2023 : predstavitev raziskovalnih dosežkov Biotehniške fakultete. Ljubljana: Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, februar 2023. Str. 9. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=144277. [COBISS.SI-ID 142032131]

439. BLAZNIK, Mojca, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines, ŠIMUNOVIĆ, Katarina, STEINHOFF, Heiko, GRÜNBERGER, Alexander, ŠTEFANIČ, Polonca. Bacillus subtilis kin discrimination on macroscale and single-cell level. V: Bacell Meeting 2023 : University of Hohenheim, 19-20 June 2023, Stuttgart-Hohenheim, Germany : program & abstracts. [Stuttgart: University of Hohenheim], 2023. Str. 47. [COBISS.SI-ID 158348291]

440. TERLEP, Saša, DOGŠA, Iztok, PAJK, Franja, STOPAR, David. Biofilm removal from in vitro narrow geometries using single and dual pulse Er:YAG laser photoacoustic irrigation. Microorganisms. 2023, vol. 11, issue 8, [article no.] 2102, str. 1-10, ilustr. ISSN 2076-2607. https://www.mdpi.com/2076-2607/11/8/2102, DOI: 10.3390/microorganisms11082102. [COBISS.SI-ID 194032387]

441. BLAZNIK, Mojca. Biologija in mehanika biofilmov bakterije Bacillus subtilis : doktorska disertacija = Biology and mechanics of Bacillus subtilis biofilm : doctoral dissertation. Ljubljana: [M. Krajnc], 2023. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (XI, 70 f., [16] f. pril.), ilustr. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 164247299]

442. DOGŠA, Iztok, KOSTANJŠEK, Rok, STOPAR, David. eDNA provides a scaffold for autoaggregation of B. subtilis in bacterioplankton suspension. Microorganisms. 2023, vol. 11, issue 2, [article no.] 332, str. 1-15, ilustr. ISSN 2076-2607. https://www.mdpi.com/2076-2607/11/2/332, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.3390/microorganisms11020332. [COBISS.SI-ID 142263043]

443. PANDUR, Žiga, ZEVNIK, Jure, PODBEVŠEK, Darjan, DULAR, Matevž, STOPAR, David. Effect of cavitation microbubble on individual bacterial cells. V: DULAR, Matevž (ur.). Workshop on Cavitation Exploitation 2023 : 20th – 22nd of September 2023, Ljubljana, Slovenia. Ljubljana: Fakulteta za strojništvo: = Faculty of Mechanical Engineering, 2023. Str. [43-44], ilustr. ISBN 978-961-7187-06-9. https://www.matevzdular.com/wp-content/uploads/2023/10/Workshop_on_cavitation_exploitation_2023-ERC_CABUM.pdf. [COBISS.SI-ID 167623171]

444. JEZERŠEK, Matija, MOLAN, Katja, TERLEP, Saša, LEVIČNIK HOEFFERLE, Špela, GAŠPIRC, Boris, LUKAČ, Matjaž, STOPAR, David. The evolution of cavitation in narrow soft-solid wedge geometry mimicking periodontal and peri-implant pockets. Ultrasonics sonochemistry. Mar. 2023, vol. 94, [article no.] 106329, str. 1-12, ilustr. ISSN 1350-4177. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S135041772300041X, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.ultsonch.2023.106329. [COBISS.SI-ID 141487619]

445. JEŠELNIK, Meta. Inaktivacija virusa Y krompirja v vodi s hidrodinamsko kavitacijo : magistrsko delo = Inactivation of potato virus Y in water by hydrodynamic cavitation : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [M. Ješelnik], 2023. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (IX, 40 str., [8] f. pril.)), ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 287. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 143639299]

446. MOLAN, Katja, MANDIĆ-MULEC, Ines, KRAPEŽ, Uroš, KUHAR, Urška, ZORMAN-ROJS, Olga, RAHMANI, Ramin, KRKLEC, Daniel, BROJAN, Miha, STOPAR, David. Inaktivacija virusov na virucidnih površinah in z dodanim surfaktinom. V: PETKOVIĆ, Hrvoje (ur.). Letno srečanje programske skupine Mikrobiologija in biotehnologija živil in okolja (P4-0116) : Biotehniška fakulteta, Univerza v Ljubljani, Slovenija, Ljubljana, 3. 2. 2023. Ljubljana: Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2023. Str. 7, ilustr. [COBISS.SI-ID 140981507]

447. MANDIĆ-MULEC, Ines, BELCIJAN PANDUR, Katarina, DANEVČIČ, Tjaša, DOGŠA, Iztok, KRAIGHER, Barbara, BLAZNIK, Mojca, PODNAR, Eli, STOPAR, David, ŠIMUNOVIĆ, Katarina, ŠTEFANIČ, Polonca. Intra and interspecies social behaviors by beneficial bacterium Bacillus subtilis. V: SEPČIĆ, Kristina (ur.), PAVŠIČ, Miha (ur.). 15th Meeting of the Slovenian Biochemical Society with International Participation = 15. srečanje Slovenskega biokemijskega društva z mednarodno udeležbo : book of abstracts = zbornik povzetkov : Portorož, 20-23 September 2023 = [20.–23. september 2023, Portorož, Slovenija]. Ljubljana: Slovenian Biochemical Society: = Slovensko biokemijsko društvo, 2023. Str. 20, l16. ISBN 978-961-95941-1-7. https://portoroz2023.sbd.si/upload/docs/SBD2023_Portoroz-Book_of_Abstracts.pdf. [COBISS.SI-ID 165940227]

448. BLAZNIK, Mojca, BELLICH, Barbara, RIZZO, Roberto, STOPAR, David, CESCUTTI, Paola, DOGŠA, Iztok. Isolation and characterization of extracellular polysaccharides in bacterium of Bacillus subtilis. V: SABOTIČ, Jerica (ur.), KLANČNIK, Anja (ur.). NMR in microbial glycobiology : mini symposium : book of abstracts : 24 January 2023 : [Jožef Stefan Institute, The Main Institute Lecture Hall, Jamova 39, Ljubljana]. Ljubljana: Biotechnical Faculty, 2023. Str. 8, ilustr. ISBN 978-961-6379-75-5. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=144102. [COBISS.SI-ID 142874115]

449. ŠTEFANIČ, Polonca, BELCIJAN PANDUR, Katarina, BLAZNIK, Mojca, ŠIMUNOVIĆ, Katarina, KRAIGHER, Barbara, STEINHOFF, Heiko, GRÜNBERGER, Alexander, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. Kin discrimination and cooperative behaviours in Bacillus subtilis. V: Bacell 2023 : abstract book : Kobe, Japan 20-23 November 2023. [Kobe: National BioResource Project], 2023. Str. 74. https://www.research.kobe-u.ac.jp/ans-applmic/BACELL/BACELL2023abstract%20book_FC2.pdf#Programme. [COBISS.SI-ID 177926659]

450. ŠTEFANIČ, Polonca, BLAZNIK, Mojca, ŠIMUNOVIĆ, Katarina, STEINHOFF, Heiko, GRÜNBERGER, Alexander, MANDIĆ-MULEC, Ines, STOPAR, David. Kin discrimination drives cooperative and antagonistic interactions during Bacillus subtilis pellicle formation. V: Bageco 2023 : programme : 16th Symposium on Bacterial Genetics and Ecology : 26 - 30 June, Copenhagen, Denmark. Copenhagen: CAP Partner, 2023. Str. 107, p21. https://bageco2023.org/wp-content/uploads/2023/06/CAP-Partner_Bageco2023_programme_A5_abstract-korr10.pdf. [COBISS.SI-ID 157988867]

451. ŠTEFANIČ, Polonca, BELCIJAN PANDUR, Katarina, BLAZNIK, Mojca, ŠIMUNOVIĆ, Katarina, KRAIGHER, Barbara, STEINHOFF, Heiko, GRÜNBERGER, Alexander, STOPAR, David, MANDIĆ-MULEC, Ines. Kin discrimination stabilizes cooperative behaviour during bacterial swarming and biofilm formation. V: Bacell Meeting 2023 : University of Hohenheim, 19-20 June 2023, Stuttgart-Hohenheim, Germany : program & abstracts. [Stuttgart: University of Hohenheim], 2023. Str. 48. [COBISS.SI-ID 179083523]

452. VOLK, Marko, MOLAN, Katja, TERLEP, Saša, ŠAVLI, Dominik, JEZERŠEK, Matija, LEVIČNIK HOEFFERLE, Špela, GAŠPIRC, Boris, LUKAČ, Matjaž, STOPAR, David. Lasersko odstranjevanje biofilmov iz obzobnih žepkov. V: PETKOVIĆ, Hrvoje (ur.). Letno srečanje programske skupine Mikrobiologija in biotehnologija živil in okolja (P4-0116) : Biotehniška fakulteta, Univerza v Ljubljani, Slovenija, Ljubljana, 3. 2. 2023. Ljubljana: Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2023. Str. 10, ilustr. [COBISS.SI-ID 140937731]

453. PETKOVIĆ, Hrvoje (glavni in odgovorni urednik, član uredniškega odbora). Letno srečanje programske skupine Mikrobiologija in biotehnologija živil in okolja (P4-0116) : Biotehniška fakulteta, Univerza v Ljubljani, Slovenija, Ljubljana, 3. 2. 2023. Ljubljana: Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2023. V, 25 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 140816643]

454. STOPAR, David, PLAZINSKI, Wojciech, PORRAS-DOMÍNGUEZ, Jaime Ricardo, DOGŠA, Iztok. Macromolecular properties of fructans. V: WIM, Van den Ende (ur.), ÖNER, Ebru Toksoy (ur.). The book of fructans. [London]: Elsevier, 2023. Str. 25-46, ilustr. ISBN 978-0-3238-5410-8. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/B9780323854108000053. [COBISS.SI-ID 147900675]

455. PANDUR, Žiga. Mehanizem delovanja kavitacijskih mehurčkov na bakterijsko celico : mladi mikrobiologi se predstavijo. Mikrobiolog.si. dec. 2023, letn. 3, št. 2, str. 23-24, ilustr. ISSN 2784-4463. https://nlzoh-my.sharepoint.com/:b:/g/personal/nejsto1_nlzoh_si/EaM_bSJzTBVIsP2fKUuv82sBpzxMCWsJavmAP2hZTg2OXw?e=4usIRu. [COBISS.SI-ID 191018243]

456. DANEVČIČ, Tjaša, MOLAN, Katja, STOPAR, David. Poročilo o "Določitvi ustreznega biocida za potrebe tretiranja hladilne vode v kondenzatorju" : naročnik NEK, Krško. Ljubljana: Biotehnična fakulteta, Oddelek za mikrobiologijo, 2023. 14 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 173880835]

457. DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Poročilo o spremljanju fizikalno-kemijskih in mikrobioloških parametrov v depozitoriju arheološkega mokrega lesa v ribniku na Verdu pri Vrhniki julij 2023 : naročnik Mestni muzej Ljubljana. Ljubljana: Biotehnična fakulteta, Oddelek za mikrobiologijo, Katedra za mikrobno ekologijo in fiziologijo, jul. 2023. 6 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 199071235]

458. KRAJNC, Tina. Protimikrobna aktivnost embalažnih folij s premazom hitozana in kombinacijo rastlinskih izvlečkov : magistrsko delo = Antimicrobial activity of packaging foils coated with chitosan and combination of plant extracts : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [T. Krajnc], 2023. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (XII, 61 str.)), ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 309. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 168884995]

459. BLAZNIK, Mojca, ŠTEFANIČ, Polonca, KOSTANJŠEK, Rok, MANDIĆ-MULEC, Ines, DOGŠA, Iztok, STOPAR, David. Sistemski pogled na razvoj pelikla pri bakteriji Bacillus subtilis. V: PETKOVIĆ, Hrvoje (ur.). Letno srečanje programske skupine Mikrobiologija in biotehnologija živil in okolja (P4-0116) : Biotehniška fakulteta, Univerza v Ljubljani, Slovenija, Ljubljana, 3. 2. 2023. Ljubljana: Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, Oddelek za živilstvo, 2023. Str. 8, ilustr. [COBISS.SI-ID 140842755]

460. PANDUR, Žiga, PENIČ, Samo, IGLIČ, Aleš, KRALJ-IGLIČ, Veronika, STOPAR, David, DRAB, Mitja. Surfactin molecules with a cone-like structure promote the formation of membrane domains with negative spontaneous curvature and induce membrane invaginations. Journal of colloid and interface science. Nov. 2023, vol. 650, part b, str. 1193-1200, ilustr. ISSN 0021-9797. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0021979723013061?via%3Dihub, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.jcis.2023.07.057. [COBISS.SI-ID 159013379]

461. PANDUR, Žiga, ZEVNIK, Jure, PODBEVŠEK, Darjan, STOJKOVIĆ, Biljana, STOPAR, David, DULAR, Matevž. Water treatment by cavitation : understanding it at a single bubble - bacterial cell level. Water research. Jun. 2023, vol. 236, str. 1-16, ilustr. ISSN 0043-1354. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0043135423003925, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.watres.2023.119956. [COBISS.SI-ID 151526915]

462. BLAZNIK, Mojca, STOPAR, David. B. subtilis biofilm as a cybernetic system. Frontiers in bacteriology : fbrio. Nov. 2024, vol. 3, [article no.] 1497132, str. 1-7, ilustr. ISSN 2813-6144. https://www.frontiersin.org/journals/bacteriology/articles/10.3389/fbrio.2024.1497132/full, DOI: 10.3389/fbrio.2024.1497132. [COBISS.SI-ID 214871555]

463. DOGŠA, Iztok, BELLICH, Barbara, BLAZNIK, Mojca, LAGATOLLA, Cristina, RAVENSCROFT, Neil, RIZZO, Roberto, STOPAR, David, CESCUTTI, Paola. Bacillus subtilis EpsA-O: a novel exopolysaccharide structure acting as an efficient adhesive in biofilms. npj biofilms and microbiomes. 2024, vol. 10, [article no.] 98, str. 1-17, ilustr. ISSN 2055-5008. https://www.nature.com/articles/s41522-024-00555-z, DOI: 10.1038/s41522-024-00555-z. [COBISS.SI-ID 207340035]

464. VOLK, Marko, MOLAN, Katja, ŠAVLI, Dominik, TERLEP, Saša, LEVIČNIK HOEFFERLE, Špela, GAŠPIRC, Boris, LUKAČ, Matjaž, JEZERŠEK, Matija, STOPAR, David. Biofilm removal from difficult-to-reach places via secondary cavitation within a constrained geometry mimicking a periodontal/peri-implant pocket. Ultrasonics sonochemistry. Mar. 2024, vol. 104, [article no.] 106832, str- 1-8, ilustr. ISSN 1350-4177. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.ultsonch.2024.106832. [COBISS.SI-ID 186706179]

465. ZEVNIK, Jure, PANDUR, Žiga, STOPAR, David, DULAR, Matevž. Cavitation bubble interaction with biological structures on a microscale : invited lecture at the Multiscale Investigation of Bubble-Cell Interaction Mechanisms for Enhanced Drug Delivery, October 2024, Paris, France. [COBISS.SI-ID 230871299]

466. ZEVNIK, Jure, PANDUR, Žiga, STOPAR, David, DULAR, Matevž. Cavitation bubble interaction with compliant structures on a microscale. V: ŠARLER, Božidar (ur.), VANOLI, Laura (ur.), DOBRAVEC, Tadej (ur.). Eurotherm 2024 : book of abstracts : 9th European Thermal Sciences Conference : 10-13 June 2024, Bled, Slovenia. Ljubljana: Faculty of Mechanical Engineering, 2024. Str. 261. ISBN 978-961-7187-08-3. https://eurotherm2024.si/images/Book_of_abstracts.pdf. [COBISS.SI-ID 200886531]

467. BLAZNIK, Mojca, FEI, Chenyi, KOŠMRLJ, Andrej, KALIN, Mitjan, STOPAR, David. Mechanical constraints to unbound expansion of B. subtilis on semi-solid surfaces. Microbiology spectrum. [Spletna izd.]. Jan. 2024, vol. 12, issue 1, str. 1-16, ilustr. ISSN 2165-0497. https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.02740-23, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1128/spectrum.02740-23. [COBISS.SI-ID 174209795]

468. ŠETINA, Barbara, ŽUŽEK, Borut, BURJA, Jaka, DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Microbiologically induced corrosion of power plant steel components. V: KRSTULOVIĆ, Nikša (ur.). Book of abstracts : 19th Joint Vacuum Conference & 30th International Scientific Meeting on Vacuum Science and Technique : 29. 9. - 4. 10. 2024, Podstrana, Croatia. Zagreb: Croatian Vacuum Society, cop. 2024. Str. 54, ilustr. ISBN 978-953-98154-5-3. https://jvc19.org/wp-content/uploads/files/Book_of_Abstracts_JVC-19_final.pdf. [COBISS.SI-ID 213631235]

469. KOSOVAC, Katarina. Odziv mikrobne združbe obalnega morskega ekosistema na množično pojavljanje in odmiranje invazivne vrste rebrače Mnemiopsis leidyi : magistrsko delo = The response of the microbial community to the mass occurrence and decay of the invasive ctenophore Mnemiopsis leidyi in the coastal ecosystem : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [K. Kosovac], 2024. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (XI, 52 str., [11] f. pril.)), ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 314. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 180115715]

470. VOLK, Marko, MOLAN, Katja, ŠAVLI, Dominik, JEZERŠEK, Matija, TERLEP, Saša, LEVIČNIK HOEFFERLE, Špela, LUKAČ, Matjaž, TROST, Mojca, GAŠPIRC, Boris, STOPAR, David. Optodinamsko odstranjevanje biofilmov v modelnih paradontalnih in periimplantnih žepih. V: KUŠAR, Darja (ur.), JAMNIKAR CIGLENEČKI, Urška (ur.). 9. kongres Slovenskega mikrobiološkega društva : knjiga povzetkov : 14.–16. februar 2024. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 2024. Str. 47. ISBN 978-961-96562-0-4. http://knjiznica.vf.uni-lj.si/PortalGenerator/Document.aspx?id=420. [COBISS.SI-ID 187247619]

471. DANEVČIČ, Tjaša, MOLAN, Katja, STOPAR, David. Poročilo o "Selektivnem testiranju mikrobiološke aktivnosti v oblogah depozita savske strani kondenzatorja" : naročnik NEK. Ljubljana: Biotehnična fakulteta, Oddelek za mikrobiologijo, Katedra za mikrobno ekologijo in fiziologijo, jun. 2024. 14 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 199017475]

472. DANEVČIČ, Tjaša, STOPAR, David. Poročilo o spremljanju fizikalno-kemijskih in mikrobioloških parametrov v depozitoriju arheološkega mokrega lesa v ribniku na Verdu pri Vrhniki april 2024 : naročnik Mestni muzej Ljubljana. Ljubljana: Biotehnična fakulteta, Oddelek za mikrobiologijo, Katedra za mikrobno ekologijo in fiziologijo, maj 2024. 7 str., ilustr. [COBISS.SI-ID 199070211]

473. BLAZNIK, Mojca, ŠIMUNOVIĆ, Katarina, MANDIĆ-MULEC, Ines, STOPAR, David, ŠTEFANIČ, Polonca. Sorodstveno razlikovanje v biofilmih pri bakteriji Bacillus subtilis. V: KUŠAR, Darja (ur.), JAMNIKAR CIGLENEČKI, Urška (ur.). 9. kongres Slovenskega mikrobiološkega društva : knjiga povzetkov : 14.–16. februar 2024. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 2024. Str. 45. ISBN 978-961-96562-0-4. https://smd2024.si/wp-content/uploads/2024/02/2024-02-12-knjiga-povzetkov-SMD_Compress.pdf. [COBISS.SI-ID 190103811]

474. STOPAR, David. SWEEPS®/SSP - assisted photoacoustic removal of bacteria from simulated dental pockets : lecture at LA&HA Symposium 2024, Ljubljana, Slovenia, May 27th 2024. https://ifw.fotona.com/program-practitioner. [COBISS.SI-ID 198301443]

475. BLAZNIK, Mojca, ŠTEFANIČ, Polonca, KOSTANJŠEK, Rok, MANDIĆ-MULEC, Ines, STOPAR, David, DOGŠA, Iztok (avtor, korespondenčni avtor). Understanding Bacillus subtilis pellicle formation from a holistic perspective. V: BELEC, Blaž (ur.), et al. 5. slovensko posvetovanje mikroskopistov : knjiga povzetkov : 16.-17. maj 2024, Rogla. 1. izd. Ljubljana: Slovensko društvo za mikroskopijo: = Slovene Society for Microscopy, 2024. Str. 39. ISBN 978-961-94264-3-2. https://www.mikroskopsko-drustvo.si/posvet/knjiga-povzetkov-book-of-abstracts/. [COBISS.SI-ID 230485251]

476. ŽUŽEK, Borut, ŠETINA, Barbara, BURJA, Jaka, STOPAR, David, DANEVČIČ, Tjaša. Vmesno poročilo o delu na projektu L2-50060 ˝Novo martenzitno nerjavno jeklo z izboljšano odpornostjo na mikrobiološko korozijo v sladki vodi za energetiko˝. Ljubljana: Inštitut za kovinske materiale in tehnologije, 2024. 1 spletni vir (1 datoteka PDF ([2], 18 str.)), ilustr. https://www.imt.si/specialna-knjiznica-imt. [COBISS.SI-ID 230257411]
projekt: Naročnik: HESS in NEK

477. MARGUČ, Sonja. Vpliv proteazne aktivnosti bakterij Pseudomonas na preživetje in rast patogenih bakterij, prenosljivih s hrano : magistrsko delo = The effect of Pseudomonas proteolytic activity on the survival and growth of foodborne pathogenic bacteria : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [S. Marguč], 2024. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (XII, 67 str., [1] f. pril.)), ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 318. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 189295619]

478. DOKL, Gašper. Vpliv različnih strategij formulacije bakteriofagov na njihovo stabilnost : magistrsko delo = The influence of different bacteriophage formulation strategies on their stability : M. Sc. Thesis. Ljubljana: [G. Dokl], 2024. 1 spletni vir (1 datoteka PDF (XII, 47 str., [3] f. pril.)), ilustr. Biotehniška fakulteta, Magistrski študijski program 2. stopnje Mikrobiologija, 342. Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL. [COBISS.SI-ID 219138307]

479. ŠTEFANIČ, Polonca, MRŠOL, Manca, STARE, Eva, BELCIJAN PANDUR, Katarina, KRAIGHER, Barbara, BLAZNIK, Mojca, ŠIMUNOVIĆ, Katarina, STOPAR, David, DA ROCHA, Ulisses Nunes, MANDIĆ-MULEC, Ines. Vzroki in posledice sorodstvenega razlikovanja pri bakteriji Bacillus subtilis. V: KUŠAR, Darja (ur.), JAMNIKAR CIGLENEČKI, Urška (ur.). 9. kongres Slovenskega mikrobiološkega društva : knjiga povzetkov : 14.–16. februar 2024. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 2024. Str. 34. ISBN 978-961-96562-0-4. https://smd2024.si/wp-content/uploads/2024/02/2024-02-12-knjiga-povzetkov-SMD_Compress.pdf. [COBISS.SI-ID 190112771]

480. MOLAN, Katja, DANEVČIČ, Tjaša, VOLK, Marko, STOPAR, David, ŠETINA, Barbara. Antibacterial surfaces using bacteriophages: a proof-of-concept. V: DRAGOŠ, Anna (ur.), VESEL, Nina (ur.). Second Slovenian Bacteriophage Meeting : book of abstracts : 23th [i. e. 23rd] of January 2025, Ljubljana, Slovenia. Ljubljana: Biotechnical Faculty, 2025. Str. 21. ISBN 978-961-6379-92-2. https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=167701. [COBISS.SI-ID 229277699]

481. VOLK, Marko, ŠAVLI, Dominik, MOLAN, Katja, TERLEP, Saša, LEVIČNIK HOEFFERLE, Špela, TROST, Mojca, GAŠPIRC, Boris, LUKAČ, Matjaž, JEZERŠEK, Matija, STOPAR, David. Er:YAG laser biofilm removal from zero-gap periodontal/peri-implant model system mimicking clinical attachment loss. Journal of biomedical optics. Feb. 2025, vol. 30, issue 2, str. 025002-1-025002-11, ilustr. ISSN 1083-3668. DOI: 10.1117/1.JBO.30.2.025002. [COBISS.SI-ID 228534787]

482. BLAZNIK, Mojca, VOLK, Marko, KRAIGHER, Barbara, MANDIĆ-MULEC, Ines, STOPAR, David, DOGŠA, Iztok. Razumevanje strukture biofilmov za racionalno rabo antibiotikov. V: DROBNE, Damjana (ur.), et al. BFestival 2025 : biotehnologija in trajnostni razvoj : predstavitev raziskovalnih dosežkov Biotehniške fakultete. Ljubljana: Univerza v Ljubljani, Biotehniška fakulteta, 2025. Str. 15. https://www.bf.uni-lj.si/mma/Zbornik_BFestival_2025.pdf/2025013112445696/?m=1738323896. [COBISS.SI-ID 226192387]

David Stopar

Osebna bibliografija za obdobje 1992-2025

1992

1993

1994

1995

1996

1997

1998

1999

2000

2001

2002

2003

2004

2005

2006

2007

2008

2009

2010

2011

2012

2013

2014

2015

2016

2017

2018

2019

2020

2021

2022

2023

2024

2025